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慢病毒介导的CDKs干扰对ApoB RNA编辑的影响

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-8页
符号说明第8-15页
第一部分 文献综述第15-27页
   ·RNA编辑的研究进展第15-19页
     ·RNA编辑的类型第15-16页
     ·锥体虫线粒体基因U的插入和去除第16-17页
     ·高等生物A到I的RNA编辑第17-18页
     ·高等生物C到U的RNA编辑第18-19页
   ·载脂蛋白B(ApoB)的研究进展第19-23页
     ·ApoB-100与ApoB-48在脂类中的代谢第19-20页
     ·ApoB-100 RNA的编辑序列第20-21页
     ·参与ApoB RNA编辑的相关酶第21-22页
     ·ApoB RNA编辑的调节机制第22页
     ·ApoB RNA编辑与疾病治疗第22-23页
   ·CDKs与细胞周期调控第23-24页
   ·RNAi技术第24-27页
第二部分 ApoB RNA编辑的慢病毒表达载体构建及其稳定株的筛选第27-39页
   ·实验材料第27-29页
     ·质粒菌株及细胞株第27页
     ·主要试剂第27-28页
     ·主要实验仪器、设备第28页
     ·要试剂的配置第28-29页
   ·实验方法第29-35页
     ·慢病毒表达载体pCSⅡ-DsRed-CAA-GFP-Neo~r的构建第29-32页
       ·感受态E.coli DH5 α的制备第29-30页
       ·质粒转化第30页
       ·质粒小量抽提第30页
       ·NheI、BamHI双酶切质粒第30-31页
       ·酶切产物的割胶回收第31页
       ·基因片段和载体片段的连接第31-32页
       ·连接产物的转化第32页
       ·质粒小量抽提第32页
       ·NheI、BamHI双酶切鉴定重组产物第32页
       ·质粒的大量制备第32页
     ·重组慢病毒的制备第32-34页
       ·HEK-293FT细胞培养第32-33页
       ·慢病毒的包装第33页
       ·病毒的收集与浓缩第33-34页
       ·病毒滴度的测定第34页
     ·Caco-2、CBRH-7919稳定株的建立第34-35页
       ·Caco-2、CBRH-7919细胞培养第34页
       ·G418最优浓度的筛选第34-35页
       ·慢病毒感染细胞第35页
       ·Caco-2、CBRH-7919稳定细胞系的筛选第35页
   ·实验结果第35-36页
     ·重组质粒pCSⅡ-DsRed-CAA-GFP-Neo~r酶切鉴定结果第35-36页
     ·Caco-2、CBRH-7919细胞株G418最优浓度的筛选结果第36页
     ·Caco-2、CBRH-7919稳定株筛选结果第36页
   ·讨论第36-37页
   ·小结第37-39页
第三部分 携带CDK1/CDK2-shRNA重组慢病毒载体的构建及功能鉴定第39-57页
   ·实验材料第39-40页
     ·质粒菌株及细胞株第39页
     ·主要试剂第39-40页
     ·主要试剂的配置第40页
   ·实验方法第40-50页
     ·慢病毒干扰载体pLK0.1-shRNA-puro的构建第40-44页
       ·质粒转化第40-41页
       ·质粒小量抽提第41页
       ·AgeI、EcoRI双酶切质粒pLK0.1-puro第41页
       ·酶切产物的割胶回收第41-42页
       ·siRNA序列的选择和合成第42页
       ·siRNA序列退火形成双链第42-43页
       ·siRNA双链和载体片段的连接及转化第43页
       ·质粒的小量抽提及鉴定第43-44页
     ·慢病毒的制备第44页
       ·RNAi质粒的大量制备第44页
       ·慢病毒的包装第44页
       ·病毒的收集与浓缩第44页
       ·慢病毒感染Caco-2、CBRH-7919细胞株第44页
     ·特异性的RNAi慢病毒载体的干扰功能鉴定第44-50页
       ·实时荧光qRT-PCR检测CDK1、CDK2 mRNA表达第45-48页
       ·Western Blot检测CDK1、CDK2蛋白的表达第48-50页
     ·统计学分析第50页
   ·实验结果第50-55页
     ·重组质粒pLK0.1-shRNA-puro的测序结果第50-51页
     ·Real-Time PCR CDK1、CDK2 mRNA表达的检测结果第51-54页
       ·RNA完整性鉴定结果第51-52页
       ·荧光实时定量PCR检测结果第52-54页
     ·Western Blot检测CDK1、CDK2蛋白表达的结果第54-55页
   ·讨论第55-56页
   ·小结第56-57页
第四部分 CDK1与CDK2干扰对ApoB RNA编辑的影响第57-71页
   ·实验材料第57页
     ·细胞株第57页
     ·实验病毒第57页
     ·主要试剂第57页
   ·实验方法第57-64页
     ·重组慢病毒感染稳定株细胞第57-58页
     ·共聚焦显微镜(LSCM)观察ApoB RNA编辑第58页
       ·样品准备第58页
       ·LSCM观察第58页
     ·流式细胞术(Flow Cytometry,FCM)检测细胞周期分布第58-59页
       ·样品准备第58-59页
       ·碘化丙啶(PI)染色第59页
       ·FCM上样检测第59页
     ·FCM检测ApoB RNA的编辑效率第59页
     ·测序法检测ApoB RNA的编辑效率第59-64页
       ·样品准备第60页
       ·总RNA的提取与纯化第60页
       ·cDNA的合成第60页
       ·含编辑位点序列的PCR合成第60-61页
       ·含多个编辑位点序列载体的构建第61-64页
   ·实验结果第64-68页
     ·LSCM观察CDK1与CDK2干扰对ApoB RNA编辑的影响第64-65页
     ·CDK1与CDK2干扰对细胞周期的影响第65-66页
     ·FCM分析CDK1与CDK2干扰对ApoB RNA编辑的影响第66-67页
     ·测序法分析CDK干扰对RNA编辑的影响第67-68页
   ·讨论第68-70页
   ·小结第70-71页
第五部分 结论第71-72页
参考文献第72-79页
致谢第79-81页
攻读学位期间取得的研究成果第81-85页

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