基于克隆选择算法蛋白质联系图预测的研究
| 第一章 引言 | 第1-12页 |
| ·蛋白质结构预测的意义 | 第7-10页 |
| ·蛋白质联系图 | 第10-11页 |
| ·人工免疫系统 | 第11页 |
| ·本文的主要工作 | 第11-12页 |
| 第二章 蛋白质结构预测 | 第12-25页 |
| ·生物信息学简介 | 第12-13页 |
| ·关于蛋白质的基本概念 | 第13-15页 |
| ·蛋白质的组成要素——氨基酸 | 第13-15页 |
| ·疏水作用 | 第15页 |
| ·蛋白质的结构层次划分 | 第15-19页 |
| ·一级结构 | 第15页 |
| ·二级结构 | 第15-18页 |
| ·三级结构 | 第18页 |
| ·四级结构 | 第18-19页 |
| ·蛋白质二级结构预测 | 第19-20页 |
| ·二级结构预测原理 | 第19-20页 |
| ·Chou-Fasman 算法 | 第20页 |
| ·蛋白质三级结构预测 | 第20-22页 |
| ·从头预测方法 | 第20-21页 |
| ·基于经验的方法 | 第21-22页 |
| ·现有预测方法存在的问题 | 第22页 |
| ·蛋白质联系图预测 | 第22-25页 |
| ·蛋白质联系图定义 | 第22-23页 |
| ·蛋白质联系图中包含的信息 | 第23-24页 |
| ·蛋白质联系图预测的现状 | 第24-25页 |
| 第三章 人工免疫系统 | 第25-31页 |
| ·生物体免疫系统介绍 | 第25-26页 |
| ·什么是免疫系统 | 第25页 |
| ·免疫系统分类 | 第25页 |
| ·免疫学基本概念 | 第25-26页 |
| ·免疫系统的工作原理 | 第26-28页 |
| ·抗原识别 | 第26-27页 |
| ·初次免疫应答 | 第27页 |
| ·克隆选择过程 | 第27页 |
| ·二次免疫应答 | 第27-28页 |
| ·人工免疫系统 | 第28-31页 |
| ·克隆选择算法原理 | 第28页 |
| ·克隆选择算法流程 | 第28-29页 |
| ·克隆选择算法优点 | 第29-31页 |
| 第四章 基于克隆选择算法的蛋白质联系图预测 | 第31-49页 |
| ·算法主要思想 | 第31页 |
| ·算法特点 | 第31-32页 |
| ·算法输入输出 | 第32-34页 |
| ·原始数据获取 | 第32页 |
| ·测试数据提取 | 第32-33页 |
| ·数据结构设置 | 第33-34页 |
| ·预测流程 | 第34-42页 |
| ·依据二级结构倾向初始化折叠核心 | 第34-35页 |
| ·构造适应度函数 | 第35-40页 |
| ·克隆选择过程 | 第40-41页 |
| ·多链蛋白质预测 | 第41-42页 |
| ·测试及结果评价 | 第42-49页 |
| ·结果评价函数 | 第42页 |
| ·主要参数分析 | 第42-45页 |
| ·测试结果 | 第45-48页 |
| ·运行效率 | 第48-49页 |
| 第五章 结论与展望 | 第49-51页 |
| ·总结 | 第49-50页 |
| ·关于本文使用的算法 | 第49页 |
| ·算法的创新性 | 第49页 |
| ·存在的问题 | 第49-50页 |
| ·未来工作展望 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-55页 |
| 附录 | 第55-57页 |
| 硕士期间发表论文 | 第57-58页 |
| 中文摘要 | 第58-60页 |
| Abstract | 第60-63页 |
| 致谢 | 第63页 |
