中文摘要 | 第3-6页 |
英文摘要 | 第6-9页 |
主要缩略词 | 第15-17页 |
1 绪论 | 第17-27页 |
1.1 问题的提出及研究意义 | 第17-19页 |
1.2 国内外现状 | 第19-24页 |
1.2.1 非小细胞肺癌(NSCLC)的治疗现状 | 第19-20页 |
1.2.2 CCR5及其拮抗剂的研究现状 | 第20-23页 |
1.2.3 药物重定位计算分析方法的研究现状 | 第23-24页 |
1.3 研究思路及主要研究内容 | 第24-26页 |
1.3.1 研究思路 | 第24-25页 |
1.3.2 研究内容 | 第25-26页 |
1.4 本文的创新点 | 第26-27页 |
2 CCR5拮抗剂的虚拟筛选研究 | 第27-43页 |
2.1 前言 | 第27页 |
2.2 实验方法 | 第27-31页 |
2.2.1 实验数据来源 | 第27-28页 |
2.2.2 实验软件 | 第28页 |
2.2.3 分子对接 | 第28-29页 |
2.2.4 分子动力学模拟 | 第29-30页 |
2.2.5 结合自由能计算 | 第30-31页 |
2.3 实验结果 | 第31-39页 |
2.3.1 CCR5受体蛋白的选择 | 第31页 |
2.3.2 分子对接虚拟筛选结果 | 第31-35页 |
2.3.3 分子动力学模拟 | 第35-38页 |
2.3.4 结合自由能计算 | 第38-39页 |
2.4 讨论 | 第39-41页 |
2.5 本章小结 | 第41-43页 |
3 CCR5拮抗剂对A549细胞增殖的影响 | 第43-63页 |
3.1 前言 | 第43页 |
3.2 实验材料 | 第43-46页 |
3.2.1 主要试剂 | 第43-44页 |
3.2.2 主要溶液 | 第44-46页 |
3.2.3 主要仪器 | 第46页 |
3.3 实验方法 | 第46-53页 |
3.3.1 细胞复苏 | 第46-47页 |
3.3.2 细胞传代 | 第47页 |
3.3.3 细胞冻存 | 第47页 |
3.3.4 细胞计数 | 第47页 |
3.3.5 ELISA检测CCL5分泌水平 | 第47-48页 |
3.3.6 流式细胞仪检测CCR5的表达 | 第48页 |
3.3.7 细胞活性检测 | 第48-49页 |
3.3.8 细胞克隆形成实验 | 第49页 |
3.3.9 EdU检测细胞增殖 | 第49-51页 |
3.3.10 细胞周期检测 | 第51页 |
3.3.11 Western blot分析 | 第51-53页 |
3.3.12 统计分析 | 第53页 |
3.4 实验结果 | 第53-60页 |
3.4.1 ELISA检测CCL5的分泌 | 第53-54页 |
3.4.2 流式检测CCR5的表达情况 | 第54页 |
3.4.3 DMSO对细胞增殖的影响 | 第54页 |
3.4.4 CCR5拮抗剂对细胞增殖的影响 | 第54-56页 |
3.4.5 EdU检测细胞增殖 | 第56-57页 |
3.4.6 CCR5拮抗剂对A549细胞克隆形成的影响 | 第57-58页 |
3.4.7 流式检测CCR5拮抗剂对A549细胞周期的影响 | 第58-59页 |
3.4.8 CCR5拮抗剂对细胞周期相关蛋白表达的影响 | 第59-60页 |
3.5 讨论 | 第60-62页 |
3.6 本章小结 | 第62-63页 |
4 CCR5拮抗剂对A549细胞凋亡的影响 | 第63-77页 |
4.1 前言 | 第63-64页 |
4.2 实验材料 | 第64-65页 |
4.2.1 主要试剂 | 第64页 |
4.2.2 主要溶液 | 第64页 |
4.2.3 主要仪器 | 第64-65页 |
4.3 实验方法 | 第65-67页 |
4.3.1 细胞形态学观察 | 第65页 |
4.3.2 Hochest 33258 荧光染色 | 第65-66页 |
4.3.3 Annexin V-FITC/PI双染色法检测细胞凋亡 | 第66页 |
4.3.4 细胞内ROS水平的测定 | 第66-67页 |
4.3.5 线粒体膜电位检测 | 第67页 |
4.3.6 统计分析 | 第67页 |
4.4 实验结果 | 第67-73页 |
4.4.1 细胞形态学观察 | 第67-69页 |
4.4.2 Hochest 33258 荧光染色观察细胞凋亡形态 | 第69页 |
4.4.3 CCR5拮抗剂对细胞凋亡的影响 | 第69-71页 |
4.4.4 CCR5拮抗剂对细胞内ROS水平的影响 | 第71-72页 |
4.4.5 CCR5拮抗剂对线粒体膜电位的影响 | 第72-73页 |
4.5 讨论 | 第73-75页 |
4.6 本章小结 | 第75-77页 |
5 CCR5拮抗剂诱导A549细胞凋亡作用机制的初步探讨 | 第77-99页 |
5.1 前言 | 第77页 |
5.2 实验材料 | 第77-82页 |
5.2.1 主要试剂 | 第77-80页 |
5.2.2 主要溶液 | 第80页 |
5.2.3 主要仪器 | 第80-82页 |
5.3 实验方法 | 第82-86页 |
5.3.1 细胞处理 | 第82页 |
5.3.2 Real time PCR检测 | 第82-84页 |
5.3.3 细胞凋亡相关基因检测 | 第84页 |
5.3.4 Western blot分析 | 第84-86页 |
5.3.5 NF-κB活性检测 | 第86页 |
5.3.6 统计分析 | 第86页 |
5.4 实验结果 | 第86-94页 |
5.4.1 RNA样品纯度和质量鉴定结果 | 第86-87页 |
5.4.2 Real time PCR检测凋亡相关基因的表达变化 | 第87-88页 |
5.4.3 PCR-array检测细胞凋亡相关基因的表达变化 | 第88-89页 |
5.4.4 Real time PCR检测差异表达基因 | 第89-90页 |
5.4.5 CCR5拮抗剂对NF-κB活性的影响 | 第90页 |
5.4.6 CCR5拮抗剂对Caspase-9 活性的影响 | 第90-91页 |
5.4.7 CCR5拮抗剂对凋亡相关蛋白表达的影响 | 第91-94页 |
5.4.8 CCR5拮抗剂对Caspase-8 活性的影响 | 第94页 |
5.5 讨论 | 第94-96页 |
5.6 本章小结 | 第96-99页 |
6 CCR5拮抗剂对A549细胞迁移及侵袭能力的影响 | 第99-111页 |
6.1 前言 | 第99页 |
6.2 实验材料 | 第99-101页 |
6.2.1 主要试剂 | 第99-100页 |
6.2.2 主要溶液 | 第100页 |
6.2.3 主要仪器 | 第100-101页 |
6.3 实验方法 | 第101-104页 |
6.3.1 细胞增殖-毒性检测 | 第101-102页 |
6.3.2 细胞基质粘附实验 | 第102页 |
6.3.3 Transwell迁移实验 | 第102-103页 |
6.3.4 细胞划痕实验 | 第103页 |
6.3.5 Transwell基质胶侵袭实验 | 第103-104页 |
6.3.6 统计分析 | 第104页 |
6.4 实验结果 | 第104-108页 |
6.4.1 细胞增殖-毒性检测 | 第104页 |
6.4.2 CCR5拮抗剂对细胞粘附的影响 | 第104-105页 |
6.4.3 CCR5拮抗剂对细胞迁移的影响 | 第105-107页 |
6.4.4 CCR5拮抗剂对细胞侵袭的影响 | 第107-108页 |
6.5 讨论 | 第108-109页 |
6.6 本章小结 | 第109-111页 |
7 CCR5拮抗剂抑制A549细胞侵袭转移作用机制的初步探讨 | 第111-125页 |
7.1 前言 | 第111页 |
7.2 实验材料 | 第111-115页 |
7.2.1 主要试剂 | 第111-113页 |
7.2.2 主要溶液 | 第113-114页 |
7.2.3 主要仪器 | 第114-115页 |
7.3 实验方法 | 第115-117页 |
7.3.1 细胞处理 | 第115页 |
7.3.2 Real time PCR检测 | 第115页 |
7.3.3 细胞外基质及与细胞粘附相关基因检测 | 第115-116页 |
7.3.4 Western blot分析 | 第116页 |
7.3.5 酶联免疫吸附实验 | 第116页 |
7.3.6 统计分析 | 第116-117页 |
7.4 实验结果 | 第117-121页 |
7.4.1 RNA样品纯度和质量鉴定结果 | 第117页 |
7.4.2 细胞外基质基因与细胞粘附相关基因的表达结果 | 第117-118页 |
7.4.3 Real time PCR检测差异表达基因 | 第118页 |
7.4.4 CCR5拮抗剂对TIMPs、MMPs蛋白表达的影响 | 第118-119页 |
7.4.5 CCR5拮抗剂对MMP-2、MMP-9 蛋白酶活性的影响 | 第119-120页 |
7.4.6 ELISA检测TIMPs、MMPs表达变化 | 第120-121页 |
7.5 讨论 | 第121-122页 |
7.6 本章小结 | 第122-125页 |
8 CCR5与拮抗剂的作用机制研究 | 第125-133页 |
8.1 前言 | 第125-126页 |
8.2 实验方法 | 第126页 |
8.2.1 实验数据来源 | 第126页 |
8.2.2 实验软件 | 第126页 |
8.2.3 分子动力学模拟 | 第126页 |
8.2.4 结合自由能计算 | 第126页 |
8.2.5 结合自由能分解 | 第126页 |
8.3 实验结果 | 第126-130页 |
8.3.1 CCR5与拮抗剂的动力学模拟 | 第126-128页 |
8.3.2 结合自由能计算 | 第128-129页 |
8.3.3 残基能量分解 | 第129-130页 |
8.4 讨论 | 第130-132页 |
8.5 本章小结 | 第132-133页 |
9 结论与展望 | 第133-137页 |
9.1 主要结论 | 第133-134页 |
9.2 后续工作建议 | 第134-137页 |
致谢 | 第137-139页 |
参考文献 | 第139-151页 |
附录 | 第151页 |
A 作者在攻读学位期间发表的论文目录 | 第151页 |
B 作者在攻读学位期间参加的科研项目目录 | 第151页 |