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适配体的Post-SELEX筛选评价、表征及传感新方法研究

缩略词表第7-10页
摘要第10-13页
Abstract第13-16页
第一章 前言第17-35页
    1.1 寡核苷酸适配体第17-18页
    1.2 SELEX后优化(Post-SELEX)第18-21页
        1.2.1 结构剪裁第18-20页
        1.2.2 定点突变第20页
        1.2.3 化学修饰第20-21页
        1.2.4 多价组合第21页
    1.3 适配体—靶分子相互作用时的亲和力评价技术第21-26页
        1.3.1 荧光各向异性法第22页
        1.3.2 后向散射干涉法第22-23页
        1.3.3 凝胶电泳迁移率变动分析第23页
        1.3.4 微量热泳动法第23-24页
        1.3.5 等温滴定量热法第24-25页
        1.3.6 表面等离子体共振技术第25页
        1.3.7 生物膜干涉技术第25-26页
    1.4 核酸适配体的结构表征技术第26-30页
        1.4.1 XRD第27-28页
        1.4.2 NMR第28页
        1.4.3 热熔曲线测定第28-29页
        1.4.4 CD第29页
        1.4.5 荧光探针法第29-30页
    1.5 核酸适配体作为分析传感元件的进展第30-32页
    1.6 本文的立题依据及研究工作第32-35页
第二章 一种步进型组合文库的构建及基于SPR的亲和评价优化方法研究第35-55页
    2.1 引言第35-36页
    2.2 仪器、材料与试剂第36-37页
        2.2.1 仪器第36页
        2.2.2 材料与试剂第36-37页
    2.3 实验方法第37-42页
        2.3.1 组合文库的构建第37-39页
        2.3.2 EPO-α 蛋白的单分子生物素化第39-40页
        2.3.3 SPR分析评价方法的建立第40-41页
        2.3.4 组合文库适配体序列评价分析第41-42页
    2.4 结果与讨论第42-54页
        2.4.1 SPR筛选评价方法的建立第42-48页
        2.4.2 步进型适配体组合文库的构建第48-49页
        2.4.3 组合文库适配体序列分析评价第49-54页
    2.5 本章小结第54-55页
第三章 最短适配体In27的简并序列及结合位点研究第55-72页
    3.1 引言第55页
    3.2 仪器、材料与试剂第55-56页
        3.2.1 仪器第55-56页
        3.2.2 材料与试剂第56页
    3.3 实验方法第56-60页
        3.3.1 CD谱图采集第56页
        3.3.2 In27序列定点突变分子群的构建第56-57页
        3.3.3 突变分子群中序列标准进样溶液配制第57-58页
        3.3.4 SPR分析评价第58页
        3.3.5 SA芯片上固定 39nt和In27对EPO-α 蛋白的MCK分析第58页
        3.3.6 不同亲和分子与EPO的亲和活性评价第58-59页
            3.3.6.1 EPO单克隆抗体与EPO-α 的MCK分析第58-59页
            3.3.6.2 EPO受体与EPO-α 的MCK分析第59页
        3.3.7 各亲和分子结合位点的SPR研究第59-60页
    3.4 结果与讨论第60-70页
        3.4.1 CD表征In27的高级结构第60页
        3.4.2 突变分子群的SPR评价第60-66页
        3.4.3 In27的亲和识别特点第66-70页
            3.4.3.1 In27双价适配体的亲和识别第66-67页
            3.4.3.2 适配体、凝集素、单抗及受体在EPO-α 上的结合位点研究第67-70页
    3.5 本章小结第70-72页
第四章 多种光谱技术对于适配体In27的活性高级结构特征研究第72-82页
    4.1 引言第72-73页
    4.2 仪器、材料与试剂第73页
        4.2.1 仪器第73页
        4.2.2 材料与试剂第73页
    4.3 实验方法第73-74页
        4.3.1 SPR评价第73页
        4.3.2 CD谱图采集第73页
        4.3.3 荧光测定第73-74页
        4.3.4 数据处理第74页
    4.4 结果与讨论第74-81页
        4.4.1 SPR评价阳离子类型及浓度对In27/EPO-α 亲和力的影响第74-76页
        4.4.2 CD评价阳离子类型及浓度对In27可能形成的GQ结构的影响第76-77页
        4.4.3 荧光探针法表征Na+浓度对In27可能形成的GQ结构的影响第77-80页
            4.4.3.1 利用荧光探针ThT研究In27的GQ结构第77-79页
            4.4.3.2 利用荧光探针NMM研究In27的GQ结构第79-80页
        4.4.4 EPO-α 荧光滴定第80-81页
    4.5 本章小结第81-82页
第五章 基于适配体的EPO-α 免标记检测方法研究第82-94页
    5.1 引言第82页
    5.2 仪器、材料与试剂第82-83页
        5.2.1 仪器第82-83页
        5.2.2 材料与试剂第83页
    5.3 实验方法第83-84页
        5.3.1 SA传感芯片上固定生物素化适配体第83页
        5.3.2 分析检测条件优化第83-84页
        5.3.3 基于 39nt的EPO-α 检测第84页
        5.3.4 基于In27的EPO-α 检测第84页
    5.4 结果与讨论第84-93页
        5.4.1 生物素化适配体在SA传感芯片上的固定第85-88页
            5.4.1.1 生物素化适配体的空间取向第85-86页
            5.4.1.2 适配体的固定浓度第86-87页
            5.4.1.3 In27与末端生物素间的连接臂长度第87-88页
        5.4.2 EPO-α 蛋白检测的优化第88-89页
        5.4.3 基于 39nt的EPO-α 检测第89-90页
        5.4.4 基于In27的EPO-α 检测第90-91页
        5.4.5 SPR技术与BLI技术的比较第91-93页
    5.5 本章小结第93-94页
研究总结第94-96页
参考文献第96-106页
附录一 个人简历第106-107页
附录二 攻读硕士学位期间发表文章和专利第107-108页
致谢第108-109页

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