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有机肥中抗生素及其抗性基因的检测和恩诺沙星对生菜内生细菌的喹诺酮抗性基因的影响

中文摘要第6-8页
ABSTRACT第8-10页
缩写第11-12页
第一章 前言第12-24页
    一、环境中的抗生素第12-13页
    二、新型环境污染物—抗生素抗性基因第13-16页
        (一) ARGs储存库的形成第14页
        (二) ARGs的传播扩散途径第14-16页
    三、喹诺酮类抗生素概述第16-18页
        (一) 喹诺酮类抗生素的分类第16-17页
        (二) 喹诺酮类抗生素的作用机制第17-18页
        (三) 喹诺酮类抗生素的使用第18页
    四、质粒介导的喹诺酮抗性基因第18-20页
        (一) PMQR基因的分类及其耐药机制第19页
        (二) PMQR基因的流行第19-20页
    五、有机肥源抗生素污染的研究第20页
    六、抗生素和ARGs向植物传播的研究第20-21页
    七、本论文的研究思路第21-24页
第二章 有机肥中典型抗生素残留测定及相关ARGs检测第24-38页
    1 实验材料第24-28页
        1.1 供试材料第24-25页
        1.2 药品试剂第25页
        1.3 仪器设备第25-26页
        1.4 溶液及培养基配制第26页
        1.5 酶及引物第26-27页
        1.6 其他材料第27页
        1.7 菌株培养与保藏第27-28页
    2 实验方法第28-30页
        2.1 有机肥中四类典型抗生素残留的同时测定第28-30页
            2.1.1 样品前处理第28页
            2.1.2 UPLC-MS/MS检测第28-30页
        2.2 有机肥DNA的提取及抗性基因检测第30页
            2.2.1 有机肥DNA的提取第30页
            2.2.2 ARGs检测第30页
    3 结果与分析第30-36页
        3.1 有机肥中抗生素的检测第30-33页
            3.1.1 线性方程和检出限第30-32页
            3.1.2 南京市售有机肥中4类抗生素检测第32-33页
        3.2 有机肥DNA提取及ARGs测定第33-36页
            3.2.1 有机肥DNA提取方法的优化第33-35页
            3.2.2 ARGs的检测第35-36页
    4 讨论第36-38页
第三章 土壤中添加思诺沙星对生菜内生细菌抗性基因qnrA、qnrB的影响第38-68页
    第一节 PMQR基因阳性克隆构建与qPCR方法的建立第38-48页
        1 实验材料第38-40页
            1.1 菌种和质粒第38页
            1.2 药品试剂第38-39页
            1.3 仪器设备第39页
            1.4 溶液和培养基配制第39-40页
            1.5 酶及引物第40页
            1.6 其他材料第40页
            1.7 菌株培养与保藏第40页
        2 实验方法第40-44页
            2.1 阳性克隆的构建第40-43页
                2.1.1 目的DNA的扩增第40-41页
                2.1.2 PCR产物纯化回收第41-42页
                2.1.3 PCR产物装TA克隆第42页
                2.1.4 感受态细胞制备及转化第42-43页
                2.1.5 阳性克隆的筛选及双酶切验证第43页
                2.1.6 PCR扩增与测序验证第43页
            2.2 荧光实时定量PCR反应第43-44页
                2.2.1 qPCR方法第43-44页
                2.2.2 qPCR标准曲线第44页
        3 结果与分析第44-48页
            3.1 阳性克隆的筛选第44-45页
            3.2 qPCR方法第45-48页
    第二节 生菜盆栽试验及相关数据测定第48-68页
        1 实验材料第48-51页
            1.1 供试材料第48页
            1.2 药品试剂第48-49页
            1.3 仪器设备第49页
            1.4 溶液及培养基配制第49-50页
            1.5 酶及引物第50页
            1.6 其他材料第50-51页
            1.7 菌株培养与保藏第51页
        2 实验方法第51-56页
            2.1 实验设计第51-52页
            2.2 化学分析方法第52-53页
                2.2.1 土壤中恩诺沙星及环丙沙星的提取第52页
                2.2.2 生菜中恩诺沙星及环丙沙星的提取第52-53页
                2.2.3 UPLC-MS/MS检测第53页
            2.3 抗性基因的定量第53-54页
                2.3.1 土壤DNA的提取第53页
                2.3.2 生菜叶片内生细菌的富集及DNA的提取第53-54页
                2.3.3 qPCR定量第54页
            2.4 内生细菌的分离和鉴定第54-56页
                2.4.1 内生细菌分离第54页
                2.4.2 内生细菌菌种鉴定第54-55页
                2.4.3 抗生素敏感性实验第55-56页
            2.5 数据统计和分析第56页
        3 结果与分析第56-66页
            3.1 土壤和生菜中的恩诺沙星及环丙沙星第56-57页
                3.1.1 检测限与定量限第56-57页
                3.1.2 检测结果第57页
            3.2 土壤和生菜叶片内生细菌的PMQR基因的定量检测第57-62页
                3.2.1 qPCR引物第57页
                3.2.2 qPCR检测限第57页
                3.2.3 检测结果第57-62页
            3.3 生菜内生细菌菌种鉴定和耐药性第62-66页
                3.3.1 内生细菌计数第62页
                3.3.2 菌种鉴定第62-63页
                3.3.3 药敏试验第63-65页
                3.3.4 耐药性细菌的PMQR基因扩增第65-66页
        4 讨论第66-68页
参考文献第68-77页
创新和不足之处第77-78页
致谢第78-79页
附件第79-82页

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