摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4页 |
第一章 绪论 | 第7-15页 |
1.1 乳腺癌概述 | 第7-8页 |
1.1.1 乳腺癌在国内外的现状 | 第7页 |
1.1.2 乳腺癌的分子分型 | 第7-8页 |
1.1.3 基底型乳腺癌研究现状 | 第8页 |
1.2 乳腺癌干细胞 | 第8-10页 |
1.2.1 乳腺癌干细胞概述 | 第8-9页 |
1.2.2 乳腺癌干细胞研究现状 | 第9页 |
1.2.3 乳腺癌干细胞与基底型乳腺癌 | 第9-10页 |
1.3 高通量转录组测序 | 第10-11页 |
1.3.1 高通量转录组测序概述 | 第10页 |
1.3.2 RNA-Seq在肿瘤研究中的应用 | 第10-11页 |
1.4 候选基因简介 | 第11-13页 |
1.5 本课题立题依据与意义 | 第13页 |
1.6 主要研究内容 | 第13-15页 |
第二章 材料与方法 | 第15-26页 |
2.1 实验材料 | 第15-18页 |
2.1.1 细胞系 | 第15页 |
2.1.2 主要抗体 | 第15-16页 |
2.1.3 主要试剂和耗材 | 第16页 |
2.1.4 主要试剂盒 | 第16-17页 |
2.1.5 试剂配制 | 第17-18页 |
2.1.6 主要仪器设备 | 第18页 |
2.2 实验方法 | 第18-25页 |
2.2.1 细胞培养 | 第18-19页 |
2.2.2 干细胞的流式分析 | 第19页 |
2.2.3 干细胞的流式分选 | 第19页 |
2.2.4 RNA-Seq测序 | 第19页 |
2.2.5 RNA-Seq数据分析 | 第19-20页 |
2.2.6 qRT-PCR检测 | 第20-22页 |
2.2.7 Western blot检测 | 第22-24页 |
2.2.8 siRNA瞬时转染 | 第24页 |
2.2.9 细胞划痕实验 | 第24页 |
2.2.10 细胞成球实验 | 第24-25页 |
2.3 统计分析 | 第25-26页 |
第三章 结果与讨论 | 第26-43页 |
3.1 乳腺癌细胞系的干细胞分析及分选 | 第26-28页 |
3.1.1 不同亚型乳腺癌细胞系中的干细胞表达比例分析 | 第26-27页 |
3.1.2 乳腺癌细胞系的干细胞分选与纯度鉴定 | 第27-28页 |
3.2 乳腺癌干细胞与非干细胞RNA-Seq及生物信息学分析 | 第28-34页 |
3.2.1 测序数据产量 | 第28-29页 |
3.2.2 过滤后reads的比对 | 第29-30页 |
3.2.3 DEGs的筛选 | 第30-31页 |
3.2.4 DEGs的GO分析和KEGG富集 | 第31-33页 |
3.2.5 DEGs的qRT-PCR验证 | 第33-34页 |
3.3 基底型乳腺癌候选分型基因的筛选 | 第34-37页 |
3.3.1 候选分型基因的筛选 | 第34页 |
3.3.2 qRT-PCR检测候选基因在不同亚型乳腺癌细胞系中的mRNA表达 | 第34-36页 |
3.3.3 Western blot检测候选基因在不同亚型乳腺癌细胞系中的蛋白表达 | 第36-37页 |
3.4 FA2H基因的功能研究 | 第37-40页 |
3.4.1 siRNA沉默细胞系中的FA2H表达 | 第37页 |
3.4.2 FA2H沉默对乳腺癌细胞系干细胞比例的影响 | 第37-38页 |
3.4.3 FA2H沉默对乳腺癌细胞系迁移的影响 | 第38-39页 |
3.4.4 FA2H沉默后对下游通路的影响 | 第39-40页 |
3.5 IL-6对乳腺癌干细胞的影响 | 第40-43页 |
3.5.1 IL-6对乳腺癌细胞系干细胞比例的影响 | 第41页 |
3.5.2 IL-6对乳腺癌细胞系自我更新能力的影响 | 第41-43页 |
主要结论与展望 | 第43-45页 |
主要结论 | 第43页 |
展望 | 第43-45页 |
致谢 | 第45-46页 |
参考文献 | 第46-50页 |
附录:作者在攻读硕士学位期间发表的论文 | 第50页 |