全原子编码方式预测蛋白质的溶剂可及性
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 引言 | 第9-11页 |
| 1 文献综述 | 第11-17页 |
| ·蛋白质的功能 | 第11-12页 |
| ·蛋白质的化学组成 | 第12-13页 |
| ·蛋白质的结构 | 第13-17页 |
| 2 蛋白质氨基酸残基的溶剂可及性 | 第17-27页 |
| ·生物大分子表面概述 | 第17-19页 |
| ·蛋白质表面的定义 | 第17-18页 |
| ·溶剂可及表面 | 第18-19页 |
| ·溶剂可及表面积的表达式 | 第19页 |
| ·溶剂可及性的计算 | 第19-21页 |
| ·数据的采集 | 第21-24页 |
| ·数据编码 | 第24-27页 |
| 3 支持向量机 | 第27-41页 |
| ·统计学习理论 | 第27-28页 |
| ·经验风险最小化 | 第27-28页 |
| ·VC维 | 第28页 |
| ·结构风险最小化 | 第28页 |
| ·支持向量分类机 | 第28-35页 |
| ·支持向量回归机 | 第35-39页 |
| ·预测模型评估指标 | 第39-41页 |
| 4 计算结果和讨论 | 第41-47页 |
| ·计算结果 | 第41-45页 |
| ·预测模型参数的选取 | 第41-42页 |
| ·窗口尺寸对结果的影响 | 第42页 |
| ·编码方式对结果的影响 | 第42-43页 |
| ·与其他方法比较 | 第43-45页 |
| ·预测实例 | 第45-47页 |
| 结论 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-51页 |
| 附录A 常见氨基酸名称和结构式 | 第51-56页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
