摘要 | 第3-4页 |
abstract | 第4-5页 |
第一章 绪论 | 第9-17页 |
1.1 课题研究背景 | 第9-10页 |
1.2 课题研究的目的及意义 | 第10-11页 |
1.2.1 课题研究目的 | 第10-11页 |
1.2.2 课题研究意义 | 第11页 |
1.3 甲型流感病毒的进化研究现状 | 第11-14页 |
1.3.1 国外研究现状 | 第12-13页 |
1.3.2 国内研究现状 | 第13-14页 |
1.4 论文的研究内容和研究方法 | 第14-15页 |
1.4.1 主要研究内容 | 第14-15页 |
1.4.2 主要研究方法 | 第15页 |
1.5 论文结构安排 | 第15-17页 |
第二章 流感病毒及生物信息学相关介绍 | 第17-26页 |
2.1 概述 | 第17-18页 |
2.2 流感病毒概述 | 第18-21页 |
2.2.1 流感病毒简介 | 第18-19页 |
2.2.2 流感病毒的变异方式 | 第19-20页 |
2.2.3 流感病毒进化史 | 第20-21页 |
2.3 甲型H1N1流感病毒研究进展 | 第21-22页 |
2.3.1 甲型H1N1流感病毒简介 | 第21页 |
2.3.2 甲型H1N1流感病毒研究概况 | 第21-22页 |
2.4 生物信息学研究 | 第22-25页 |
2.4.1 生物信息学概述 | 第22-23页 |
2.4.2 生物信息学相关数据库 | 第23-24页 |
2.4.3 生物信息学在流感病毒中的应用 | 第24-25页 |
2.5 本章小结 | 第25-26页 |
第三章 相关理论与技术 | 第26-32页 |
3.1 概述 | 第26页 |
3.2 高维数据的降维算法 | 第26-28页 |
3.2.1 线性降维 | 第26-27页 |
3.2.2 非线性降维 | 第27-28页 |
3.3 聚类算法 | 第28-31页 |
3.3.1 基于划分的方法 | 第28-29页 |
3.3.2 基于层次的方法 | 第29页 |
3.3.3 基于密度的方法 | 第29-30页 |
3.3.4 基于网格的方法 | 第30-31页 |
3.4 本章小结 | 第31-32页 |
第四章 基于K-MEANS++的甲型H1N1流感病毒子群的划分 | 第32-45页 |
4.1 概述 | 第32页 |
4.2 甲型H1N1流感病毒蛋白质序列的数据集获取与处理 | 第32-39页 |
4.2.1 甲型H1N1流感病毒基因组序列的获取 | 第32-33页 |
4.2.2 基于时间排列的甲型H1N1流感病毒蛋白质序列 | 第33-34页 |
4.2.3 甲型H1N1流感病毒基因组蛋白质序列的数字化映射 | 第34-37页 |
4.2.4 甲型H1N1流感病毒蛋白质序列数据的降维处理 | 第37-39页 |
4.3 甲型H1N1流感病毒蛋白序列子群划分处理 | 第39-42页 |
4.3.1 基于K-means++算法的数据聚类算法 | 第39-40页 |
4.3.2 甲型H1N1流感病毒聚类数据处理 | 第40-42页 |
4.4 甲型流感病毒基因组子群聚类分析 | 第42-44页 |
4.5 本章小结 | 第44-45页 |
第五章 甲型H1N1流感病毒基因组变异特性研究 | 第45-65页 |
5.1 概述 | 第45页 |
5.2 甲型H1N1流感病毒基因组子群数据集处理 | 第45-47页 |
5.2.1 MAFFT介绍 | 第45-46页 |
5.2.2 基因组序列的MAFFT对位排列 | 第46-47页 |
5.3 甲型H1N1流感病毒变异参数分析 | 第47-54页 |
5.3.1 定义变异特征参数 | 第48页 |
5.3.2 变异特征参数举例分析 | 第48-51页 |
5.3.3 变异特征参数实例验证 | 第51-54页 |
5.4 甲型H1N1流感病毒基因组子群变异特性分析 | 第54-64页 |
5.5 本章小结 | 第64-65页 |
第六章 结论与展望 | 第65-67页 |
6.1 结论 | 第65-66页 |
6.2 展望 | 第66-67页 |
参考文献 | 第67-73页 |
致谢 | 第73-74页 |
附录 | 第74-85页 |
个人简历、在学期间的研究成果及发表的学术论文 | 第85页 |