| 摘要 | 第6-10页 |
| ABSTRACT | 第10-14页 |
| 缩略词索引表 | 第20-21页 |
| 第一章 绪论 | 第21-51页 |
| 1.1 微生物与生态环境 | 第21-28页 |
| 1.1.1 微生物的分布 | 第21-23页 |
| 1.1.2 我国气候带分布特征与微生物生态 | 第23-26页 |
| 1.1.3 西南地区气候带分布特征与微生物生态 | 第26页 |
| 1.1.4 气候带之间群落的演替 | 第26-28页 |
| 1.2 明永冰川及其退却地区垂直气候带特征与微生物生态 | 第28-33页 |
| 1.2.1 横断山脉与山地垂直带 | 第28-29页 |
| 1.2.2 冰川的形成与分布 | 第29-30页 |
| 1.2.3 明永冰川及其退却地区垂直气候特征与微生物生态 | 第30-33页 |
| 1.3 低温环境与低温微生物的特征与分布 | 第33-38页 |
| 1.3.1 低温微生物的生态及主要类群的研究现状 | 第35页 |
| 1.3.2 低温微生物适应性的分子机制的研究现状 | 第35-38页 |
| 1.4 细菌群落研究方法 | 第38-46页 |
| 1.4.1 纯培养法 | 第38-39页 |
| 1.4.2 细菌与噬菌体的多样性研究 | 第39-40页 |
| 1.4.3 基于细胞膜磷脂不饱和脂肪酸组成的细菌分类法 | 第40-41页 |
| 1.4.4 基于16S rDNA高变区序列分析的细菌分类法 | 第41-45页 |
| 1.4.5 基于宏基因组学的细菌群落分析法 | 第45-46页 |
| 1.5 冰川细菌多样性与环境中非生物因子的相关性研究 | 第46-47页 |
| 1.6 论文的研究意义、主要内容和技术路线 | 第47-51页 |
| 1.6.1 论文的研究意义和主要内容 | 第47-49页 |
| 1.6.2 技术路线 | 第49-51页 |
| 第二章 明永冰川低温细菌及噬菌体的分离与鉴定 | 第51-81页 |
| 2.1 纯培养法分离低温细菌 | 第52-70页 |
| 2.1.1 样品的采集及处理 | 第52-54页 |
| 2.1.2 分析方法 | 第54-57页 |
| 2.1.3 结果 | 第57-67页 |
| 2.1.4 讨论 | 第67-69页 |
| 2.1.5 小结 | 第69-70页 |
| 2.2 低温噬菌体的分离纯化与初步鉴定 | 第70-81页 |
| 2.2.1 低温噬菌体的分离与鉴定 | 第70-71页 |
| 2.2.2 低温噬菌体生物学特性研究 | 第71-72页 |
| 2.2.3 结果 | 第72-79页 |
| 2.2.4 讨论 | 第79-80页 |
| 2.2.5 小结 | 第80-81页 |
| 第三章 气相色谱法对低温细菌细胞膜磷脂不饱和脂肪酸的多样性研究 | 第81-93页 |
| 3.1 实验材料与分析方法 | 第82-83页 |
| 3.1.1 低温菌菌种来源 | 第82页 |
| 3.1.2 低温菌不饱和脂肪酸的甲酯衍生化 | 第82页 |
| 3.1.3 GC-MS分析条件 | 第82页 |
| 3.1.4 细菌不饱和脂肪酸分析聚类分析 | 第82-83页 |
| 3.2 结果 | 第83-90页 |
| 3.2.1 低温菌菌种信息 | 第83-85页 |
| 3.2.2 低温菌脂肪酸的气相色谱分析 | 第85-90页 |
| 3.3 讨论 | 第90-92页 |
| 3.4 小结 | 第92-93页 |
| 第四章 明永冰川不同气候带免培养细菌群落多样性研究 | 第93-121页 |
| 4.1 材料与方法 | 第94-98页 |
| 4.1.1 样品的采集 | 第94-95页 |
| 4.1.2 DNA的提取 | 第95页 |
| 4.1.3 PCR扩增16S rRNA基因V6高变区 | 第95-96页 |
| 4.1.4 物种分类和丰度分析 | 第96页 |
| 4.1.5 样品复杂度分析 | 第96-97页 |
| 4.1.6 样品间复杂度比较分析(n≥2) | 第97页 |
| 4.1.7 样品间复杂度差异主要因子分析(n≥3) | 第97页 |
| 4.1.8 不同样品物种组成聚类分析(n≥3) | 第97页 |
| 4.1.9 测序序列的系统发育分析 | 第97-98页 |
| 4.2 结果 | 第98-117页 |
| 4.2.0 16S rRNA基因V6高变区扩增结果 | 第98页 |
| 4.2.1 物种分类和丰度分析结果 | 第98-102页 |
| 4.2.2 明永冰川四个样品的后续多样性分析 | 第102-117页 |
| 4.3 讨论 | 第117-120页 |
| 4.4 小结 | 第120-121页 |
| 第五章 宏基因组学测序方法初步研究明永冰川地区细菌功能基因多样性 | 第121-136页 |
| 5.1 材料与方法 | 第122-124页 |
| 5.1.1 样品与DNA的提取 | 第122页 |
| 5.1.2 样品的DNA的测序 | 第122页 |
| 5.1.3 数据预处理 | 第122-123页 |
| 5.1.4 组装 | 第123页 |
| 5.1.5 基因预测 | 第123页 |
| 5.1.6 KEGG分析 | 第123-124页 |
| 5.1.7 eggnog分析 | 第124页 |
| 5.2 结果 | 第124-132页 |
| 5.3 讨论 | 第132-134页 |
| 5.4 小结 | 第134-136页 |
| 第六章 总结与展望 | 第136-140页 |
| 6.1 总结 | 第136-139页 |
| 6.2 展望 | 第139-140页 |
| 致谢 | 第140-141页 |
| 参考文献 | 第141-156页 |
| 附录A 攻读博士期间科研成果 | 第156-157页 |
| 附录B | 第157-160页 |
