| 第一部分：综述 | 第1-41页 |
| 表面加强激光解吸／电离飞行时间质谱技术及其在肿瘤研究中的应用 | 第25-41页 |
| 1．引言 | 第25-26页 |
| 2．SELDI-TOF-MS蛋白质芯片系统基本构成 | 第26页 |
| 3．SELDI-TOF-MS蛋白质芯片系统工作原理 | 第26-28页 |
| 4．蛋白质的鉴定 | 第28-29页 |
| 5．SELDE-TOF-MS蛋白质芯片技术与其他蛋白质检测技术的比较 | 第29-30页 |
| 6．SELDI-TOF-MS蛋白质芯片技术在癌症研究中的应用 | 第30-33页 |
| 7．问题与展望 | 第33-35页 |
| 8．参考文献 | 第35-41页 |
| 第二部分：论文 | 第41-229页 |
| 河南高低发区食管／贲门癌及癌前病变患者血清蛋白质质谱变化研究 | 第41-229页 |
| 1．引言 | 第41-44页 |
| 2．材料与方法 | 第44-51页 |
| 2．1 材料 | 第44-47页 |
| 2．2 研究方法 | 第47-51页 |
| 3．结果： | 第51-94页 |
| 3．1 高发区EC及其癌前病变患者血清蛋白质质谱检测 | 第51-64页 |
| 3．2 高发区GCA及其癌前病变患者血清蛋白质质谱检测 | 第64-80页 |
| 3．3 低发区正常和癌前病变人群血清蛋白质质谱变化结果 | 第80-84页 |
| 3．4 高／低发区正常及相关病变人群血清蛋白质质谱变化结果比较 | 第84-90页 |
| 3．5 食管／贲门癌及其癌前病变患者血清分类变量蛋白质在高低发区各病变人群中变化的综合分析 | 第90-94页 |
| 4．讨论 | 第94-117页 |
| 4．1 实验技术与方法 | 第94-97页 |
| 4．2 高发区EC及癌前病变患者血清蛋白质质谱分析 | 第97-101页 |
| 4．3 高发区GCA及癌前病变患者血清蛋白质质谱分析 | 第101-106页 |
| 4．4 低发区正常和癌前病变人群血清蛋白质质谱变化及与高发区相关人群的比较 | 第106-109页 |
| 4．5 高发区食管／贲门癌及其癌前病变相关的血清分类变量蛋白质在各病变人群表达变化的综合分析 | 第109-117页 |
| 5．小结 | 第117-121页 |
| 5．1 高/低发区各组别决策树分类模型的建立及验证 | 第117-119页 |
| 5．2 高发区食管／贲门癌及其癌前病变相关的各血清分类蛋白质在各病变人群中变化的综合分析 | 第119-121页 |
| 6．创新点 | 第121-123页 |
| 7．参考文献 | 第123-132页 |
| 8．附表 | 第132-180页 |
| 表2．1 诊断资料2×2四格表 | 第132-133页 |
| 表3．1．1 高发区NOR和BCH组表达显著变化的56种蛋白质质谱峰值比较 | 第133-134页 |
| 表3．1．2 高发区NOR和EDYS组表达显著变化的54种蛋白质谱峰比较 | 第134-136页 |
| 表3．1．3 高发区NOR和EC组表达显著变化的74种蛋白质质谱峰值比较 | 第136-138页 |
| 表3．1．4 高发区BCH和EC组表达显著变化的75种蛋白质谱峰值比较 | 第138-140页 |
| 表3．1．5 高发区EDYS和EC组表达显著变化的102种蛋白质谱峰比较 | 第140-142页 |
| 表3．1．6 高发区BCH和EDYS组表达显著变化的73种蛋白质质谱峰值比较 | 第142-144页 |
| 表3．1．7 高发区ECA和ECB组差异显著的43种血清蛋白质质谱峰值比较 | 第144-145页 |
| 表3．1．8 高发区NOR和BCH组分类变量及替代蛋白质的分类价值 | 第145-146页 |
| 表3．1．9 高发区NOR和BCH组决策树分类模型分类结果 | 第146页 |
| 表3．1．10 高发区NOR和EDYS组分类变量及替代蛋白质的分类价值 | 第146页 |
| 表3．1．11 高发区NOR和EDYS组决策树分类模型分类结果 | 第146-147页 |
| 表3．1．12 高发区NOR和EC组分类变量及其替代蛋白质的分类价值 | 第147页 |
| 表3．1．13 高发区NOR和EC组决策树分类模型的分类结果 | 第147页 |
| 表3．1．14 高发区BCH和EC组分类变量及替代蛋白质的分类价值 | 第147-148页 |
| 表3．1．15 高发区BCH和EC组决策树分类模型的分类结果(BCH为对照组) | 第148页 |
| 表3．1．16 高发区EDYS和EC组分类变量及替代蛋白质的分类价值 | 第148-149页 |
| 表3．1．17 高发区EDYS和EC组决策树分类模型的分类结果(EDYS为对照组) | 第149页 |
| 表3．1．18 高发区BCH和EDYS组分类变量及替代蛋白质的分类价值 | 第149页 |
| 表3．1．19 高发区BCH和EDYS组决策树分类模型分类结果(BCH为对照组) | 第149-150页 |
| 表3．1．20 高发区ECA和ECB组分类变量及替代蛋白质的分类价值 | 第150页 |
| 表3．1．21 高发区ECA和ECB组决策树分类模型分类结果(ECA为对照组) | 第150-151页 |
| 表3．2．1 高发区NOR和CAG组表达显著变化的68种蛋白质质谱峰值比较 | 第151-152页 |
| 表3．2．2 高发区NOR和GDYS组表达显著变化的43种蛋白质质谱峰值比较 | 第152-154页 |
| 表3．2．3 高发区NOR和GCA组中表达显著变化的48种蛋白质质谱峰值比较 | 第154-155页 |
| 表3．2．4 高发区CAG和GCA组中表达显著变化的33种蛋白质质谱峰值比较 | 第155-156页 |
| 表3．2．5 高发区GDYS和GCA组中表达显著变化的78种蛋白质质谱峰值比较 | 第156-158页 |
| 表3．2．6 高发区CAG和GDYS组中表达显著变化的46种蛋白质质谱峰值比较 | 第158-159页 |
| 表3．2．7 高发区GCAA和GCAB组表达显著变化的20种蛋白质质谱峰值比较 | 第159-160页 |
| 表3．2．8 高发区NOR和CAG组分类变量及其替代蛋白质的分类价值 | 第160页 |
| 表3．2．9 高发区NOR和CAG组决策树分类模型的分类结果 | 第160页 |
| 表3．2．10 高发区NOR和GDYS组分类变量及替代蛋白质的分类价值 | 第160-161页 |
| 表3．2．11 高发区决策树分类模型对NOR和GDYS组人群的分类结果分析 | 第161页 |
| 表3．2．12 高发区NOR和GCA组分类变量及替代蛋白质的分类价值 | 第161页 |
| 表3．2．13 高发区NOR和GCA组决策树分类模型分类结果 | 第161-162页 |
| 表3．2．14 高发区CAG和GCA组分类变量及其替代蛋白质的分类价值 | 第162-163页 |
| 表3．2．15 高发区CAG和GCA组决策树分类模型分类结果(CAG为对照) | 第163页 |
| 表3．2．16 高发区GDYS和GCA组分类变量及替代蛋白质的分类价值 | 第163页 |
| 表3．2．17 高发区GDYS和GCA组决策树分类模型分类结果(GDYS为对照) | 第163-164页 |
| 表3．2．18 高发区CAG和GDYS组分类变量及其替代蛋白质的分类价值 | 第164页 |
| 表3．2．19 高发区CAG和GDYS组决策树分类模型的分类结果分析(CAG为对照) | 第164-165页 |
| 表3．2．20 高发区GCAA和GCAB组分类变量及其替代蛋白质的分类价值 | 第165页 |
| 表3．2．21 决策树分类模型对GCAA和GCAB组人群分类结果分析(GCAA为对照)141 | 第165-166页 |
| 表3．3．1 低发区LNOR和LBCH组表达显著变化的37种蛋白质质谱峰值比较 | 第166-167页 |
| 表3．3．2 低发区LNOR和LDYS组表达显著变化的7种蛋白质质谱峰值比较 | 第167页 |
| 表3．3．3 低发区LNOR和LCAG组表达显著变化的17种蛋白质质谱峰值比较 | 第167-168页 |
| 表3．3．4 低发区LNOR和LBCH组分类变量及其替代蛋白质的分类价值 | 第168页 |
| 表3．3．5 低发区LNOR和LBCH组决策树分类模型的分类结果 | 第168页 |
| 表3．3．6 低发区LNOR和LDYS组分类变量及其替代蛋白质的分类价值 | 第168-169页 |
| 表3．3．7 低发区LNOR和LDYS组决策树分类模型的分类结果 | 第169页 |
| 表3．4．1 高低发区HNOR和LNOR组中表达显著变化的49种蛋白质谱峰比较 | 第169-170页 |
| 表3．4．2 高低发区BCH对比组中表达显著变化的35种蛋白质质谱峰值比较 | 第170-171页 |
| 表3．4．3 高低发区CAG对比组中表达显著变化的24种蛋白质质谱峰值比较 | 第171-172页 |
| 表3．4．4 高低发区HNOR和LNOR组分类变量及其替代蛋白质的分类价值 | 第172-173页 |
| 表3．4．5 决策树分类模型对高低发区NOR对比组的分类结果分析(LNOR为对照) | 第173页 |
| 表3．4．6 高低发区HBCH和LBCH组分类变量及其替代蛋白质的分类价值 | 第173页 |
| 表3．4．7 高低发区BCH对比组决策树分类模型分类结果分析(LBCH为对照) | 第173-174页 |
| 表3．4．8 HCAG和LCAG组分类变量及其替代蛋白质的分类价值 | 第174页 |
| 表3．4．9 决策树分类模型对HCAG和LCAG组分类结果分析(LCAG为对照) | 第174-175页 |
| 表3．5．1 食管／贲门癌相关分类蛋白质M15957．1 4(M15953．4 )在各组中的表达 | 第175页 |
| 表3．5．2 EC和CAG相关分类蛋白M2942．1 5的在各组病变人群中的表达 | 第175-176页 |
| 表3．5．3 GCA相关分类蛋白质M7944．5 7的在各组病变人群中的表达 | 第176页 |
| 表3．5．4 EDYS相关分类蛋白M13765．9 的在各病变中的表达 | 第176-177页 |
| 表3．5．5 GDYS相关分类蛋白质M3894．01的在各病变中的表达 | 第177页 |
| 表3．5．6 食管／贲门DYS分类变量替代蛋白质M13987．0的在各病变中的表达 | 第177-178页 |
| 表3．5．7 高发区BCH相关分类蛋白质M9306．6 1在食管相关病变人群中表达 | 第178-179页 |
| 表3．5．8 高发区CAG相关分类蛋白质M33316．6 在相关病变人群中的表达 | 第179页 |
| 表3．5．9 EC手术相关蛋白质M7988在相关病变中的表达变化 | 第179-180页 |
| 9．附图： | 第180-228页 |
| 图2．1 灵敏度、特异度、漏诊率、误诊率之间关系 | 第180页 |
| 图2．2 SELDI-TOF-MS工作原理图 | 第180-181页 |
| 图2．3 决策树算法总体框架图 | 第181页 |
| 图2．4 BPS和常规统计学应用比较 | 第181-182页 |
| 图2．5 10倍交叉验证时样本分配及验证示意图 | 第182页 |
| 图2．6 经交叉验证后的得到的最佳决策树分类模型图示 | 第182-183页 |
| 图3．1．1 BCH和NOR组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 | 第183页 |
| 图3．1．2 EDYS和NOR组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 | 第183页 |
| 图3．1．3 EC和NOR组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 | 第183-184页 |
| 图3．1．4 BCH和EC组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 | 第184页 |
| 图3．1．5 EC和EDYS组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 | 第184页 |
| 图3．1．6 BCH和EDYS组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 | 第184-185页 |
| 图3．1．7 食管癌手术前后组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 | 第185页 |
| 图3．1．8 高发区NOR和BCH组决策树不同终结点错误率比较：2个终结点时测试组错误率最低 | 第185页 |
| 图3．1．9 高发区NOR和BCH组决策树分类模型图 | 第185-186页 |
| 图3．1．10 高发区BCH和NOR组分类变量蛋白质表达的质谱图及模拟胶图 | 第186页 |
| 图3．1．11 高发区NOR和EDYS组决策树不同终结点错误率比较：2个终结点测试组错误率最低 | 第186-187页 |
| 图3．1．12 高发区NOR和EDYS组决策树分类模型图 | 第187页 |
| 图3．1．13 高发区NOR和EDYS组分类变量蛋白质表达的质谱图及模拟胶图 | 第187-188页 |
| 图3．1．14 高发区NOR和EC组决策树不同终结点时错误率的比较：3个终结点时测试组的分类错误率最低 | 第188页 |
| 图3．1．15 高发区NOR和EC组分类变量蛋白质表达的质谱图及模拟胶图 | 第188-189页 |
| 图3．1．16 高发区NOR和EC组决策树分类模型图 | 第189页 |
| 图3．1．17 高发区BCH利EC组决策树不同终结点错误率比较：2个终结点时测试组的分类错误率最低 | 第189-190页 |
| 图3．1．18 高发区BCH和EC组蛋白质表达的质谱图及模拟胶图 | 第190页 |
| 图3．1．19 高发区BCH和EC组决策树分类模型图 | 第190-191页 |
| 图3．1．20 高发区EDYS和EC组决策树不同终结点错误率比较：5个终结点时测试组分类错误率最低。 | 第191-192页 |
| 图3．1．21 高发区EDYS和EC组分类蛋白质表达的质谱图及模拟胶图 | 第192-193页 |
| 图3．1．22 高发区EDYS和EC组决策树分类模型图 | 第193-194页 |
| 图3．1．23 高发区BCH和EDYS组决策树不同终结点错误率比较：2个终结点时测试组分类错误率最低 | 第194页 |
| 图3．1．24 高发区BCH和EDYS组分类变量蛋白质的质谱图及模拟胶图 | 第194-195页 |
| 图3．1．25 高发区BCH和EDYS组决策树分类模型图 | 第195页 |
| 图3．1．26 高发区食管癌手术前后组决策树不同终结点错误率比较：2个终结点时测试组分类错误率最低 | 第195-196页 |
| 图3．1．27 高发区食管癌患者手术前后组分类变量蛋白表达的质谱图及模拟胶图 | 第196页 |
| 图3．1．28 高发区食管癌手术前后组决策树分类模型图 | 第196-197页 |
| 图3．2．1 高发区NOR和CAG组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 | 第197页 |
| 图3．2．2 高发区NOR和GDYS组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 | 第197页 |
| 图3．2．3 高发区NOR和GDYS组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 | 第197-198页 |
| 图3．2．4 高发区CAG和GCA组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 | 第198页 |
| 图3．2．5 高发区GDYS和GCA组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 | 第198页 |
| 图3．2．6 高发区CAG和GDYS组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 | 第198-199页 |
| 图3．2．7 高发区贲门癌手术前后组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 。175 | 第199页 |
| 图3．2．8 高发区NOR和CAG组决策树不同终结点时分类错误率比较：3个终结点时测试组的分类错误率最低 | 第199-200页 |
| 图3．2．9 高发区NOR和CAG组分类变量蛋白质表达的质谱图及模拟胶图 | 第200-201页 |
| 图3．2．10 高发区NOR和CAG组决策树分类模型图 | 第201-202页 |
| 图3．2．11 高发区NOR和GDYS组当决策树不同终结点时分类错误率比较：2个终结点时测试组错误率最低 | 第202页 |
| 图3．2．12 高发区NOR和GDYS组分类变量蛋白质质谱图及模拟胶图 | 第202-203页 |
| 图3．2．13 高发区NOR和GDYS组决策树分类模型图 | 第203页 |
| 图3．2．14 高发区NOR和GCA组决策树不用终结点时分类错误率比较：3个终结点时，测试组分类错误率最低 | 第203-204页 |
| 图3．2．15 高发区NOR和GCA组分类变量蛋白质质谱图及模拟胶图 | 第204-205页 |
| 图3．2．16 高发区NOR和GCA组训练组决策树分类模型图 | 第205-206页 |
| 图3．2．17 高发区CAG和GCA组决策树不同终结点时分类错误率比较：6个终结点时测试组分类错误率最低 | 第206-207页 |
| 图3．2．18 高发区CAG和GCA组分类变量蛋白质表达的质谱图及模拟胶图 | 第207-208页 |
| 图3．2．19 高发区CAG和GCA组决策树分类模型图 | 第208-209页 |
| 图3．2．20 高发区贲门DYS和GCA组当决策树不用终结点时分类错误率比较：3个终结点时测试组分类错误率最低 | 第209页 |
| 图3．2．21 高发区贲门DYS和GCA组分类变量蛋白质表达的质谱图及模拟胶图 | 第209-210页 |
| 图3．2．22 高发区贲门DYS和GCA组决策树分类模型图 | 第210页 |
| 图3．2．23 高发区CAG和贲门DYs组决策树不同终结点时分类错误率比较：6个终结点时，测试组分类错误率最低 | 第210-212页 |
| 图3．2．24 高发区CAG和贲门DYS组分类变量蛋白质表达的质谱图及模拟胶图 | 第212-213页 |
| 图3．2．25 高发区CAG和贲门DYS组决策树分类模型图 | 第213-214页 |
| 图3．2．26 高发区贲门癌手术前后组决策树不同终结点时分类错误率比较：3个终结点时，测试组分类错误率最低 | 第214页 |
| 图3．2．27 高发区贲门癌手术前后组分类变量蛋白质的质谱图及模拟胶图 | 第214-215页 |
| 图3．2．28 高发区贲门癌手术前后组决策树分类模型图 | 第215页 |
| 图3．3．1 低发区NOR和BCH组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 | 第215-216页 |
| 图3．3．2 低发区NOR和DYS组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 | 第216页 |
| 图3．3．3 低发区NOR和CAG组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 | 第216页 |
| 图3．3．4 低发区NOR和BCH组决策树不同终结点时分类错误率比较：2个终结点时测试组分类错误率最低 | 第216-217页 |
| 图3．3．5 低发区NOR和BCH组分类变量蛋白质质谱图及模拟胶图 | 第217页 |
| 图3．3．6 低发区NOR和BCH组决策树分类模型图 | 第217-218页 |
| 图3．3．7 低发区NOR和DYS组决策树不同终结点时分类错误率比较：2个终结点时测试组分类错误率最低。 | 第218页 |
| 图3．3．8 低发区NOR和DYS组分类变量蛋白质质谱图及模拟胶图 | 第218-219页 |
| 图3．3．9 低发区NOR和DYS组决策树分类模型图 | 第219页 |
| 图3．3．1 0低发区NOR和CAG组血清分类变量蛋白质质谱及模拟胶图 | 第219-220页 |
| 图3．4．2 高低发区BCH组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 | 第220页 |
| 图3．4．3 高地发区CAG组相同M／Z的蛋白质相对含量的比较 | 第220-221页 |
| 图3．4．4 高低发区NOR组决策树不同终结点时分类错误率比较：5个终结点时测试组分类错误率最低 l96 | 第221页 |
| 图3．4．5 高低发区NOR组分类变量蛋白质表达的质谱图及模拟胶图 | 第221-222页 |
| 图3．4．6 高低发区NOR组决策树分类模型图 | 第222-223页 |
| 图3．4．7 高低发区BCH组决策树不同终结点时分类错误率比较：3个终结点测试组分类错误率最低。 | 第223页 |
| 图3．4．8 高低发区BCH组分类变量蛋白质表达的质谱图及模拟胶图 | 第223-224页 |
| 图3．4．9 高低发区BCH组决策树分类模型图 | 第224-225页 |
| 图3．4．10 高低发区CAG组决策树不同终结点时分类错误率比较：5个终结点测试组错误率最低 | 第225-226页 |
| 图3．4．11 高低发区CAG组分类变量蛋白质表达的质谱图及模拟胶图 | 第226-227页 |
| 图3．4．12 高低发区CAG组决策树分类模型图 | 第227-228页 |
| 10．缩略语说明 | 第228-229页 |
| 附件1：攻读博士学位期间发表的论文 | 第229-231页 |
| 附件2：致谢 | 第231-232页 |
