| 中文摘要 | 第1-4页 |
| 英文摘要 | 第4-8页 |
| 前言 | 第8-18页 |
| ·流感病毒基本情况 | 第8-12页 |
| ·甲型流感病毒NS1蛋白概况 | 第12-14页 |
| ·研究目的和研究内容 | 第14-18页 |
| 第一章 数据的采集和预处理 | 第18-23页 |
| ·数据来源 | 第18-20页 |
| ·资料的预处理 | 第20-21页 |
| ·序列对齐 | 第20页 |
| ·序列辅助信息的获取 | 第20-21页 |
| ·讨论和小结 | 第21-23页 |
| ·样本中重复序列的问题 | 第21页 |
| ·分析用数据对中国的代表性 | 第21-22页 |
| ·HI筛检实验对样本代表性的影响 | 第22页 |
| ·小结 | 第22-23页 |
| 第二章 人H3N2流感病毒NS1序列变异规律 | 第23-30页 |
| ·序列变异规律分析的方法和原理 | 第23-25页 |
| ·二步聚类分析基本内容 | 第23-25页 |
| ·分析结果 | 第25-28页 |
| ·类别划分结果 | 第25-26页 |
| ·类别特征描述 | 第26-28页 |
| ·讨论和小结 | 第28-30页 |
| ·聚类分析的作用 | 第28页 |
| ·类似方法学的参考 | 第28-29页 |
| ·小结 | 第29-30页 |
| 第三章 人H3N2流感病毒NS1序列进化树分析 | 第30-39页 |
| ·进化树分析的方法 | 第30-32页 |
| ·距离建树方法 | 第30-31页 |
| ·字符串建树方法 | 第31页 |
| ·Neighbor-Joining Method邻接距离建树法 | 第31页 |
| ·Maximum Parsimony最大简约建树法 | 第31-32页 |
| ·分析结果 | 第32-36页 |
| ·讨论和小结 | 第36-39页 |
| ·计划免疫对流感变异和流行的影响 | 第36页 |
| ·猪宿主在NS1基因变异过程中的作用 | 第36-37页 |
| ·中国地区在H3N2/NS1变异中的作用 | 第37-39页 |
| 第四章 进化主干中正向选择位点的检验 | 第39-46页 |
| ·方法和问题 | 第39-41页 |
| ·正向选择位点的现实意义 | 第39-40页 |
| ·氨基酸正向选择分析模型 | 第40-41页 |
| ·正选择位点的鉴定 | 第41页 |
| ·分析结果 | 第41-42页 |
| ·讨论和小结 | 第42-46页 |
| ·统计模型的局限性 | 第42-44页 |
| ·正选择作用的基因 | 第44-45页 |
| ·小结 | 第45-46页 |
| 第五章 研究总结 | 第46-48页 |
| ·主要的研究内容和结论 | 第46-47页 |
| ·下一步研究的方向 | 第47-48页 |
| ·流感病毒其余亚型序列变异规律的分析 | 第47页 |
| ·病毒变异方向的预测 | 第47页 |
| ·病毒跨宿主传播规律的深入分析 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |
| 附录: 在读期间发表的主要论文 | 第67-68页 |