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家蚕分子图谱的构建及茧质性状的QTL定位研究

中文摘要第1-16页
英文摘要第16-23页
第一章 文献综述第23-44页
 1.1 遗传图谱的研究现状第23-25页
  1.1.1 遗传图谱的研究意义第23页
  1.1.2 遗传图谱的种类第23-24页
   1.1.2.1 实验遗传图第23-24页
   1.1.2.2 细胞遗传图第24页
   1.1.2.3 分子遗传图第24页
  1.1.3 家蚕遗传图谱的早期研究第24-25页
 1.2 分子遗传标记技术的产生及其特点第25-27页
  1.2.1 表型标记第25页
   1.2.1.1 形态标记第25页
   1.2.1.2 同工酶标记第25页
  1.2.2 分子遗传标记第25-27页
   1.2.2.1 RFLP标记第26页
   1.2.2.2 RAPD标记第26页
   1.2.2.3 AFLP标记第26-27页
   1.2.2.4 其它分子标记第27页
 1.3 分子连锁图谱构建的研究进展第27-33页
  1.3.1 影响分子连锁图谱作图效果的因素第27-29页
   1.3.1.1 亲本和分离群体类型的选择第27-28页
   1.3.1.2 家蚕作图群体大小第28-29页
   1.3.1.3 交换值与作图的关系第29页
   1.3.1.4 标记数与图谱的饱和度第29页
  1.3.2 动植物分子连锁图谱的构建第29-30页
  1.3.3 家蚕分子连锁图的研究第30-32页
   1.3.3.1 家蚕RFLP分子连锁图第31页
   1.3.3.2 家蚕RAPD分子连锁图第31-32页
   1.3.3.3 家蚕SADF和AFLP分子连锁图第32页
   1.3.3.4 其它分子标记在蚕业科学研究的发展趋势第32页
  1.3.4 分子连锁图谱在比较基因组作图中的应用第32-33页
  1.3.5 连锁图谱在分子标记辅助育种中的应用第33页
 1.4 QTL定位技术及其应用第33-36页
  1.4.1 QTL定位技术的产生和发展第33-34页
  1.4.2 其它动植物数量性状基因定位研究现状第34-35页
  1.4.3 家蚕QTL研究进展第35-36页
 1.5 家蚕分子育种技术的产生与发展第36-44页
  1.5.1 家蚕育种技术发展第36-37页
  1.5.2 家蚕分子育种育种技术的产生第37页
  1.5.3 家蚕分子标记辅助选择育种第37-39页
   1.5.3.1 DNA标记回交辅助选择育种第37-38页
   1.5.3.2 DNA杂交辅助育种第38页
   1.5.3.3 DNA标记辅助抗性育种第38-39页
  1.5.4 分子标记在杂种优势预测上的应用第39-44页
   1.5.4.1 基因多态性与杂种优势第40页
   1.5.4.2 DNA分子标记差异性与杂种优势第40-41页
   1.5.4.3 mRNA差异显示与杂种优势第41页
   1.5.4.4 基因网络系统与杂种优势第41-42页
   1.5.4.5 分子标记与杂种优势研究展望第42页
   1.5.4.6 利用分子标记进行家蚕杂种优势预测的设想第42-44页
第二章 引言第44-49页
第三章 家蚕高密度AFLP分子连锁图谱的构建第49-78页
 3.1 材料和方法第49-55页
  3.1.1 材料第49页
  3.1.2 主要试剂第49页
  3.1.3 作图软件第49页
  3.1.4 主要仪器与设备第49-50页
  3.1.5 基因组DNA的制备第50页
  3.1.6 基因组DNA的酶切与连接第50-51页
   3.1.6.1 酶切第50页
   3.1.6.2 接头第50-51页
   3.1.6.3 连接第51页
  3.1.7 酶切片段的扩增第51-53页
   3.1.7.1 预扩增第51页
   3.1.7.2 二次扩增第51-53页
  3.1.8 扩增产物的测序胶电泳分析第53页
  3.1.9 连锁数据的统计与分析第53页
   3.1.9.1 分子标记数据的统计第53页
   3.1.9.2 连锁分析及家蚕AFLP连锁图谱的构建第53页
  3.1.10 不同群体的抽样及其建立第53-54页
  3.1.11 不同标记数的抽样第54-55页
 3.2 结果与分析第55-72页
  3.2.1 高质量家蚕基因组DNA的提取第55页
  3.2.2 扩增产物的凝胶检测第55-56页
  3.2.3 家蚕AFLP分子标记的重复性第56-57页
  3.2.4 AFLP标记的多态性分布第57-59页
  3.2.5 家蚕AFLP分子遗传图谱的构建第59-60页
  3.2.6 家蚕AFLP标记图谱第60-64页
  3.2.7 本研究构建的分子连锁图谱对QTL定位的作用第64页
  3.2.8 现行家蚕遗传图谱的比较第64-65页
  3.2.9 群体大小与作图效果第65-71页
   3.2.9.1 不同群体大小在相同交换值条件下的分群差异第65-67页
   3.2.9.2 各类群体a亚群不同交换值的分群效果第67-68页
   3.2.9.3 各类群体b亚群不同交换值的分群效果第68-70页
   3.2.9.4 不同群体的作图效果第70-71页
  3.2.10 相同群体不同标记数的作图比较第71-72页
 3.3 讨论第72-78页
  3.3.1 作图群体的建立第72-74页
   3.3.1.1 亲本和分离群体类型的选择第72页
   3.3.1.2 作图群体大小的确定第72-73页
   3.3.1.3 交换值和标记数与作图的关系第73-74页
  3.3.2 标记数与图谱的饱和度第74-75页
  3.3.3 限制性内切酶的选择第75页
  3.3.4 家蚕遗传图谱的比较第75-76页
  3.3.5 家蚕遗传图谱的整合及对未来工作的思考第76-78页
第四章 家蚕茧质性状的QTL定位第78-112页
 4.1 材料与方法第78-79页
  4.1.1 F2分离群体的建立和F2的分离群体数量性状的获得第78页
  4.1.2 AFLP分子标记的获得第78-79页
  4.1.3 QTL定位分析第79页
   4.1.3.1 家蚕茧质性状的性别效应第79页
   4.1.3.2 QTL分析方法第79页
 4.2 结果与分析第79-106页
  4.2.1 全茧量、茧层量、茧层率性状的性别效应估算第79-81页
  4.2.2 全茧量、茧层量、茧层率性状的分布规律第81-85页
   4.2.2.1 全茧量、茧层量、茧层率和蛹体重等性状性别调整前后的差异第81-84页
   4.2.2.2 性别效应作用下全茧量、茧层量、茧层率、蛹体重等性状的分布特征第84-85页
   4.2.2.3 性别效应校正后全茧量、茧层量、茧层率性状的分布特征第85页
  4.2.3 F2群体及分子连锁图谱的特征第85-86页
  4.2.4 家蚕全茧量、茧层量、茧层率和蛹体重等性状的QTL定位分析第86-93页
   4.2.4.1 家蚕全茧量、茧层量性状的QTL定位分析第86-91页
   4.2.4.2 家蚕茧层率、蛹体重性状的QTL定位分析第91-93页
  4.2.5 被检测到的家蚕茧质和蛹体重等性状的QTL数目及其在染色体上的分布第93-96页
  4.2.6 QTL的效应及其显著性与贡献率的关系第96-99页
  4.2.7 同一群体不同标记数的QTL定位比较第99-106页
   4.2.7.1 542个总标记的QTL定位结果第100-102页
   4.2.7.2 392个总标记的QTL定位结果第102-105页
   4.2.7.3 不同标记数的QTL定位结果比较第105-106页
 4.3 讨论第106-112页
  4.3.1 家蚕全茧量、茧层量、茧层率和蛹体重性状的性别效应第106页
  4.3.2 QTL作图的显著性域值第106-107页
  4.3.3 QTL的确认第107页
  4.3.4 QTL的遗传主效应及其上位性估计第107-108页
  4.3.5 QTL效应及其显著性与贡献率第108-109页
  4.3.6 不同标记数的QTL定位差异第109页
  4.3.7 QTL作图的研究成果在遗传育种上的应用前景第109-112页
   4.3.7.1 指导遗传育种实践第109-110页
   4.3.7.2 QTL的克隆第110页
   4.3.7.3 标记辅助选择第110-112页
第五章 家蚕近交系后代分子标记的传递规律及其DNA多态性第112-134页
 5.1 材料与方法第112-115页
  5.1.1 试验用蚕品种第112页
  5.1.2 亲本间的杂交及杂交后代的选择与选配第112-113页
  5.1.3 近交系各代供DNA分析的材料的准备第113页
  5.1.4 蚕蛾DNA的抽提第113页
   5.1.4.1 蚕蛾DNA的方法第113页
   5.1.4.2 蚕蛾DNA的质量和RAPD检测第113页
  5.1.5 AFLP分子标记的获得第113-114页
  5.1.6 各近交系的DNA多态性及其聚类分析第114-115页
 5.2 结果与分析第115-131页
  5.2.1 近交系定向选择的效果第115-117页
  5.2.2 近交系各代茧质性状的方差及其近交纯合性分析第117-120页
  5.2.3 各近交系的遗传距离第120-122页
  5.2.4 各近交系DNA水平上的聚类分析第122-124页
  5.2.5 不同近交选育系各选育各代的DNA多态性比较第124-127页
  5.2.6 近交系各代分子标记的分布特征第127-128页
  5.2.7 蚕蛾DNA的抽提效果第128-131页
   5.2.7.1 蚕蛾基因组DNA的浓度和纯度分析第128-129页
   5.2.7.2 蚕蛾基因组DNA的PCR及RAPD检测第129页
   5.2.7.3 蚕蛾基因组的有效提取在家蚕育种上的意义第129-131页
 5.3 讨论第131-134页
  5.3.1 定向歧化选择各近交系的遗传表现第131页
  5.3.2 近交系各代纯合性分析第131-132页
  5.3.3 亲本及其杂交后代的DNA差异第132页
  5.3.4 分子标记近交系各代的分布第132-133页
  5.3.5 蚕卵DNA的抽提效果在家蚕育种上的意义第133-134页
第六章 结论第134-137页
参考文献第137-145页
攻读博士学位期间发表的论文和参加的课题第145-146页
英文缩写第146-147页
致谢第147页

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