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铁皮石斛糖基转移酶基因分析及β-1,3葡聚糖合成酶基因的克隆

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
缩为略词表第10-11页
1.引言第11-20页
    1.1 铁皮石斛概述第11-14页
        1.1.1 铁皮石斛概述第11页
        1.1.2 铁皮石斛多糖药理作用第11-12页
        1.1.3 铁皮石斛含糖量第12-13页
        1.1.4 铁皮石斛多糖组分及结构分析第13-14页
    1.2 糖基转移酶概述第14-17页
        1.2.1 糖基转移酶概念及分类第14-15页
        1.2.2 UGT基因家族研究进展第15-16页
        1.2.3 β-1,3 葡聚糖合成酶基因第16-17页
    1.3 全基因组研究技术第17页
    1.4 基因克隆技术第17-19页
    1.5 本研究的实际意义第19-20页
2.材料、试剂及仪器第20-21页
    2.1 材料第20页
    2.2 试剂第20页
    2.3 仪器第20-21页
3.方法第21-31页
    3.1 铁皮石斛全基因组糖基转移酶分析第21-22页
        3.1.1 铁皮石斛全基因组序列下载第21页
        3.1.2 基因预测第21页
        3.1.3 拟南芥和番茄糖代谢途径相关基因序列下载第21-22页
        3.1.4 数据处理第22页
    3.2 铁皮石斛基因组数据整合第22页
    3.3 β-1,3 葡聚糖合成酶基因序列的探寻第22页
    3.4 β-1,3 葡聚糖合成酶基因保守序列扩增验证第22-27页
        3.4.1 RNA提取第22-23页
        3.4.2 反转录第23页
        3.4.3 引物设计第23-24页
        3.4.4 PCR扩增体系第24页
        3.4.5 PCR扩增程序第24-25页
        3.4.6 PCR产物切胶回收第25页
        3.4.7 连接第25-26页
        3.4.8 转化第26页
        3.4.9 质粒提取第26-27页
        3.4.10 酶切验证第27页
    3.5 β-1,3 葡聚糖合成酶基因 3'RACE第27-29页
        3.5.1 RNA提取第27页
        3.5.2 反转录第27页
        3.5.3 引物设计第27-28页
        3.5.4 PCR体系和程序第28-29页
        3.5.5 切胶回收、连接、转化、质粒提取及酶切验证第29页
    3.6 β-1,3 葡聚糖合成酶基因 5’RACE第29-31页
        3.6.1 RNA提取第29页
        3.6.2 反转录第29页
        3.6.3 β-1,3 葡聚糖合成酶基因 5’RACE PCR扩增第29-30页
        3.6.4 切胶回收、连接、转化、质粒提取及酶切验证第30-31页
4 结果第31-48页
    4.1 铁皮石斛全基因组糖基转移酶基因分析第31-37页
        4.1.1 拟南芥、番茄、水稻基因与铁皮石斛基因LocalBlast结果第31页
        4.1.2 糖基转移酶基因系统进化关系第31-35页
        4.1.3 铁皮石斛多糖合成途径预测第35-37页
    4.2 β-1,3 葡聚糖基因的保守序列探寻第37-38页
        4.2.1 铁皮石斛基因组序列本地Blast第37页
        4.2.2 NCBI注释比对得到的scaffold第37-38页
    4.3 β-1,3 葡聚糖基因保守区域扩增第38-42页
        4.3.1 RNA提取第38-39页
        4.3.2 叶片与茎的扩增第39页
        4.3.3 β-1,3 葡聚糖基因保守序列扩增第39-40页
        4.3.4 β-1,3 葡聚糖基因保守序列转化第40页
        4.3.5 β-1,3 葡聚糖基因保守序列菌落PCR验证第40-41页
        4.3.6 β-1,3 葡聚糖基因保守序列质粒提取第41页
        4.3.7 β-1,3 葡聚糖基因保守序列酶切第41-42页
        4.3.8 β-1,3 葡聚糖基因保守序列测序第42页
    4.4 β-1,3 葡聚糖合成酶基因 3’RACE第42-46页
        4.4.1 β-1,3 葡聚糖合成酶基因 3’RACE PCR第42-43页
        4.4.2 β-1,3 葡聚糖合成酶基因 3’RACE转化第43页
        4.4.3 β-1,3 葡聚糖合成酶基因 3’RAC菌落PCR验证第43-44页
        4.4.4 β-1,3 葡聚糖合成酶基因 3’RACE质粒提取第44页
        4.4.5 β-1,3 葡聚糖合成酶基因 3’RACE酶切第44-45页
        4.4.6 β-1,3 葡聚糖合成酶基因 3’RACE测序第45-46页
    4.5 β-1,3 葡聚糖基因的5’RACE第46-48页
5.讨论第48-51页
    5.1 铁皮石斛多糖合成途径第48-49页
    5.2 β-1,3 葡聚糖基因基因克隆第49-51页
        5.2.1 RNA提取第49页
        5.2.2 RACE技术第49-50页
        5.2.3 蓝白斑筛选第50-51页
6.结论第51-52页
参考文献第52-60页
附录 1:试剂及溶液配制第60-61页
附录 2:序列峰图第61-63页
附录 3:拟南芥、番茄糖分别与铁皮石斛基因组LocalBlast结果第63-73页
致谢第73-74页
作者简介第74页

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