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基于高通量测序的刺参白化发生和子代体色分离研究

致谢第1-6页
摘要第6-8页
ABSTRACT第8-11页
目录第11-13页
前言第13-15页
第一章 动物白化和体色分离研究进展第15-35页
   ·动物白化研究进展第15-23页
     ·皮肤缺乏黑色素的沉积是动物白化表征第15-17页
     ·动物白化发生分子机理研究进展第17-23页
   ·动物体色分离研究进展第23-24页
   ·基于高通量测序技术的转录组研究进展第24-31页
     ·主流高通量测序平台第24-25页
     ·454 测序技术第25-28页
     ·基于 RNA 测序(RNA-Seq)的基因转录调控研究进展第28-31页
   ·本章小结第31-32页
   ·本研究目的和意义、技术路线和预期目标第32-35页
     ·研究目的和意义第32-33页
     ·研究思路第33页
     ·预期目标第33-35页
第二章 基于 454 测序技术的刺参白化发生机理研究第35-47页
   ·前言第35页
   ·材料与方法第35-39页
     ·实验材料第35-36页
     ·主要化学试剂和仪器设备第36页
     ·实验方法第36-39页
   ·研究结果第39-44页
     ·454 测得的白刺参和青刺参转录组数据第39-41页
     ·白刺参和青刺参转录组的 GO 分析第41-43页
     ·黑色素合成相关候选基因的筛选第43-44页
   ·讨论第44-45页
   ·本章小结第45-47页
第三章 白刺参子代幼参和普通幼参转录谱差异研究第47-82页
   ·前言第47-48页
   ·材料与方法第48-58页
     ·实验材料第48页
     ·主要化学试剂和仪器设备第48-49页
     ·实验方法第49-58页
   ·研究结果第58-73页
     ·白色幼参、体色分离幼参和同期青刺参体壁组织的 RNA-Seq 转录谱特征第58-59页
     ·ALB 库、SEP 库和 CON 库的 RNA-Seq 测序饱和度第59-60页
     ·ALB 库、SEP 库和 CON 库的测序随机性第60-61页
     ·白色幼参和对照青刺参基因转录水平的对比分析第61-67页
     ·体色分离幼参和对照青刺参基因转录水平的对比分析第67-73页
   ·讨论第73-80页
     ·白色幼参体壁相对于普通幼参的 DEGs 和信号通路第74-77页
     ·体色幼参体壁相对于普通幼参的 DEGs 和信号通路第77-80页
   ·本章小结第80-82页
第四章 白刺参体色分离子代幼参基因表达差异研究第82-95页
   ·前言第82页
   ·材料与方法第82-86页
     ·实验材料第82-83页
     ·主要化学试剂和仪器设备第83页
     ·实验方法第83-86页
   ·研究结果第86-92页
     ·体色分离幼参和白色幼参体壁 RNA-Seq 转录谱特征第86页
     ·SEP 库和 CON 库的 RNA-Seq 测序饱和度第86-87页
     ·SEP 库和 ALB 库的测序随机性第87页
     ·差异表达基因的筛选第87-89页
     ·差异表达基因的 RT-PCR 验证第89-90页
     ·GO 分析第90-91页
     ·信号通路富集分析第91-92页
   ·讨论第92-94页
   ·本章小结第94-95页
第五章 刺参黑色素合成调控基因结构功能分析第95-108页
   ·前言第95页
   ·材料与方法第95-101页
     ·实验材料第95页
     ·主要实验试剂和仪器设备第95-96页
     ·RACE 扩增引物第96页
     ·实验方法第96-101页
   ·实验结果第101-106页
     ·刺参 CREB 基因的 cDNA 克隆及序列分析第101-103页
     ·刺参 AjCREB 蛋白的同源性及系统进化分析第103-106页
     ·AjCREB 蛋白亚细胞定位预测第106页
   ·讨论第106-107页
   ·本章小结第107-108页
第六章 总结与展望第108-113页
   ·研究总结第108-110页
   ·创新性第110页
   ·存在的问题第110页
   ·研究展望第110-113页
参考文献第113-127页
作者简历第127-129页
博士期间撰写及发表文章情况第129页

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