| 摘要 | 第4-9页 |
| Abstract | 第9-13页 |
| 英文缩略语 | 第14-18页 |
| 第一部分 ：HIV-1CRF01_AE亚型原发感染者感染早期env基因变异研究 | 第18-41页 |
| 1 前言 | 第18-19页 |
| 2 材料与方法 | 第19-23页 |
| 2.1 实验材料 | 第19-21页 |
| 2.1.1 实验对象 | 第19-20页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第20-21页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第21页 |
| 2.2 实验方法 | 第21-22页 |
| 2.2.1 HIV-1病毒env全基因克隆 | 第21-22页 |
| 2.2.2 env全基因克隆质粒构建 | 第22页 |
| 2.2.3 env表达质粒测序 | 第22页 |
| 2.3 env基因序列分析 | 第22-23页 |
| 3 结果 | 第23-38页 |
| 3.1 感染早期env基因系统进化分析 | 第23-25页 |
| 3.2 感染早期env基因受宿主免疫选择压力分析 | 第25-26页 |
| 3.3 感染早期env蛋白氨基酸动态变化分析 | 第26-38页 |
| 3.3.1 env蛋白氨基酸数量随感染时间改变 | 第26-27页 |
| 3.3.2 env蛋白点突变与糖基化位点改变 | 第27-37页 |
| 3.3.3 env蛋白免疫选择识别表位的变异情况分析 | 第37-38页 |
| 4 讨论 | 第38-41页 |
| 第二部分 ：HIV-1CRF01_AE亚型原发感染者感染早期血浆中和应答变化研究 | 第41-54页 |
| 1 前言 | 第41-42页 |
| 2 材料和方法 | 第42-46页 |
| 2.1 实验材料 | 第42-43页 |
| 2.1.1 实验对象 | 第42页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第42-43页 |
| 2.1.3 实验仪器 | 第43页 |
| 2.2 实验方法 | 第43-45页 |
| 2.2.1 HIV-1病毒env全长基因表达质粒构建 | 第43-44页 |
| 2.2.2 env假病毒构建 | 第44页 |
| 2.2.3 假病毒感染活性检测 | 第44-45页 |
| 2.2.4 假病毒感染细胞嗜性检测 | 第45页 |
| 2.3 血浆中和env假病毒 | 第45-46页 |
| 2.3.1 血浆准备 | 第45-46页 |
| 2.3.2 血浆稀释 | 第46页 |
| 2.3.3 假病毒感染 | 第46页 |
| 2.3.4 荧光检测 | 第46页 |
| 2.3.5 结果计算 | 第46页 |
| 3 结果 | 第46-51页 |
| 3.1 env假病毒感染活性及嗜性 | 第46-47页 |
| 3.1.1env假病毒感染活性TCID50 | 第46-47页 |
| 3.1.2 env假病毒感染嗜性 | 第47页 |
| 3.2 血浆中和env假病毒 | 第47-51页 |
| 3.2.1 不同时期血浆中和感染最早期病毒活性比较 | 第47-48页 |
| 3.2.2 血浆对同期假病毒中和活性变化 | 第48页 |
| 3.2.3 血浆对不同期假病毒中和活性变化 | 第48-49页 |
| 3.2.4 血浆中和活性变化与env蛋白变异相关性 | 第49-51页 |
| 4 讨论 | 第51-54页 |
| 第三部分 ：HIV-1CRF01_AE亚型原发感染者感染早期V4区基因变异与血浆中和应答相关性的研究 | 第54-69页 |
| 1 前言 | 第54-55页 |
| 2 材料和方法 | 第55-59页 |
| 2.1 实验材料 | 第55-57页 |
| 2.1.1 实验对象 | 第55页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第55-56页 |
| 2.1.3 实验仪器 | 第56-57页 |
| 2.2 实验方法 | 第57-59页 |
| 2.2.1 HIV-1病毒V4区嵌合表达质粒构建 | 第57-58页 |
| 2.2.2 V4区嵌合假病毒构建 | 第58页 |
| 2.2.3 血浆中和V4区嵌合假病毒 | 第58-59页 |
| 2.2.4 gp120蛋白单体构建 | 第59页 |
| 2.2.5 血浆gp120结合力试验 | 第59页 |
| 2.2.6 包膜基因与抗体共进化分析 | 第59页 |
| 3 结果 | 第59-66页 |
| 3.1 V4区嵌合假病毒的构建 | 第59-60页 |
| 3.2 血浆中和V4区嵌合假病毒 | 第60-63页 |
| 3.2.1 V4区嵌合假病毒与感染30天野生病毒的中和敏感性比较 | 第60页 |
| 3.2.2 V4区嵌合假病毒与同期逃逸病毒的中和敏感性比较 | 第60-63页 |
| 3.3 血浆gp120结合力试验 | 第63-64页 |
| 3.4 病毒包膜与抗体共进化 | 第64-66页 |
| 4 讨论 | 第66-69页 |
| 附录 本研究创新性的自我评价 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-75页 |
| 综述 原发HIV-1感染者早期病毒进化及其影响因素 | 第75-84页 |
| 1.HIV-1的遗传进化特点 | 第75-76页 |
| 2.HIV-1进化的影响因素研究 | 第76-79页 |
| 3.结束语 | 第79页 |
| 参考文献 | 第79-84页 |
| 攻读学位期间取得的研究成果 | 第84-85页 |
| 致谢 | 第85-86页 |
| 个人简历 | 第86页 |
