| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-30页 |
| 1.1 引言 | 第11页 |
| 1.2 根瘤菌多样性研究 | 第11-17页 |
| 1.2.1 根瘤菌早期分类学研究 | 第11-12页 |
| 1.2.2 根瘤菌现代分类学研究 | 第12-17页 |
| 1.3 根瘤菌分类研究方法 | 第17-21页 |
| 1.3.1 根瘤菌表型多样性 | 第17-18页 |
| 1.3.2 根瘤菌遗传多样性 | 第18-21页 |
| 1.4 水平基因转移对根瘤菌进化的影响 | 第21-24页 |
| 1.4.1 Alpha纲根瘤菌的进化历史研究 | 第22-23页 |
| 1.4.2 Alpha纲根瘤菌nod基因的进化 | 第23-24页 |
| 1.5 根瘤菌微进化研究 | 第24-26页 |
| 1.6 本研究立题依据和研究意义 | 第26-30页 |
| 第二章 菜豆根瘤菌的系统发育研究 | 第30-58页 |
| 2.1 引言 | 第30页 |
| 2.2 试验材料 | 第30-34页 |
| 2.2.1 供试菌株和土样来源 | 第30-32页 |
| 2.2.2 主要仪器、试剂、培养基及营养液 | 第32-34页 |
| 2.3 试验方法 | 第34-40页 |
| 2.3.1 菜豆根瘤和土样的采集 | 第34页 |
| 2.3.2 土壤理化性质测定 | 第34页 |
| 2.3.3 菜豆根瘤菌的分离及纯化 | 第34页 |
| 2.3.4 菌株总DNA的提取 | 第34-35页 |
| 2.3.5 16S rRNA基因系统发育分析 | 第35-37页 |
| 2.3.6 持家基因（atpD、glnII和recA）系统发育分析 | 第37-38页 |
| 2.3.7 共生基因（nodC和nif H）酶切与系统发育分析 | 第38-39页 |
| 2.3.8 统计分析及群落多样性估计 | 第39页 |
| 2.3.9 回接试验 | 第39-40页 |
| 2.4 结果与分析 | 第40-55页 |
| 2.4.1 菜豆根瘤菌 16S rRNA基因PCR-RFLP及系统发育分析 | 第40-43页 |
| 2.4.2 菜豆根瘤菌持家基因（atpD，glnII和recA）系统发育分析 | 第43-45页 |
| 2.4.3 菜豆根瘤菌共生基因（nodC和nif H）PCR-RFLP及系统发育分析 | 第45-52页 |
| 2.4.4 环境因子对根瘤菌生物地理分布的影响 | 第52-55页 |
| 2.4.5 回接试验 | 第55页 |
| 2.5 讨论 | 第55-58页 |
| 2.5.1 中国两个生态区与菜豆共生的根瘤菌多样性 | 第55-56页 |
| 2.5.2 菜豆根瘤菌的群落组成和生物地理分布 | 第56-58页 |
| 第三章 Rhizobium etli及近缘种的群体结构 | 第58-81页 |
| 3.1 引言 | 第58页 |
| 3.2 材料与方法 | 第58-64页 |
| 3.2.1 菌株描述 | 第58-60页 |
| 3.2.2 基因的扩增与测序 | 第60-62页 |
| 3.2.3 核苷酸序列分析 | 第62-64页 |
| 3.3 结果与分析 | 第64-78页 |
| 3.3.1 核苷酸多样性 | 第64-66页 |
| 3.3.2 选择压力分析 | 第66-72页 |
| 3.3.3 重组分析 | 第72页 |
| 3.3.4 网络分析 | 第72-74页 |
| 3.3.5 群体结构分析 | 第74-76页 |
| 3.3.6 群体分化及地理的影响 | 第76-78页 |
| 3.4 讨论 | 第78-81页 |
| 第四章 结论与创新点 | 第81-83页 |
| 4.1 结论 | 第81-82页 |
| 4.2 创新点 | 第82-83页 |
| 参考文献 | 第83-99页 |
| 致谢 | 第99-100页 |
| 作者简介 | 第100页 |
