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叶籽银杏microRNAs鉴定与表达分析

中文摘要第8-11页
Abstract第11-13页
1 前言第14-30页
    1.1 叶籽银杏研究进展第14-16页
        1.1.1 叶籽银杏分布与特点第14-15页
        1.1.2 叶籽银杏分子生物学研究进展第15-16页
    1.2 植物microRNA研究进展第16-22页
        1.2.1 miRNA发现及特点第16-17页
        1.2.2 miRNA生物合成及作用机制第17-19页
        1.2.3 miRNA鉴定与表达检测方法第19-21页
        1.2.4 miRNA靶基因的预测与验证第21-22页
    1.3 植物miRNA调控功能第22-25页
        1.3.1 miRNA调节花分化及发育第22-23页
        1.3.2 miRNA调节叶片发育第23-24页
        1.3.3 miRNA参与植物激素调节及信号转导第24-25页
    1.4 植物胚珠发育研究进展第25-28页
        1.4.1 胚珠形态建成第25页
        1.4.2 胚珠发育的物质积累及调控第25-26页
        1.4.3 胚珠发育相关基因研究进展第26-28页
        1.4.4 miRNA参与胚珠发育进展第28页
    1.5 研究目的与意义第28-30页
2 材料与方法第30-42页
    2.1 实验材料第30-32页
        2.1.1 植物材料第30页
        2.1.2 主要试剂第30-31页
        2.1.3 主要仪器第31页
        2.1.4 生物信息分析相关的数据库及软件第31-32页
    2.2 主要技术路线第32页
    2.3 实验方法第32-42页
        2.3.1 Solexa文库构建与测序第32-34页
        2.3.2 叶籽银杏miRNA鉴定及差异分析第34-36页
        2.3.3 miRNA靶基因预测第36页
        2.3.4 qRT-PCR验证mi RNA的表达第36-39页
        2.3.5 miRNA靶基因的差异表达第39-42页
3 结果与分析第42-63页
    3.1 叶籽银杏sRNA测序分析第42-45页
        3.1.1 总RNA提取质量检测第42页
        3.1.2 Solexa测序总体情况分析第42-45页
    3.2 miRNA的鉴定及表达丰度的差异分析第45-55页
        3.2.1 叶籽银杏保守miRNA的鉴定第45-52页
        3.2.2 叶籽银杏novel mi RNA的鉴定第52页
        3.2.3 叶籽银杏miRNA差异分析第52-55页
    3.3 miRNA靶基因测功能注释及GO分类第55-58页
        3.3.1 靶基因预测第55-58页
        3.3.2 差异miRNA靶基因GO分析第58页
    3.4 qRT-PCR验证mi RNA的差异表达第58-60页
        3.4.1 sRNA提取质量检测第58-59页
        3.4.2 miRNA的qRT-PCR分析第59-60页
    3.5 qRT-PCR检测目标基因的表达第60-63页
        3.5.1 总RNA提取质量检测第60-61页
        3.5.2 靶基因的qRT-PCR分析第61-63页
4 讨论第63-71页
    4.1 叶籽银杏sRNA高通量测序第63页
    4.2 叶籽银杏sRNA序列分析第63-64页
    4.3 叶籽银杏miRNAs的表达谱第64-65页
    4.4 差异miRNA调控植物激素合成及信号转导第65-67页
    4.5 差异miRNA调控胚珠发育相关基因第67-68页
    4.6 探讨叶籽银杏的发生机制第68-71页
5 结论第71-72页
6 参考文献第72-87页
7 附录第87-99页
8 致谢第99-100页
9 攻读学位期间发表论文情况第100页

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