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基底型乳腺癌干细胞特征基因挖掘及分型功能研究

摘要第3-4页
Abstract第4页
第一章 绪论第7-15页
    1.1 乳腺癌概述第7-8页
        1.1.1 乳腺癌在国内外的现状第7页
        1.1.2 乳腺癌的分子分型第7-8页
        1.1.3 基底型乳腺癌研究现状第8页
    1.2 乳腺癌干细胞第8-10页
        1.2.1 乳腺癌干细胞概述第8-9页
        1.2.2 乳腺癌干细胞研究现状第9页
        1.2.3 乳腺癌干细胞与基底型乳腺癌第9-10页
    1.3 高通量转录组测序第10-11页
        1.3.1 高通量转录组测序概述第10页
        1.3.2 RNA-Seq在肿瘤研究中的应用第10-11页
    1.4 候选基因简介第11-13页
    1.5 本课题立题依据与意义第13页
    1.6 主要研究内容第13-15页
第二章 材料与方法第15-26页
    2.1 实验材料第15-18页
        2.1.1 细胞系第15页
        2.1.2 主要抗体第15-16页
        2.1.3 主要试剂和耗材第16页
        2.1.4 主要试剂盒第16-17页
        2.1.5 试剂配制第17-18页
        2.1.6 主要仪器设备第18页
    2.2 实验方法第18-25页
        2.2.1 细胞培养第18-19页
        2.2.2 干细胞的流式分析第19页
        2.2.3 干细胞的流式分选第19页
        2.2.4 RNA-Seq测序第19页
        2.2.5 RNA-Seq数据分析第19-20页
        2.2.6 qRT-PCR检测第20-22页
        2.2.7 Western blot检测第22-24页
        2.2.8 siRNA瞬时转染第24页
        2.2.9 细胞划痕实验第24页
        2.2.10 细胞成球实验第24-25页
    2.3 统计分析第25-26页
第三章 结果与讨论第26-43页
    3.1 乳腺癌细胞系的干细胞分析及分选第26-28页
        3.1.1 不同亚型乳腺癌细胞系中的干细胞表达比例分析第26-27页
        3.1.2 乳腺癌细胞系的干细胞分选与纯度鉴定第27-28页
    3.2 乳腺癌干细胞与非干细胞RNA-Seq及生物信息学分析第28-34页
        3.2.1 测序数据产量第28-29页
        3.2.2 过滤后reads的比对第29-30页
        3.2.3 DEGs的筛选第30-31页
        3.2.4 DEGs的GO分析和KEGG富集第31-33页
        3.2.5 DEGs的qRT-PCR验证第33-34页
    3.3 基底型乳腺癌候选分型基因的筛选第34-37页
        3.3.1 候选分型基因的筛选第34页
        3.3.2 qRT-PCR检测候选基因在不同亚型乳腺癌细胞系中的mRNA表达第34-36页
        3.3.3 Western blot检测候选基因在不同亚型乳腺癌细胞系中的蛋白表达第36-37页
    3.4 FA2H基因的功能研究第37-40页
        3.4.1 siRNA沉默细胞系中的FA2H表达第37页
        3.4.2 FA2H沉默对乳腺癌细胞系干细胞比例的影响第37-38页
        3.4.3 FA2H沉默对乳腺癌细胞系迁移的影响第38-39页
        3.4.4 FA2H沉默后对下游通路的影响第39-40页
    3.5 IL-6对乳腺癌干细胞的影响第40-43页
        3.5.1 IL-6对乳腺癌细胞系干细胞比例的影响第41页
        3.5.2 IL-6对乳腺癌细胞系自我更新能力的影响第41-43页
主要结论与展望第43-45页
    主要结论第43页
    展望第43-45页
致谢第45-46页
参考文献第46-50页
附录:作者在攻读硕士学位期间发表的论文第50页

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