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应用微卫星DNA标记进行东北虎亲子鉴定和遗传多样性研究

中文摘要第1-7页
英文摘要第7-9页
论文缩略词表第9-10页
前言第10-21页
 1 动物遗传多样性研究进展第11-15页
  1.1 概述第11页
  1.2 动物遗传多样性的丧失第11-12页
  1.3 遗传多样性的检测第12-13页
   1.3.1 染色体的多样性第12页
   1.3.2 蛋白质的多样性第12页
   1.3.3 线粒体DNA的多样性第12-13页
   1.3.4 核DNA的多样性第13页
  1.4 遗传多样性的保护第13-15页
 2 微卫星标记及在动物遗传多样性研究中的应用第15-20页
  2.1 微卫星标记的结构和遗传特性第15-16页
  2.2 微卫星DNA位点的获得第16-17页
  2.3 微卫星DNA分析的一般步骤第17页
   2.3.1 DNA的提取第17页
   2.3.2 PCR扩增第17页
   2.3.3 扩增产物及大小检测第17页
   2.3.4 数据分析第17页
  2.4 生物芯片与微卫星技术第17-18页
  2.5 微卫星标记的应用第18-20页
   2.5.1 构建遗传连锁图谱第18页
   2.5.2 标记辅助选择育种第18-19页
   2.5.3 进行种群遗传多样性研究第19页
   2.5.4 进行亲子鉴定和建立遗传谱系第19-20页
 3 本研究的目的和内容第20-21页
材料和方法第21-29页
 1 材料第21-24页
  1.1 实验材料来源和背景第21-22页
  1.2 主要试剂的购置和配制第22-23页
  1.3 主要仪器设备第23页
  1.4 微卫星引物第23-24页
 2 方法第24-29页
  2.1 基因组DNA的提取第24页
   2.1.1 毛发DNA的提取第24页
   2.1.2 组织DNA的提取第24页
   2.1.3 液DNA的提取第24页
  2.2 PCR扩增及微卫星位点的筛选第24-25页
  2.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染第25页
   2.3.1 8%聚丙烯酰胺凝胶的制备及电泳第25页
   2.3.2 凝胶银染第25页
  2.4 PCR扩增产物分子片段大小的确定第25页
  2.5 PCR产物的检测第25-27页
   2.5.1 微卫星片段的回收及再扩增第25页
   2.5.2 微卫星片段的纯化第25-26页
   2.5.3 纯化片段与pGEM-T Easy载体连接第26页
   2.5.4 感受态细胞的制备第26页
   2.5.5 连接产物转化第26页
   2.5.6 阳性克隆的鉴定第26-27页
  2.6 数据统计分析第27-29页
   2.6.1 等位基因频率第27页
   2.6.2 亲子鉴定第27页
   2.6.3 非父排除概率第27-28页
   2.6.4 基因杂合度第28页
   2.6.5 多态信息含量第28页
   2.6.6 有效等位基因数第28页
   2.6.7 种群分析第28-29页
结果第29-40页
 1 微卫星位点的筛选第29页
 2 微卫星引物的扩增结果第29-30页
 3 微卫星扩增产物的检测第30页
 4 微卫星位点的等位基因频率第30-31页
 5 亲子鉴定第31-33页
 6 非父排除概率第33页
 7 基因杂合度第33页
 8 多态信息含量第33页
 9 有效等位基因数第33-35页
 10 种群分析第35-40页
  10.1 个体的近交系数第35-37页
  10.2 种群的出生率、成活率、年平均近交系数第37-39页
  10.3 建群者贡献第39-40页
讨论第40-46页
 1 微卫星的多态性和保守性第40页
 2 微卫星与亲子鉴定第40-41页
 3 微卫星和遗传多样性第41页
 4 微卫星与非损伤性DNA分析法第41-42页
 5 微卫星研究中存在的一些问题第42-44页
  5.1 微卫星片段大小的测定第42页
  5.2 微卫星位点的数目第42-43页
  5.3 微卫星自身某些特性的影响第43-44页
 6 饲养东北虎的种群评价第44-46页
  6.1 饲养种群的背景第44页
  6.2 饲养种群的现状第44页
  6.3 保持种群遗传多样性的原则与方法的探讨第44-46页
小结第46-47页
参考文献第47-53页
表5 东北虎的10个微卫星位点等位基因分布第53-59页
附图A 微卫星位点的部分扩增结果第59-64页
附录A 横道河子东北虎谱系记录第64-66页
附录B 东北虎林园繁殖情况记录第66-68页
致谢第68-69页
作者简历第69页

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