致谢 | 第1-6页 |
摘要 | 第6-8页 |
ABSTRACT | 第8-11页 |
目录 | 第11-13页 |
前言 | 第13-15页 |
第一章 动物白化和体色分离研究进展 | 第15-35页 |
·动物白化研究进展 | 第15-23页 |
·皮肤缺乏黑色素的沉积是动物白化表征 | 第15-17页 |
·动物白化发生分子机理研究进展 | 第17-23页 |
·动物体色分离研究进展 | 第23-24页 |
·基于高通量测序技术的转录组研究进展 | 第24-31页 |
·主流高通量测序平台 | 第24-25页 |
·454 测序技术 | 第25-28页 |
·基于 RNA 测序(RNA-Seq)的基因转录调控研究进展 | 第28-31页 |
·本章小结 | 第31-32页 |
·本研究目的和意义、技术路线和预期目标 | 第32-35页 |
·研究目的和意义 | 第32-33页 |
·研究思路 | 第33页 |
·预期目标 | 第33-35页 |
第二章 基于 454 测序技术的刺参白化发生机理研究 | 第35-47页 |
·前言 | 第35页 |
·材料与方法 | 第35-39页 |
·实验材料 | 第35-36页 |
·主要化学试剂和仪器设备 | 第36页 |
·实验方法 | 第36-39页 |
·研究结果 | 第39-44页 |
·454 测得的白刺参和青刺参转录组数据 | 第39-41页 |
·白刺参和青刺参转录组的 GO 分析 | 第41-43页 |
·黑色素合成相关候选基因的筛选 | 第43-44页 |
·讨论 | 第44-45页 |
·本章小结 | 第45-47页 |
第三章 白刺参子代幼参和普通幼参转录谱差异研究 | 第47-82页 |
·前言 | 第47-48页 |
·材料与方法 | 第48-58页 |
·实验材料 | 第48页 |
·主要化学试剂和仪器设备 | 第48-49页 |
·实验方法 | 第49-58页 |
·研究结果 | 第58-73页 |
·白色幼参、体色分离幼参和同期青刺参体壁组织的 RNA-Seq 转录谱特征 | 第58-59页 |
·ALB 库、SEP 库和 CON 库的 RNA-Seq 测序饱和度 | 第59-60页 |
·ALB 库、SEP 库和 CON 库的测序随机性 | 第60-61页 |
·白色幼参和对照青刺参基因转录水平的对比分析 | 第61-67页 |
·体色分离幼参和对照青刺参基因转录水平的对比分析 | 第67-73页 |
·讨论 | 第73-80页 |
·白色幼参体壁相对于普通幼参的 DEGs 和信号通路 | 第74-77页 |
·体色幼参体壁相对于普通幼参的 DEGs 和信号通路 | 第77-80页 |
·本章小结 | 第80-82页 |
第四章 白刺参体色分离子代幼参基因表达差异研究 | 第82-95页 |
·前言 | 第82页 |
·材料与方法 | 第82-86页 |
·实验材料 | 第82-83页 |
·主要化学试剂和仪器设备 | 第83页 |
·实验方法 | 第83-86页 |
·研究结果 | 第86-92页 |
·体色分离幼参和白色幼参体壁 RNA-Seq 转录谱特征 | 第86页 |
·SEP 库和 CON 库的 RNA-Seq 测序饱和度 | 第86-87页 |
·SEP 库和 ALB 库的测序随机性 | 第87页 |
·差异表达基因的筛选 | 第87-89页 |
·差异表达基因的 RT-PCR 验证 | 第89-90页 |
·GO 分析 | 第90-91页 |
·信号通路富集分析 | 第91-92页 |
·讨论 | 第92-94页 |
·本章小结 | 第94-95页 |
第五章 刺参黑色素合成调控基因结构功能分析 | 第95-108页 |
·前言 | 第95页 |
·材料与方法 | 第95-101页 |
·实验材料 | 第95页 |
·主要实验试剂和仪器设备 | 第95-96页 |
·RACE 扩增引物 | 第96页 |
·实验方法 | 第96-101页 |
·实验结果 | 第101-106页 |
·刺参 CREB 基因的 cDNA 克隆及序列分析 | 第101-103页 |
·刺参 AjCREB 蛋白的同源性及系统进化分析 | 第103-106页 |
·AjCREB 蛋白亚细胞定位预测 | 第106页 |
·讨论 | 第106-107页 |
·本章小结 | 第107-108页 |
第六章 总结与展望 | 第108-113页 |
·研究总结 | 第108-110页 |
·创新性 | 第110页 |
·存在的问题 | 第110页 |
·研究展望 | 第110-113页 |
参考文献 | 第113-127页 |
作者简历 | 第127-129页 |
博士期间撰写及发表文章情况 | 第129页 |