| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5页 |
| 1 前言 | 第8-16页 |
| 1.1 线粒体概述 | 第8-9页 |
| 1.2 线粒体基因组 | 第9-10页 |
| 1.3 合成基因组学 | 第10-13页 |
| 1.4 酿酒酵母线粒体基因组 | 第13页 |
| 1.5 立题背景及意义 | 第13-14页 |
| 1.6 主要研究内容 | 第14-15页 |
| 1.7 技术路线 | 第15-16页 |
| 2 材料与方法 | 第16-26页 |
| 2.1 实验材料 | 第16-20页 |
| 2.1.1 菌种 | 第16页 |
| 2.1.2 试剂 | 第16-17页 |
| 2.1.3 主要仪器和设备 | 第17-18页 |
| 2.1.4 主要培养基 | 第18-19页 |
| 2.1.5 主要试剂 | 第19-20页 |
| 2.2 实验方法 | 第20-26页 |
| 2.2.1 酵母高拷贝线粒体细胞的培养 | 第20页 |
| 2.2.2 酵母线粒体提取 | 第20-21页 |
| 2.2.3 酵母线粒体基因组提取 | 第21页 |
| 2.2.4 酵母线粒体基因组的测序拼接注释 | 第21-22页 |
| 2.2.5 基因的相似性分析及进化树的构建 | 第22页 |
| 2.2.6 酵母线粒体基因组组成及占比的分析 | 第22-23页 |
| 2.2.7 基因间区段和酵母基因组大小相关性分析 | 第23页 |
| 2.2.8 基因间区段的组成分析 | 第23页 |
| 2.2.9 GC簇分析 | 第23页 |
| 2.2.10 内含子的分析 | 第23页 |
| 2.2.11 最小线粒体基因组的设计 | 第23-24页 |
| 2.2.12 rho0细胞的制备 | 第24页 |
| 2.2.13 Gibson组装 | 第24页 |
| 2.2.14 Phusion Polymerase高保真DNA聚合酶PCR体系 | 第24-26页 |
| 3 结果与讨论 | 第26-50页 |
| 3.1 酵母线粒体基因组的测序 | 第26-32页 |
| 3.1.1 酵母线粒体基因组的提取 | 第26-32页 |
| 3.2 酵母属相关线粒体基因组的获得及进化树的构建 | 第32-34页 |
| 3.2.1 酵母属相关线粒体基因组的获得 | 第32-33页 |
| 3.2.2 线粒体基因的相似性比较 | 第33页 |
| 3.2.3 进化树的构建 | 第33-34页 |
| 3.3 酵母线粒体基因组的分析 | 第34-45页 |
| 3.3.1 酵母线粒体基因组的组成及占比 | 第34-36页 |
| 3.3.2 基因间区段对酵母线粒体基因组的影响 | 第36-38页 |
| 3.3.3 线粒体基因组GC簇的分析 | 第38-39页 |
| 3.3.4 Oris区域中GC簇的分析 | 第39-42页 |
| 3.3.5 cox1、cob和rnl基因的内含子分析 | 第42-45页 |
| 3.4 最小线粒体基因组的设计 | 第45-47页 |
| 3.5 rho0细胞的制备和验证 | 第47-48页 |
| 3.6 线粒体基因组合成 | 第48-50页 |
| 4 结论 | 第50-51页 |
| 4.1 本论文的主要结论: | 第50页 |
| 4.2 本论文创新点 | 第50页 |
| 4.3 本论文的不足 | 第50-51页 |
| 5 展望 | 第51-52页 |
| 6 参考文献 | 第52-58页 |
| 7 攻读学位期间发表论文情况 | 第58-59页 |
| 8 致谢 | 第59-60页 |
| 附录 | 第60-76页 |
