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alas1基因的缺失通过影响钙离子信号通路导致斑马鱼心脏功能障碍

中文摘要第4-6页
Abstract第6-7页
第一章 文献综述第11-21页
    1.1 血红素概述第11-13页
        1.1.1 血红素的生物功能第11-12页
        1.1.2 血红素生物合成的过程第12页
        1.1.3 卟啉症第12-13页
    1.2 alas1基因概述第13-14页
    1.3 斑马鱼作为模式生物的优点第14-15页
    1.4 斑马鱼心脏发育调控第15-17页
    1.5 钙离子通路与斑马鱼心脏功能的关系第17-18页
    1.6 CRISPR-Cas9的作用机制第18-20页
    1.7 立题意义和主要研究内容第20-21页
第二章 材料与方法第21-42页
    2.1 实验材料第21页
    2.2 实验仪器第21-22页
    2.3 实验试剂第22-23页
    2.4 常用试剂配制第23-25页
        2.4.1 核酸电泳相关的缓冲液第23页
        2.4.2 原位杂交相关的试剂第23-24页
        2.4.3 细菌培养基第24页
        2.4.4 抗生素第24页
        2.4.5 Inoue法制备超级感受态细胞的相关溶液第24-25页
    2.5 引物序列第25-26页
    2.6 试验方法及设计第26-42页
        2.6.1 斑马鱼交配与胚胎的收集第26页
        2.6.2 斑马鱼基因组DNA的提取第26页
        2.6.3 胚胎总RNA的提取第26-27页
        2.6.4 mRNA反转成cDNA第27-28页
        2.6.6 胶回收(试剂盒)第28-29页
        2.6.7 目的片段连接到载体上及酶切鉴定第29页
        2.6.8 感受态细胞的制备第29-30页
        2.6.9 转化第30页
        2.6.10 转化试验重组子的鉴定第30页
        2.6.11 质粒的提取(试剂盒)第30-31页
        2.6.12 显微注射第31-32页
        2.6.13 荧光定量PCR第32页
        2.6.14 原位杂交过程第32-35页
        2.6.15 o-dianisidine染色第35页
        2.6.16 石蜡切片和HE染色第35-36页
        2.6.17 细胞培养第36-37页
        2.6.18 荧光素酶表达水平的检测第37页
        2.6.19 ChIP第37-38页
        2.6.20 运用CRISPR-Cas9技术构建alas1、uros斑马鱼突变体第38-41页
        2.6.21 高通量转录组测序第41页
        2.6.22 数据统计分析第41-42页
第三章 实验结果及分析第42-62页
    3.1 不同物种的ALAS1氨基酸序列具有较高的保守性第42-43页
    3.2 运用CRISPR-Cas9技术构建alas1基因缺陷的斑马鱼突变体第43-46页
        3.2.1 Cas9位点设计及gRNA合成第43-45页
        3.2.2 Cas9活性检验第45页
        3.2.3 alas1突变体筛选第45-46页
    3.3 alas1纯合突变体表现出心脏功能紊乱第46-50页
    3.4 alas1的缺失影响心脏标记基因的表达第50-51页
    3.5 alas1的缺失没有影响斑马鱼血管的发育第51-52页
    3.6 alas1突变体的转录组测序分析第52-59页
    3.7 转录因子Nrf2a-Mafk能激活atp2a1l的表达第59-60页
    3.8 alas1 mRNA和血红素能拯救atp2a1l基因的表达第60-62页
第四章 硕士期间参与的其他研究第62-68页
    4.1 运用CRISPR-Cas9技术构建uros基因缺陷的斑马鱼突变体第62-64页
        4.1.1 Cas9位点设计及gRNA合成第62-63页
        4.1.2 Cas9活性检验第63页
        4.1.3 uros突变的体筛选第63-64页
    4.2 uros基因缺陷的斑马鱼突变体的表型分析第64-65页
    4.3 uros基因缺陷对血红素代谢途径中的基因表达的影响第65-66页
    4.4 人类UROS mRNA能够拯救突变体的表型第66-68页
第五章 讨论与展望第68-75页
    5.1 成功构建了alas1基因缺陷的纯合突变体第68-69页
    5.2 alas1-/-突变体表现出明显的心脏功能障碍第69-70页
    5.3 alas1-/-突变体的转录组测序分析第70-71页
    5.4 atp2a1l基因的表达受Nrf2a/Bach1b-Mafk通路调控第71-72页
    5.5 alas1-/-突变体中血红素合成相关基因的表达量分析第72-73页
    5.6 alas1基因与生物钟系统的关系第73-75页
第六章 结论第75-76页
参考文献第76-85页
附录第85-86页
研究生期间已发表和待发表的论文第86-87页
致谢第87-89页

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