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在四个实验猪群中利用全基因组关联分析及其荟萃分析定位影响四肢骨骼长度的基因位点

摘要第5-6页
ABSTRACT第6页
第一章 文献综述第7-13页
    1 引言第7页
    2 影响动物骨骼长度的因素第7-8页
        2.1 非遗传因素第7-8页
            2.1.1 营养因素第7-8页
            2.1.2 环境因素第8页
            2.1.3 繁殖因素第8页
            2.1.4 母体效应第8页
        2.2 遗传因素第8页
    3 复杂性状的研究方法第8-11页
        3.1 QTL定位第8-9页
        3.2 GWAS的基本概述第9-10页
        3.3 荟萃分析第10-11页
    4 骨骼生长发育的遗传学研究进展第11-12页
        4.1 QTL定位的结果第11页
        4.2 猪四肢骨骼候选基因的研究第11-12页
            4.2.1 HMGA1基因第12页
            4.2.2 PLAG1基因第12页
    5 本研究是目的与意义第12-13页
第二章 实验内容第13-41页
    2 实验材料和方法第13-15页
        2.1 实验动物第13页
        2.2 表型的测定第13页
        2.3 基因型分型和质量控制第13-14页
        2.4 统计方法第14-15页
    3 实验结果第15-39页
        3.1 表型性状统计结果第15-19页
        3.2 荟萃分析中Z值第19-20页
        3.3 SNP质量控制结果第20页
        3.4 主成分的分析结果第20-23页
        3.5 个体间的遗传距离第23页
        3.6 P<0.001的染色体区域第23页
        3.7 单个群体的GWAS结果第23-24页
        3.8 单个群体GWAS比较第24页
        3.9 固定7号和X染色体上最强关联SNP后的F_2群体GWAS结果第24-31页
        3.10 GWAS荟萃分析结果第31-34页
        3.11 7 号染色体上的连锁不平衡框第34页
        3.12 两位点间的连锁分析结果第34-39页
    4 讨论和结论第39-41页
        4.1 F_2群体中QTL结果和GWAS结果比较第39页
        4.2 单个群体的GWAS和GWAS荟萃分析比较第39-40页
        4.3 四个实验群体的连锁相在相同和不同的比较第40页
        4.4 性状之间的结果相比较第40页
        4.5 显著QTL潜在的候选基因第40-41页
小结第41-42页
参考文献第42-47页
附录第47-51页
论文发表情况第51-52页
致谢第52页

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