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红平红球菌复苏促进因子基因克隆、表达及生物学活性研究

摘要第8-10页
Abstract第10-11页
第1章 绪论第12-20页
    1.1 非可培养状态(VBNC)状态研究进展第13-14页
        1.1.1 VBNC状态的形成因素和形态特征第13页
        1.1.2 VBNC状态细菌的复苏第13-14页
    1.2 复苏促进因子(Rpf)的研究进展第14-17页
        1.2.1 Rpf的发现第14-15页
        1.2.2 Rpf蛋白家族的生物学特性鉴定第15-17页
        1.2.3 Rpf蛋白家族的作用机制第17页
    1.3 革兰氏阴性菌的细胞复苏促进因子的研究进展第17-18页
        1.3.1 沙门氏菌的细胞复苏促进因子第17页
        1.3.2 副溶血弧菌的细胞复苏促进因子第17-18页
        1.3.3 哈维氏弧菌中的Yeaz蛋白第18页
    1.4 石油降解菌红球菌(Rhodococcus spp.)特性第18-19页
    1.5 本文研究的目的和意义第19-20页
第2章 红平红球菌KB1的4种细胞复苏促进因子基因克隆及生物信息学分析第20-37页
    2.1 引言第20页
    2.2 材料第20-21页
        2.2.1 菌种及培养基第20页
        2.2.2 试剂第20-21页
    2.3 方法第21-23页
        2.3.1 DNA的提取及rpf-1、rpf-2、rpf-3、rpf-4的扩增第21-22页
        2.3.2 rpf-1、rpf-2、rpf-3 和rpf-4的连接、转化及测序第22页
        2.3.3 生物信息学分析第22-23页
    2.4 结果第23-35页
        2.4.1 Rhodococcus erythropolis PR4 rpf-1、rpf-2、rpf-3 和rpf-4基因序列的克隆与分析第23-25页
        2.4.2 rpf-1、rpf-2、rpf-3 和rpf-4编码氨基酸序列的分析第25-27页
        2.4.3 Rpf-1、Rpf-2、Rpf-3和Rpf-4蛋白信号肽及磷酸化位点分析第27-29页
        2.4.4 Rpf-1、Rpf-2、Rpf-3和Rpf-4蛋白二级结构第29-30页
        2.4.5 Rpf-1、Rpf-2、Rpf-3和Rpf-4结构域分析第30-32页
        2.4.6 物种间同源性分析第32页
        2.4.7 Rhodococcus erythropolis菌株Rpf蛋白系统发育分析第32-33页
        2.4.8 Rpf蛋白三级结构预测第33-35页
    2.5 讨论第35-36页
    2.6 结论第36-37页
第3章 红平红球菌复苏促进因子Rpf-1蛋白在大肠杆菌中表达及性质第37-48页
    3.1 引言第37页
    3.2 实验材料和仪器第37-39页
        3.2.1 实验菌株与质粒第37-38页
        3.2.2 培养基第38-39页
        3.2.3 主要试剂和仪器第39页
    3.3 实验方法第39-45页
        3.3.1 红平红球菌rpf-1基因的克隆第39-42页
        3.3.2 rpf-1基因表达质粒的构建、在大肠杆菌中表达第42-45页
        3.3.3 Rpf-1酶活性的检测第45页
    3.4 结果第45-47页
        3.4.1 p UCm-T-rpf-1质粒的构建第45页
        3.4.2 表达质粒的构建第45-46页
        3.4.3 纯化酶Rpf-1溶菌酶酶活力的测定第46页
        3.4.4 纯化酶Rpf-1偶氮络蛋白酶活力的测定第46-47页
    3.5 讨论第47页
    3.6 结论第47-48页
第4章 红平红球菌复苏促进因子Rpf-1蛋白对红平红球菌的生长促进作用第48-54页
    4.1 引言第48页
    4.2 实验材料和仪器第48页
        4.2.1 实验菌株第48页
        4.2.2 实验试剂及仪器第48页
    4.3 重组蛋白Rpf-1对菌体的复苏促进作用第48-49页
        4.3.1 重组蛋白Rpf-1对红平红球菌的生长促进作用第48-49页
        4.3.2 重组蛋白Rpf-1对VBNC状态红平红球菌的复苏促进作用第49页
        4.3.3 重组蛋白Rpf-1对低温保存的红平红球菌复苏促进作用第49页
        4.3.4 重组蛋白Rpf-1对阴性菌VBNC状态哈维式弧菌的复苏促进作用第49页
    4.4 结果第49-51页
        4.4.1 重组蛋白Rpf-1对红平红球菌的生长促进作用第49-50页
        4.4.2 重组蛋白Rpf-1对VBNC状态红平红球菌的复苏促进作用第50-51页
        4.4.3 重组蛋白Rpf-1对低温保存的红平红球菌的复苏促进作用第51页
    4.5 讨论第51-53页
    4.6 结论第53-54页
结论第54-55页
参考文献第55-64页
致谢第64-65页
附录A 攻读学位期间所发表的学术论文目录第65页

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