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一株1型单纯疱疹病毒参考株的建立及特性分析

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-8页
第一部分 1型单纯疱疹病毒的分离鉴定及增殖特性分析第8-23页
 1 前言第8-10页
 2 实验材料第10-12页
   ·细胞第10页
   ·引物序列第10页
   ·试剂及耗材第10-11页
   ·实验动物第11页
   ·仪器设备第11-12页
 3 实验方法第12-16页
   ·细胞培养第12页
   ·病毒分离第12-13页
   ·病毒蚀斑纯化第13页
   ·病毒PCR鉴定第13-15页
   ·病毒的电镜观察第15页
   ·病毒滴度测定第15页
   ·病毒在不同细胞增殖特性第15页
   ·病毒生长曲线测定第15页
   ·动物神经毒力实验第15-16页
 4 实验结果第16-21页
   ·病毒的噬斑纯化第16页
   ·病毒PCR检测第16-17页
   ·病毒电镜结果第17-18页
   ·病毒在不同细胞病变情况第18-19页
   ·病毒感染不同细胞生长曲线测定第19-20页
   ·动物神经毒力实验第20-21页
 5 实验讨论第21-23页
第二部分 低代次1型疱疹病毒全基因组测序及初步分析第23-51页
 1 前言第23-25页
 2 实验材料第25-30页
   ·病毒株和细胞第25页
   ·引物序列第25-29页
   ·主要参考序列第29-30页
   ·序列分析软件及在线分析系统第30页
 3 实验方法第30-34页
   ·病毒全基因组提取第30页
   ·基因组限制性片段长度多态性分析第30-31页
   ·病毒全基因组的二代测序第31页
   ·病毒全基因组的修补第31-33页
   ·病毒全基因组序列的组装及提交第33页
   ·病毒全基因组分析第33-34页
 4 实验结果第34-46页
   ·病毒基因组提取及限制性片段长度多态性分析第34-35页
   ·基因组Illumina测序结果第35页
   ·基因组的PCR缺口修补第35-37页
   ·病毒基因组基因预测第37页
   ·病毒基因组结构第37-39页
   ·病毒的点阵分析第39页
   ·进化树的构建第39-42页
   ·病毒基因组简单重复序列分析第42-46页
 5 实验讨论第46-51页
第三部分 基于CRISPR-Cas9技术的重组单纯疱疹病毒的构建第51-57页
 1 前言第51-52页
 2 实验材料第52页
   ·病毒株及细胞第52页
   ·质粒第52页
   ·引物序列第52页
 3 实验方法第52-53页
   ·细胞转染第52页
   ·病毒感染第52页
   ·病毒的噬斑纯化第52-53页
   ·PCR检测病毒TK基因第53页
 4 实验结果第53-55页
   ·Cas9诱导病毒基因组同源重组第53-54页
   ·重组病毒的噬斑纯化及TK基因检测第54-55页
 5 实验讨论第55-57页
第四部分 HSV1与端粒长度变化的细胞模型建立的初步研究第57-65页
 1 前言第57-58页
 2 实验材料第58页
   ·病毒株和细胞第58页
   ·引物序列第58页
 3 实验方法第58-59页
   ·病毒感染第58页
   ·病毒感染后细胞端粒长度测定第58-59页
 4 实验结果第59-63页
   ·端粒长度PCR产物琼脂糖凝胶电泳第59-60页
   ·标准曲线绘制第60-61页
   ·KMB17随传代次数增加端粒缩短第61页
   ·病毒感染对细胞端粒影响第61-63页
 5 实验讨论第63-65页
实验小结第65-66页
参考文献第66-71页
附录Ⅰ HSV1-ZW6全基因组序列编码基因列表第71-77页
附录Ⅱ 重组荧光病毒测序第77-78页
附录Ⅲ 英文缩写词表第78-79页
附录Ⅳ 主要溶液及培养基配制第79-82页
致谢第82-83页
研究生简历第83-84页

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