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甘蓝型油菜紫叶基因BnaA.PL1定位和候选基因分析

摘要第7-10页
Abstract第10-12页
缩略语表第13-14页
1 文献综述第14-37页
    1.1 花色苷的研究进展第14-26页
        1.1.1 花色苷的组成及分布第15-16页
        1.1.2 花色苷的生物合成第16-20页
        1.1.3 花色苷的转运第20-21页
        1.1.4 花色苷提取及定量定性分析第21-23页
        1.1.5 花色苷与抗逆研究第23-25页
        1.1.6 花色苷与生物保健功能第25-26页
        1.1.7 花色苷高表达突变体与杂交制种第26页
    1.2 芸薹属紫叶性状的研究进展第26-30页
        1.2.1 芸薹属植物花色苷生理生化研究第27页
        1.2.2 芸薹属紫叶性状的定位研究第27-28页
        1.2.3 芸薹属高花色苷品种选育第28-29页
        1.2.4 紫叶性状在油菜杂交制种方面的应用第29-30页
    1.3 图位克隆技术在油菜基因定位上的应用第30-35页
        1.3.1 定位群体的构建第31页
        1.3.2 分子标记技术第31-32页
        1.3.3 分子标记的开发第32-33页
        1.3.4 转录组测序分析技术第33页
        1.3.5 半定量PCR和定量PCR技术第33页
        1.3.6 候选基因的预测第33-35页
    1.4 本研究目的和意义第35-37页
2 材料及方法第37-52页
    2.1 试验材料第37页
    2.2 试验方法第37-52页
        2.2.1 遗传群体的构建第37-38页
        2.2.2 紫叶性状植物学表型观察及花色苷显微定位第38页
        2.2.3 叶绿素的提取和比较第38-39页
        2.2.4 花色苷的提取和比较第39页
        2.2.5 紫叶性状对光合作用的影响第39-41页
        2.2.6 分子标记方法第41-43页
        2.2.7 AFLP多态性标记的T-A克隆第43-44页
        2.2.8 SNP芯片结合BSA法开发标记第44-45页
        2.2.9 分子标记的开发第45页
        2.2.10 连锁图的构建第45页
        2.2.11 半定量和定量PCR第45-47页
        2.2.12 BnaA.PL1序列分析第47页
        2.2.13 转录组测序分析第47-52页
3 结果与分析第52-96页
    3.1 6-1029 全生育期紫叶性状观察第52-53页
    3.2 紫叶突变体叶片观察及花色苷组织定位第53-54页
    3.3 叶绿素和花色苷含量的比较第54-55页
    3.4 紫叶性状对光合作用的影响第55-60页
        3.4.1 光响应曲线分析第55-57页
        3.4.2 CO_2响应曲线分析第57-60页
    3.5 紫叶遗传规律确定第60-61页
    3.6 紫叶基因BnaA.PL1的定位第61-71页
        3.6.1 SSR及AFLP标记的筛选第61-63页
        3.6.2 SNP芯片多态性标记的筛选第63-66页
        3.6.3 其它紫叶基因连锁标记的筛选第66-67页
        3.6.4 BnaA.PL1基因的遗传定位第67-71页
    3.7 半定量和定量PCR第71-73页
        3.7.1 半定量PCR第71-72页
        3.7.2 定量PCR第72-73页
    3.8 候选基因在突变体和野生型之间的比较测序与分析第73-76页
    3.9 紫叶突变体的转录组分析第76-96页
        3.9.1 测序数据质量评估第76-77页
        3.9.2 Reads与参考基因组比对第77页
        3.9.3 RNA-seq整体质量评估第77-85页
        3.9.4 6-1029 中与拟南芥花色苷合成基因同源基因的差异表达分析第85-96页
4 讨论第96-102页
    4.1 白菜基因组与甘蓝型油菜A染色体组的共线性第96页
    4.2 SNP结合BSA在甘蓝型油菜定位的优势第96-97页
    4.3 BnaA.PL1是不同于Bra017728和Bra017831的基因第97页
    4.4 花色苷合成与硫代谢的关系第97-99页
    4.5 紫叶突变体在育种中应用第99-100页
    4.6 下一步计划第100-102页
参考文献第102-113页
致谢第113-115页
附录1第115-116页
附录2第116页

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