| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 英文缩略表 | 第13-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-28页 |
| 1.1 捻转血矛线虫的生物学特征概述 | 第14-16页 |
| 1.1.1 捻转血矛线虫的形态学特征及生活史 | 第14-15页 |
| 1.1.2 捻转血矛线虫的流行病学及致病性 | 第15-16页 |
| 1.1.3 捻转血矛线虫的防治现状 | 第16页 |
| 1.2 捻转血矛线虫遗传多样性的研究现状 | 第16-19页 |
| 1.2.1 遗传多样性简介及其研究意义 | 第16-17页 |
| 1.2.2 捻转血矛线虫遗传多样性的研究进展 | 第17-19页 |
| 1.3 捻转血矛线虫抗药性研究进展 | 第19-23页 |
| 1.3.1 线虫对驱虫药物的抗药性及其抗药性机理 | 第19-20页 |
| 1.3.2 捻转血矛线虫抗药性研究现状 | 第20-23页 |
| 1.4 SNP在分子生物学中的应用 | 第23-26页 |
| 1.4.1 常见的分子标记 | 第23-25页 |
| 1.4.2 基于新一代测序技术的SNP(Single nucleotide polymorphism)标记及其应用 12 | 第25-26页 |
| 1.5 基于SNP的捻转血矛线虫种群遗传学及抗药性标示位点研究 | 第26-28页 |
| 第二章 捻转血矛线虫形态学观察及分子生物学鉴定 | 第28-40页 |
| 2.1 捻转血矛线虫的形态学观察 | 第28-32页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第28-29页 |
| 2.1.1.1 实验动物 | 第28页 |
| 2.1.1.2 试剂 | 第28-29页 |
| 2.1.1.3 仪器与耗材 | 第29页 |
| 2.1.2 实验方法 | 第29页 |
| 2.1.3 实验结果 | 第29-31页 |
| 2.1.3.1 捻转血矛线虫雄虫的形态学观察结果 | 第29-30页 |
| 2.1.3.2 捻转血矛线虫雌虫的形态学观察结果 | 第30-31页 |
| 2.1.4 讨论 | 第31-32页 |
| 2.2 捻转血矛线虫的分子生物学鉴定 | 第32-40页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第32-33页 |
| 2.2.1.1 实验动物 | 第32页 |
| 2.2.1.2 试剂 | 第32-33页 |
| 2.2.1.3 仪器与耗材 | 第33页 |
| 2.2.2 实验方法 | 第33-36页 |
| 2.2.2.1 捻转血矛线虫核酸提取 | 第33-34页 |
| 2.2.2.2 ITS序列鉴定捻转血矛线虫 | 第34-36页 |
| 2.2.3 实验结果 | 第36-37页 |
| 2.2.3.1 PCR扩增电泳图及DNA序列测序结果 | 第36-37页 |
| 2.2.3.2 DNA序列比对及分析 | 第37页 |
| 2.2.4 讨论 | 第37-40页 |
| 第三章 捻转血矛线虫的种群遗传学研究 | 第40-62页 |
| 3.1 实验材料 | 第40-42页 |
| 3.1.1 实验动物 | 第40-41页 |
| 3.1.2 试剂 | 第41页 |
| 3.1.3 仪器与耗材 | 第41-42页 |
| 3.2 实验方法 | 第42-47页 |
| 3.2.1 虫株基因组的抽提及检测 | 第42-43页 |
| 3.2.2 IIB型限制性内切酶消化 | 第43页 |
| 3.2.3 连接接头 | 第43页 |
| 3.2.4 PCR扩增及目的片段的回收 | 第43-44页 |
| 3.2.5 接头延伸 | 第44页 |
| 3.2.6 Solexa测序 | 第44-45页 |
| 3.2.7 高通量测序的基本数据分析方法 | 第45-46页 |
| 3.2.8 遗传距离(Genetic distance)、进化树（Phylogenetic Tree）、F‐statistics、遗传多样性指数（π）及杂合度（H）的计算 | 第46-47页 |
| 3.3 实验结果 | 第47-56页 |
| 3.3.1 样品DNA的检测结果 | 第47-48页 |
| 3.3.2 高通量测序基本数据产出 | 第48-50页 |
| 3.3.3 基因组范围SNP筛查、统计和分型分析 | 第50-52页 |
| 3.3.4 遗传距离(Genetic distance)分析结果 | 第52-53页 |
| 3.3.5 进化树分析结果 | 第53-54页 |
| 3.3.6 F‐statistics计算结果 | 第54-56页 |
| 3.3.7 种群遗传多样性指数及杂合度计算结果 | 第56页 |
| 3.4 实验讨论 | 第56-62页 |
| 3.4.1 DNA检测结果 | 第56页 |
| 3.4.2 高通量测序方法研究SNP的方法可行性 | 第56-57页 |
| 3.4.3 SNP类型分析 | 第57-58页 |
| 3.4.4 种群遗传距离(Genetic distance)分析 | 第58-60页 |
| 3.4.5 进化树分析 | 第60页 |
| 3.4.6 F‐statistics分析 | 第60-61页 |
| 3.4.7 种群遗传多样性指数及杂合度分析 | 第61-62页 |
| 第四章 捻转血矛线虫P‐糖蛋白SNP标记分子的研究 | 第62-69页 |
| 4.1 实验材料 | 第62-63页 |
| 4.1.1 实验动物 | 第62-63页 |
| 4.1.2 实验试剂 | 第63页 |
| 4.1.3 仪器与耗材 | 第63页 |
| 4.2 实验方法 | 第63-65页 |
| 4.3 实验结果 | 第65-67页 |
| 4.3.1 SNP位置及类型 | 第65-66页 |
| 4.3.2 SNP验证结果 | 第66-67页 |
| 4.4 讨论 | 第67-69页 |
| 第五章 全文总结 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-76页 |
| 附录 | 第76-77页 |
| 致谢 | 第77页 |
