基于注释信息的基因芯片数据分析
| 缩略语表 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-11页 |
| 第1章 前言 | 第11-17页 |
| ·基因芯片技术的起源和发展 | 第11-12页 |
| ·基因芯片的原理和分类 | 第12-14页 |
| ·基因芯片的应用 | 第14-15页 |
| ·本文的结构 | 第15-17页 |
| 第2章 基因芯片数据预处理和线性模型 | 第17-23页 |
| ·图像分析 | 第17-18页 |
| ·数据预处理和标准化 | 第18-19页 |
| ·基因芯片实验设计与线性模型 | 第19-22页 |
| ·小结 | 第22-23页 |
| 第3章 基因选择算法评估 | 第23-37页 |
| ·基因芯片数据集 | 第23-24页 |
| ·基因选择算法简介 | 第24-27页 |
| ·基因选择算法评估 | 第27-36页 |
| ·小结 | 第36-37页 |
| 第4章 基于注释信息的经验贝叶斯算法改进 | 第37-55页 |
| ·Limma算法介绍 | 第37-39页 |
| ·Limma的改进算法：Deam | 第39-45页 |
| ·检验算法的数据集 | 第45-47页 |
| ·Deam与Limma的性能比较 | 第47-52页 |
| ·小结 | 第52-55页 |
| 第5章 Deam算法的R语言和Web实现 | 第55-61页 |
| ·Deam算法的R语言实现 | 第55-58页 |
| ·Deam算法的Web实现 | 第58-60页 |
| ·小结 | 第60-61页 |
| 第6章 基于注释信息的基因聚类算法评估 | 第61-77页 |
| ·基因芯片数据集 | 第62-63页 |
| ·基于注释信息的基因聚类算法评估 | 第63-71页 |
| ·主成分分析在基因芯片聚类算法中的效果评估 | 第71-76页 |
| ·小结 | 第76-77页 |
| 第7章 总结和展望 | 第77-81页 |
| 参考文献 | 第81-89页 |
| 附录 | 第89-98页 |
| 急性淋巴细胞癌数据集中的前50个差异表达基因 | 第89-92页 |
| 前列腺癌数据集中的前50个差异表达基因 | 第92-94页 |
| 肺癌数据集中的前50个差异表达基因 | 第94-98页 |
| 致谢 | 第98-99页 |
| 作者在学期间取得的主要成果 | 第99-100页 |
