首页--生物科学论文--普通生物学论文--水生生物学论文--水生生物生态学和地理学论文--水体环境分布论文--海洋生物论文--海底论文

西太平洋和印度洋海底热液口十足目系统发育及其演化关系的研究

前言第5-6页
摘要第6-7页
Abstract第7页
常用缩略词表第8-10页
目录第10-13页
第一章 文献综述第13-23页
    1 海底热液口分布,特征与生物群落第13-14页
    2 热液口十足目概述第14页
    3 当前热液口生物起源与演化机制的争议第14-15页
    4 线粒体基因组结构第15-16页
    5 当前分子系统进化估计主要方法第16-18页
        5.1 系统发育关系与分子系统发育树第16页
        5.2 系统发育树重建方法第16-17页
        5.3 氨基酸核苷酸替换模型第17-18页
        5.4 最大似然估计(ML)第18页
        5.5 贝叶斯法(BA)第18页
    6 分子钟与基于分子数据的物种演化分歧时间估算第18-20页
        6.1 分子钟第18-19页
        6.2 分子钟的标定第19-20页
        6.3 多化石点标定的贝叶斯算法实现第20页
    7 展望第20-23页
第二章 海底热液口十足目线粒体基因组测序第23-33页
    摘要第23页
    1 引言第23-24页
    2 材料和仪器第24-25页
        2.1 实验材料第24页
        2.2 实验试剂第24-25页
        2.3 主要实验仪器第25页
    3 实验方法第25-30页
        3.1 热液口十足目总DNA的抽提第25页
        3.2 线粒体基因组DNA扩增与克隆策略第25-29页
        3.3 线粒体基因组注释及序列分析第29-30页
    4 实验结果第30-32页
        4.1 线粒体基因组克隆策略与测得基因顺序第30页
        4.2 短片段PCR结果第30-31页
        4.3 长片段PCR结果第31页
        4.4 长片段鸟枪法碎片文库的筛选第31-32页
        4.5 所有十足目已测序线粒体及其核苷酸组成分析第32页
    5 论论第32-33页
第三章 基于线粒体基因组的十足目系统发育关系的重建第33-45页
    摘要第33页
    1 引言第33-35页
    2 工具软件第35-36页
    3 实验方法第36-38页
        3.1 核苷酸与氨基酸序列的分区第36页
        3.2 核苷酸的分区策略评价与选择第36-37页
        3.3 基于核苷酸与氨基酸序列的系统发育树的构建与评价第37-38页
    4 实验结果第38-43页
        4.1 核苷酸数据集的分区策略及其评价结果第38-39页
        4.2 核苷酸序列32个分区及每个分区的最佳模型第39-40页
        4.3 氨基酸序列13个分区及每个分区的最佳模型第40页
        4.4 系统发育树的重建及树拓扑的S-H检验结果第40-43页
    5 讨论第43-45页
第四章 化石标定的验证第45-53页
    摘要第45页
    1 引言第45-46页
    2 工具软件第46页
    3 实验方法第46-49页
        3.1 用作标定的8个化石记录和1个地质事件第46-47页
        3.2 Near法验证化石标定年代的一致性第47-48页
        3.3 Marshall法验证化石标定年代的一致性以及标定上限的计算第48-49页
    4 实验结果第49-50页
        4.1 Near法化石标定年代一致性检测结果第49-50页
        4.2 Marshall法验证化石标定年代的一致性及标定上限计算结果第50页
    5 讨论第50-53页
第五章 分歧时间的估算第53-69页
    摘要第53页
    1 引言第53-54页
    2 工具软件第54-55页
    3 实验方法第55-56页
        3.1 分子钟假设的检测第55页
        3.2 分歧时间估算与化石标定约束的选择第55-56页
    4 实验结果第56-67页
        4.1 分子钟检验结果第56-57页
        4.2 采用由节点78不同的标定上限所得分歧时间估算结果的差异第57页
        4.3 采用6种不同的拓扑估算的分歧时间结果异同第57-65页
        4.4 分歧时间估算结果第65-66页
        4.5 西太平洋和印度洋海底热液口十足目系统发育及其演化关系第66-67页
    5 讨论第67-69页
结论第69-71页
致谢第71-73页
参考文献第73-77页
附录一 常用试剂配制一览表第77-79页
附录二 作者简历第79页

论文共79页,点击 下载论文
上一篇:新型植物抗病激活剂的创制、活性评价及传导过程初探
下一篇:面向可重构服务承载网的分域交换技术研究