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黄顶菊根相关细菌的多样性研究

摘要第1-5页
Abstract第5-9页
第1章 绪论第9-14页
   ·根相关微生物的概念第9页
   ·根相关微生物的研究第9-10页
     ·根相关微生物的分离方法第9-10页
     ·根相关微生物的群落结构研究方法第10页
   ·黄顶菊及其研究现状第10-13页
     ·生物学特性第11页
     ·黄顶菊逆境适应性第11页
     ·黄顶菊防治第11-12页
     ·黄顶菊化感作用第12页
     ·黄顶菊与土壤微生物互作第12-13页
   ·本论文立题依据和研究内容第13-14页
第2章 黄顶菊生长初期可培养根相关细菌的多样性第14-45页
   ·材料与方法第14-16页
     ·植物材料第14页
     ·分离培养基第14页
     ·主要试剂和仪器第14页
     ·样品的预处理第14-15页
     ·黄顶菊根相关细菌的分离与纯化第15页
     ·黄顶菊根相关细菌的DNA提取第15-16页
     ·黄顶菊根相关细菌的 16SrRNA基因序列测定与多样性分析第16页
   ·结果第16-42页
     ·黄顶菊三个生长时期可培养根相关细菌的种群数量第16-17页
     ·黄顶菊生长初期可培养根相关细菌 16SrRNA基因片段的扩增第17-18页
     ·黄顶菊生长初期可培养根内生细菌 16SrRNA基因系统发育分析及多样性分析第18-23页
     ·黄顶菊生长初期可培养根面细菌 16SrRNA基因系统发育分析及多样性分析第23-32页
     ·黄顶菊生长初期可培养根际细菌 16S r RNA 基因系统发育分析及多样性分析第32-41页
     ·黄顶菊生长初期可培养根内、根面及根际细菌种群的对比分析第41-42页
   ·讨论第42-45页
第3章 高通量测序法对黄顶菊根相关细菌多样性的研究第45-60页
   ·样品的处理及送测第45页
   ·高通量测序第45-48页
     ·高通量测序方法第45-46页
     ·数据处理及分类信息学和群落结构分析第46-48页
   ·结果第48-57页
     ·群落组成分析第49-51页
     ·Alpha多样性指数(α-diversity)第51页
     ·稀释曲线(Rarefaction Curve)第51-53页
     ·Rank-Abundance曲线第53页
     ·NMDS及组间差异性分析第53-54页
     ·样品聚类分析第54页
     ·群落Heatmap图第54-56页
     ·Venn图第56-57页
   ·讨论第57-60页
结论第60-61页
参考文献第61-67页
致谢第67-68页
攻读学位期间取得的科研成果第68页

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