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昆虫烟碱乙酰胆碱受体及乙酰氨基已糖苷酶靶标特性的理论研究

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
第1章 前言第11-35页
   ·农药的发展史第11-13页
   ·农药研究的现状第13-16页
     ·化学农药与生物农药之争第13-14页
     ·化学农药的现状与前景第14-15页
     ·农药研发的趋势第15-16页
   ·杀虫剂研发中的重要靶标第16-26页
     ·烟碱乙酰胆碱受体(nAChR)第16-25页
       ·nAChR受体的结构第19-20页
       ·昆虫的nAChR受体第20-21页
       ·新烟碱类杀虫剂的结构及作用机制第21-24页
       ·新烟碱类杀虫剂的研究中的问题第24-25页
     ·乙酰氨基己糖苷酶(Hexs)第25-26页
   ·本研究工作的指导思想和主要内容第26-27页
   ·理论方法综述第27-35页
     ·量子化学第27-28页
     ·分子对接及分子动力学第28-30页
     ·比较模建第30-31页
     ·MOBILE模建法第31-32页
     ·生物信息学第32-35页
第2章 脊椎动物与昆虫nAChR基因家族的生物信息学研究:从序列到结构/功能异同第35-54页
   ·nAChR及其基因家族概述第35-38页
   ·研究目的第38页
   ·计算方法第38-40页
     ·序列采集第38页
     ·序列比对与进化树构建第38-39页
     ·聚类分析第39页
     ·功能歧化位点分析第39-40页
   ·结果与讨论第40-53页
     ·nAChR的进化与分类第40-44页
     ·nAChR亚基基因的聚类分析第44-45页
     ·脊椎动物与昆虫nAChR亚基的对应关系第45-46页
     ·功能歧化分析第46-53页
   ·本章小结第53-54页
第3章 新烟碱类杀虫剂作用方式的理论研究第54-66页
   ·研究背景第54-55页
   ·模型与方法第55-58页
     ·模型建立第55-57页
     ·计算方法第57-58页
       ·复合物几何结构的确定第57页
       ·能量及电荷计算第57-58页
   ·结果与讨论第58-64页
     ·结构简化的合理性第58页
     ·几何参数第58-59页
     ·相互作用能分析第59-61页
     ·Gua对复合体3MI-M_x相互作用的影响第61-62页
     ·电荷布居分析第62页
     ·新烟碱分子与昆虫nAChR受体的结合模式第62-63页
     ·新烟碱分子与昆虫nAChR受体的结合模式与晶体结构的比较第63-64页
   ·本章小结第64-66页
第4章 西方蜜蜂(Apis mellifera)及褐飞虱(Nilaparvata lugens)的nAChR受体结构及其与新烟碱类化合物的结合第66-75页
   ·研究背景第66-67页
   ·研究方法第67页
     ·比较模建第67页
     ·分子对接与动力学模拟第67页
   ·结果与讨论第67-73页
     ·蜜蜂及褐飞虱亚基组合方式的推测第67-69页
     ·蜜蜂及褐飞虱nAChR亚基两聚体的结构第69-72页
     ·蜜蜂及褐飞虱nAChR与新烟碱类杀虫剂的结合模式第72-73页
   ·本章小结第73-75页
第5章 亚洲玉米螟β-N-1,4-乙酰氨基己糖苷酶(β-N-1,4-acetylhexosaminidase,Chitobiase)的三维结构、结合模式研究第75-94页
   ·研究综述第75-76页
     ·几丁质与几丁质水解酶(β-N-1.4-乙酰氨基己糖苷酶)的研究概况第75-76页
       ·几丁质的发现、分布及结构第75-76页
     ·β-N-1,4-乙酰氨基己糖苷酶第76页
   ·计算流程第76-81页
     ·序列分析、模板选择及序列比对第76-77页
     ·比较模建第77-78页
     ·分子对接第78-79页
     ·分子对接结果与分析第79-81页
     ·二次模建过程第81页
   ·结果与讨论第81-91页
     ·OfHex1的三维结构第81-82页
     ·二硫键模式分析第82-83页
     ·OfHex1的催化口袋第83-84页
       ·diNAG与OfHex1的结合模式第83-84页
       ·2-ADN与OfHex1的结合模式第84页
       ·Allosamidin与OfHex1的结合模式第84页
     ·OfHex1与其它Hexs的结构差异第84-87页
     ·Allosamidin的多靶点特性第87-91页
   ·模建结构与晶体实验结果比较第91-92页
   ·本章小结第92-94页
第6章 结论第94-96页
参考文献第96-104页
致谢第104-105页
附录Ⅰ 攻读博士学位期间(待)发表的论文第105-106页
附录Ⅱ 第3章中使用的nAChR序列第106-109页

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