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柿SSR富集DNA文库构建与筛选

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-8页
第一章 文献综述第8-17页
   ·分子标记的产生、发展及分类第8页
   ·常用分子标记技术在园艺作物上的应用进展第8-12页
     ·RFLP标记第8-9页
     ·RAPD标记与SCAR标记第9-10页
     ·AFLP标记第10页
     ·SSR标记第10-11页
     ·ISSR标记第11-12页
   ·SSR标记技术的研究进展第12-16页
     ·SSR的发现及分类第12页
     ·SSR及各重复单元在植物中的发生频率第12-13页
     ·传统的SSR标记开发策略第13-14页
       ·基因组文库构建第13页
       ·阳性克隆筛选第13页
       ·测序及引物设计第13页
       ·SSR—PCR扩增检测第13-14页
     ·采取富集步骤的SSR标记开发策略第14-16页
       ·基于RAPD的开发策略第14页
       ·基于ISSR-PCR的SSR分离策略第14-15页
       ·基于引物延伸的SSR分离策略第15页
       ·利用选择杂交进行SSR分离第15-16页
       ·公共数据库搜索进行引物设计第16页
   ·本研究的目的与意义第16-17页
第二章 材料与方法第17-29页
   ·材料第17页
     ·植物材料第17页
     ·Vector和菌株第17页
     ·主要试剂第17页
     ·主要仪器设备第17页
   ·方法第17-29页
     ·基因组DNA的提取与纯化──改良的CTAB法第17-20页
     ·DNA样品浓度、纯度的测定第20页
     ·基因组DNA样品限制性内切酶的消化和检测第20-21页
     ·基因组DNA样品的限制性酶切、DNA片段与接头的连接及预扩增第21-22页
     ·DNA片段(2000-1000bp)从脂琼糖凝胶的分离、纯化第22页
     ·微卫星DNA片段的杂交筛选(Hybridization)及目标片段的克隆第22-24页
     ·富集的、假定为微卫星(SSR)AFLP片段的PCR克隆第24页
     ·AFLP目标DNA片段与Vector的连接(T-A克隆)第24-25页
     ·转化第25页
     ·建库及筛库第25-27页
     ·重组质粒DNA提取、纯化第27页
     ·重组质粒DNA的酶切鉴定第27-28页
     ·克隆产物的测序第28页
     ·测序结果分析第28-29页
第三章 结果与分析第29-33页
   ·柿基因组总DNA的提取与质量检测第29页
   ·基因组DNA的酶切检测第29-30页
   ·基因组总DNA的酶切、接头连接、AFLP的扩增结果第30页
   ·DNA片段扩增产物的回收与克隆第30页
   ·SSR探针与DNA片段杂交、磁珠回收杂交复合物的结果分析第30页
   ·SSR富集DNA片段与Vector的连接、重组子向大肠杆菌细胞的转化结果分析第30-31页
   ·SSR富集DNA文库的构建及筛选第31-32页
   ·阳性克隆质粒DNA提取及酶切检测第32-33页
第四章 讨论第33-35页
   ·影响柿基因组DNA提取质量的因素第33页
   ·影响微卫星探针(Oligo Probe)杂交效率的因素第33页
   ·方法的可靠性第33-35页
致谢第35-36页
参考文献第36-42页
作者简介第42-43页
附录第43-49页

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