| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-20页 |
| 1.1 研究背景 | 第10-13页 |
| 1.1.1 下一代测序技术 | 第10-13页 |
| 1.1.2 精准医疗 | 第13页 |
| 1.2 大数据与云计算技术 | 第13-18页 |
| 1.2.1 大数据与云计算技术介绍 | 第13-15页 |
| 1.2.2 Hadoop分布式系统介绍 | 第15-18页 |
| 1.3 国内外研究现状 | 第18-19页 |
| 1.4 本章小结 | 第19-20页 |
| 第2章 高通量测序数据分析简介 | 第20-26页 |
| 2.1 DNA-seq数据分析 | 第20-22页 |
| 2.2 RNA-seq数据分析 | 第22-24页 |
| 2.3 本章小结 | 第24-26页 |
| 第3章 基于Hadoop的高通量测序数据分布式平行处理方法 | 第26-50页 |
| 3.1 测序数据的并行预处理 | 第27-29页 |
| 3.2 测序数据质量并行分析 | 第29-31页 |
| 3.3 测序数据并行比对分析 | 第31-44页 |
| 3.3.1 DNA序列比对软件对比分析 | 第32-38页 |
| 3.3.2 RNA序列比对软件对比分析 | 第38-40页 |
| 3.3.3 高性能环境下的高通量测序数据处理云计算模式 | 第40-42页 |
| 3.3.4 低性能环境下的高通量测序数据处理云计算模式 | 第42-44页 |
| 3.4 大规模SNP位点并行提取与分析 | 第44-47页 |
| 3.5 RNA-seq转录本信息获取与分析 | 第47-48页 |
| 3.6 本章小结 | 第48-50页 |
| 第4章 实验结果 | 第50-66页 |
| 4.1 实验数据 | 第50页 |
| 4.2 实验环境 | 第50-52页 |
| 4.3 白血病外显子组测序数据分析 | 第52-60页 |
| 4.3.1 白血病外显子组数据预处理实验 | 第52-53页 |
| 4.3.2 白血病外显子组数据质量分析实验 | 第53-55页 |
| 4.3.3 白血病外显子组数据比对分析实验 | 第55-57页 |
| 4.3.4 白血病外显子组数据突变基因信息提取实验 | 第57-60页 |
| 4.4 桃子转录组测序数据分析 | 第60-66页 |
| 4.4.1 桃子转录组数据质量分析实验 | 第60-61页 |
| 4.4.2 桃子转录组数据比对分析实验 | 第61-62页 |
| 4.4.3 桃子转录组数据转录本信息提取实验 | 第62-66页 |
| 第5章 总结与展望 | 第66-68页 |
| 参考文献 | 第68-72页 |
| 致谢 | 第72-74页 |
| 在读期间发表的学术论文与取得的其他研究成果 | 第74页 |
