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两品种鸡生长模型探析及PGC-1α基因与肉品质及其相关基因表达的关联分析

摘要第1-7页
Abstract第7-12页
目录第12-16页
表目录第16-17页
图目录第17-19页
第1章 绪论第19-31页
 1 鸡的肉品质第19-20页
   ·肌内脂肪含量第19页
   ·嫩度第19-20页
   ·系水力第20页
 2 动物生长与发育规律第20-21页
   ·动物的生长发育第20-21页
   ·生长曲线拟合第21页
 3 肌纤维类型的研究进展第21-23页
   ·肌纤维类型的分化及类型间的转化第21-23页
   ·肌纤维类型与肉品质的关系第23页
   ·与肌纤维类型相关的基因第23页
 4 PGC-1α基因的研究进展第23-27页
   ·PGC-1α基因的发现第23-24页
   ·PGC-1α基因的结构第24页
   ·PGC-α的作用机制与生物学功能第24-26页
   ·PGC-1α基因对肌纤维的影响第26页
   ·PGC-1α基因对肉品质的影响第26-27页
 5 单核苷酸多态性(SNP)第27-28页
   ·SNP概述第27页
   ·SNP的应用第27-28页
 6 实时荧光定量技术第28-29页
 7 研究目的和意义第29-31页
第2章 隐性白羽鸡与清远麻鸡的生长发育规律第31-39页
 1 材料与方法第31页
   ·试验鸡群第31页
   ·仪器设备第31页
   ·数据处理第31页
 2 结果与分析第31-37页
   ·生长曲线拟合第31-37页
     ·体重的生长曲线拟合第31-34页
     ·胫长的生长曲线拟合第34-37页
   ·体重和胫长的关联分析第37页
 3 讨论第37-39页
   ·生长曲线的拟合第37-38页
   ·体重和胫长的相关第38-39页
第3章 PGC-1α基因的多态性及与鸡肉品质的关联性分析第39-71页
 1 材料与方法第39-48页
   ·试验鸡群和样本采集第39页
     ·血样采集第39页
     ·肌肉组织采集第39页
   ·仪器设备与试剂第39-40页
     ·仪器设备第39-40页
     ·试验所用试剂第40页
   ·肉品质的测定第40页
     ·胸肌肌内脂肪含量的测定第40页
     ·胸肌剪切力的测定第40页
     ·胸肌系水力的测定第40页
   ·基因组DNA的提取第40-41页
     ·酚/氯仿抽提法第40-41页
     ·DNA的质量检测第41页
   ·常规PCR的条件优化与扩增第41-43页
     ·引物设计第41-43页
     ·PCR反应条件优化第43页
     ·常规PCR第43页
   ·SSCP分析第43-45页
     ·聚丙烯酰胺凝胶的制作第43-44页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳第44页
     ·凝胶染色第44-45页
     ·带型判定第45页
     ·扩增产物测序并比对第45页
   ·LDR分析第45-47页
     ·引物和探针设计第46页
     ·多重PCR第46-47页
     ·LDR反应第47页
     ·测序电泳并判型第47页
   ·数据处理第47-48页
 2 结果与分析第48-67页
   ·肉质指标测定结果第48-49页
   ·DNA的提取质量鉴定第49页
   ·PGC-1α基因的多态性检测结果第49-59页
     ·PCR-SSCP结果第49页
     ·PCR测序结果第49-56页
     ·PCR-LDR结果第56-57页
     ·多态性位点的变异情况第57-59页
   ·多态性位点的遗传分析第59-61页
     ·多态性位点的卡方检验第59页
     ·多态信息含量第59-60页
     ·遗传相似性系数与遗传距离第60-61页
   ·不同基因型与肉品质的关联分析第61-67页
     ·SNP 0位点对肉品质的影响第61-62页
     ·SNP 1位点对肉品质的影响第62-63页
     ·SNP 2位点对肉品质的影响第63-64页
     ·SNP 3位点对肉品质的影响第64页
     ·SNP 4-1位点对肉品质的影响第64页
     ·SNP 4-2位点对肉品质的影响第64页
     ·SNP 5对肉品质的影响第64-65页
     ·SNP 6位点对肉品质的影响第65页
     ·SNP 8位点对肉品质的影响第65页
     ·SNP 13对肉品质的影响第65-66页
     ·SNP 14对肉品质的影响第66页
     ·SNP 15对肉品质的影响第66-67页
 3 讨论第67-71页
   ·不同品种、性别肉质的比较第67-68页
   ·PGC-1α基因SNP位点筛查第68页
   ·遗传多样性参数第68页
   ·SNP位点与肉品质的关联第68-71页
     ·突变效应的机理初探第68-69页
     ·突变与肉质关联的统计方法第69页
     ·突变产生基因型效应第69-71页
第4章 PGC-1α基因与FWM、FRM和SM表达量的分析第71-94页
 1 材料与方法第71-78页
   ·试验鸡群和样本采集第71页
   ·仪器设备与试剂第71-72页
     ·仪器设备第71页
     ·试验所用试剂第71-72页
   ·肌肉组织总RNA的提取第72-74页
     ·RNA提取前的准备工作第72页
     ·Trizol法提取总RNA第72-73页
     ·RNA的质量检测第73-74页
   ·cDNA第一链的合成第74-75页
   ·基因表达的定量实验第75-77页
     ·引物的设计第75页
     ·反应条件的优化第75-76页
     ·实时荧光定量PCR第76-77页
   ·数据处理第77-78页
     ·目的基因相对表达量的计算第77页
     ·各基因表达量统计学分析第77-78页
 2 结果与分析第78-92页
   ·组织总RNA的提取质量鉴定结果第78页
   ·内参基因与目的基因的标准曲线及溶解曲线第78-83页
   ·PGC-1α基因在三种肌肉组织中表达量的变化规律第83-87页
     ·PGC-1α基因在心肌中的表达变化规律第84-85页
     ·PGC-1α基因在胸肌中的表达变化规律第85-86页
     ·PGC-1α基因在腓肠肌中的表达变化规律第86-87页
   ·腓肠肌组织中FWM、FRM和SM基因表达量的变化规律第87-91页
     ·腓肠肌组织中FWM基因的表达变化规律第88-89页
     ·腓肠肌组织中FRM基因的表达变化规律第89-90页
     ·腓肠肌组织中SM基因的表达变化规律第90-91页
   ·腓肠肌中PGC-1α基因与FWM、FRM和SM基因的相关分析第91-92页
 3 讨论第92-94页
   ·内参基因的选择第92页
   ·荧光定量引物的设计第92-93页
   ·PGC-1α基因与FWM、FRM、SM基因的表达变化第93页
   ·PGC-1α基因与FWM、FRM和SM基因表达的相关性第93-94页
第5章 全文结论第94-96页
参考文献第96-102页
致谢第102-103页
作者简介第103页
攻读学位期间发表的学术论文第103-104页

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