| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第1章 引言 | 第9-11页 |
| 第2章 蛋白质二级质谱及其鉴定算法 | 第11-17页 |
| ·三种鉴定方法的阐述 | 第12-15页 |
| ·Sequest 鉴定算法 | 第12-13页 |
| ·Mascot 鉴定算法 | 第13页 |
| ·ProVerb 鉴定算法 | 第13-15页 |
| ·FPR假阳性率 | 第15-17页 |
| 第3章 二级质谱鉴定算法 Dispec | 第17-37页 |
| ·Dispec 鉴定算法的重要过程 | 第18-26页 |
| ·肽段数据库和肽段数据索引 | 第18-21页 |
| ·候选肽段的选取 | 第21-22页 |
| ·去同位素 | 第22页 |
| ·选取有效峰 | 第22页 |
| ·产生候选肽段理论图谱 | 第22-23页 |
| ·候选肽段标记图谱 DiLS | 第23-24页 |
| ·统计分析三种区分度 | 第24-26页 |
| ·Dispec 鉴定算法的打分函数 | 第26-28页 |
| ·匹配碎片离子打分 | 第26-27页 |
| ·连续匹配打分 | 第27页 |
| ·b，y 离子区分度打分 | 第27-28页 |
| ·Dispec 鉴定算法的补充技术 | 第28-30页 |
| ·质谱数据库 | 第28-29页 |
| ·质谱数据库搜索 | 第29页 |
| ·采用 FDR 质量控制 | 第29-30页 |
| ·Dispec 与 Mascot 和 Sequest 的比较 | 第30-35页 |
| ·Mascot、Sequest 和 Dispec 三种算法在三种数据集下鉴定的肽段数和图谱量 | 第30-34页 |
| ·Mascot、Sequest 和 Dispec 三种算法的高可信肽段的鉴定 | 第34-35页 |
| ·结语 | 第35-37页 |
| 第4章 总结与展望 | 第37-39页 |
| 参考文献 | 第39-43页 |
| 在学期间发表的学术成果及获奖情况 | 第43-45页 |
| 致谢 | 第45页 |
