Abstract | 第4-5页 |
摘要 | 第6-8页 |
Prior publications | 第8-15页 |
List of abbreviations | 第15-16页 |
Chapter one The Escherichia coli DNA replication and two-component signaling systems/Literature review/ | 第16-35页 |
1.1 The Escherichia coli K-12 bacterium | 第16-17页 |
1.2 Initiation of DNA replication | 第17-21页 |
1.3 Bacterial signaling systems | 第21-22页 |
1.4 Quorum sensing system | 第22-24页 |
1.5 Two-component system | 第24-27页 |
1.6 Signal transduction | 第27-28页 |
1.7 The QseB/QseC two-component system | 第28-31页 |
1.8 The flagella regulon | 第31-35页 |
Chapter two The QseB/QseC signaling affects initiation of DNA replication and cell motility inEscherichia coli | 第35-72页 |
2.1 Overall objective | 第35-36页 |
2.2 Introduction | 第36-39页 |
2.3 Materials and methods | 第39-53页 |
2.3.1 Bacterial strains and plasmids | 第39-41页 |
2.3.2 Primers | 第41-42页 |
2.3.3 Medium | 第42-44页 |
2.3.4 Buffer and stock solutions | 第44-46页 |
2.3.5 Antibiotics | 第46页 |
2.3.6 Enzymes | 第46页 |
2.3.7 Recombinant DNA techniques | 第46-47页 |
2.3.8 Determination of doubling time | 第47页 |
2.3.9 Agarose gel electrophoresis | 第47页 |
2.3.10 Preparation competent cell | 第47-48页 |
2.3.11 Transformation | 第48页 |
2.3.12 Measurement of cell size | 第48-49页 |
2.3.13 Polymerase chain reaction | 第49页 |
2.3.14 Flow cytometry | 第49-50页 |
2.3.15 Motility assay | 第50-51页 |
2.3.16 Subcellular localization of protein | 第51页 |
2.3.17 Purification of QseB | 第51页 |
2.3.18 Bacterial two-hybrid assay | 第51页 |
2.3.19 P1 transduction | 第51-52页 |
2.3.20 Western blotting | 第52-53页 |
2.4 Results | 第53-70页 |
2.4.1 The QseB/QseC signaling influences initiation of DNA replication | 第53-61页 |
2.4.1.1 Absence of QseB/QseC leads to early initiation of DNA replication | 第53-54页 |
2.4.1.2 Over-expression of qseB delays initiation of DNA replication | 第54-55页 |
2.4.1.3 The QseB protein does not directly interact with oriC region | 第55-57页 |
2.4.1.4 Absence of QseB enhances concentration of the DnaA protein | 第57-58页 |
2.4.1.5 Absence of the fliM, fliQ, fliP or fliO gene delays initiation of DNA replication | 第58-61页 |
2.4.2 The QseB/QseC signaling affects cell motility but not cell size | 第61-65页 |
2.4.2.1 Absence of the qseB gene increases cell motility | 第61-62页 |
2.4.2.2 Flagelar proteins are required for cell motility | 第62-63页 |
2.4.2.3 Absence of QseB/QseC signaling does not but of flagelar genes influences cells size | 第63-65页 |
2.4.3 The QseC protein localizes at cell membrane while QseB in cytosol | 第65-66页 |
2.4.4 The QseB protein interact with the DnaK and FtsZ proteins | 第66-70页 |
2.4.4.1 Several proteins are co-immunoprecipitated with QseB-GFP protein | 第66页 |
2.4.4.2 The QseB protein to directly interact with DnaK and FtsZ proteins in vivo | 第66-68页 |
2.4.4.3 Absence of the DnaK or FtsZ protein decreases cell motility | 第68-70页 |
2.5 Discussion | 第70-72页 |
References | 第72-83页 |
Acknowlodgements | 第83页 |