中文摘要 | 第8-11页 |
Abstract | 第11-13页 |
1 前言 | 第14-30页 |
1.1 叶籽银杏研究进展 | 第14-16页 |
1.1.1 叶籽银杏分布与特点 | 第14-15页 |
1.1.2 叶籽银杏分子生物学研究进展 | 第15-16页 |
1.2 植物microRNA研究进展 | 第16-22页 |
1.2.1 miRNA发现及特点 | 第16-17页 |
1.2.2 miRNA生物合成及作用机制 | 第17-19页 |
1.2.3 miRNA鉴定与表达检测方法 | 第19-21页 |
1.2.4 miRNA靶基因的预测与验证 | 第21-22页 |
1.3 植物miRNA调控功能 | 第22-25页 |
1.3.1 miRNA调节花分化及发育 | 第22-23页 |
1.3.2 miRNA调节叶片发育 | 第23-24页 |
1.3.3 miRNA参与植物激素调节及信号转导 | 第24-25页 |
1.4 植物胚珠发育研究进展 | 第25-28页 |
1.4.1 胚珠形态建成 | 第25页 |
1.4.2 胚珠发育的物质积累及调控 | 第25-26页 |
1.4.3 胚珠发育相关基因研究进展 | 第26-28页 |
1.4.4 miRNA参与胚珠发育进展 | 第28页 |
1.5 研究目的与意义 | 第28-30页 |
2 材料与方法 | 第30-42页 |
2.1 实验材料 | 第30-32页 |
2.1.1 植物材料 | 第30页 |
2.1.2 主要试剂 | 第30-31页 |
2.1.3 主要仪器 | 第31页 |
2.1.4 生物信息分析相关的数据库及软件 | 第31-32页 |
2.2 主要技术路线 | 第32页 |
2.3 实验方法 | 第32-42页 |
2.3.1 Solexa文库构建与测序 | 第32-34页 |
2.3.2 叶籽银杏miRNA鉴定及差异分析 | 第34-36页 |
2.3.3 miRNA靶基因预测 | 第36页 |
2.3.4 qRT-PCR验证mi RNA的表达 | 第36-39页 |
2.3.5 miRNA靶基因的差异表达 | 第39-42页 |
3 结果与分析 | 第42-63页 |
3.1 叶籽银杏sRNA测序分析 | 第42-45页 |
3.1.1 总RNA提取质量检测 | 第42页 |
3.1.2 Solexa测序总体情况分析 | 第42-45页 |
3.2 miRNA的鉴定及表达丰度的差异分析 | 第45-55页 |
3.2.1 叶籽银杏保守miRNA的鉴定 | 第45-52页 |
3.2.2 叶籽银杏novel mi RNA的鉴定 | 第52页 |
3.2.3 叶籽银杏miRNA差异分析 | 第52-55页 |
3.3 miRNA靶基因测功能注释及GO分类 | 第55-58页 |
3.3.1 靶基因预测 | 第55-58页 |
3.3.2 差异miRNA靶基因GO分析 | 第58页 |
3.4 qRT-PCR验证mi RNA的差异表达 | 第58-60页 |
3.4.1 sRNA提取质量检测 | 第58-59页 |
3.4.2 miRNA的qRT-PCR分析 | 第59-60页 |
3.5 qRT-PCR检测目标基因的表达 | 第60-63页 |
3.5.1 总RNA提取质量检测 | 第60-61页 |
3.5.2 靶基因的qRT-PCR分析 | 第61-63页 |
4 讨论 | 第63-71页 |
4.1 叶籽银杏sRNA高通量测序 | 第63页 |
4.2 叶籽银杏sRNA序列分析 | 第63-64页 |
4.3 叶籽银杏miRNAs的表达谱 | 第64-65页 |
4.4 差异miRNA调控植物激素合成及信号转导 | 第65-67页 |
4.5 差异miRNA调控胚珠发育相关基因 | 第67-68页 |
4.6 探讨叶籽银杏的发生机制 | 第68-71页 |
5 结论 | 第71-72页 |
6 参考文献 | 第72-87页 |
7 附录 | 第87-99页 |
8 致谢 | 第99-100页 |
9 攻读学位期间发表论文情况 | 第100页 |