| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-20页 |
| ·引言 | 第9-10页 |
| ·氢键系统中质子传递的相关概念和研究现状 | 第10-14页 |
| ·蛋白质中能量传递的相关概念及研究现状 | 第14-17页 |
| ·本人的主要工作和创新之处 | 第17-18页 |
| ·论文的安排 | 第18-20页 |
| 第二章 氢键系统中质子传递的研究 | 第20-46页 |
| 第一节 氢键系统中质子传递的理论 | 第20-25页 |
| ·质子传递的ADZ 模型和缺陷结构的二维动力学模型 | 第20-22页 |
| ·氢键系统质子传递的新理论 | 第22-24页 |
| ·小结 | 第24-25页 |
| 第二节 模拟方法 | 第25-33页 |
| ·数值计算方法 | 第25-26页 |
| ·模拟方案 | 第26-30页 |
| ·初始条件 | 第27页 |
| ·方程变换及数值化 | 第27-30页 |
| ·编程与计算 | 第30页 |
| ·氢键系统中质子传递的影响因素及在模拟中的实现 | 第30-32页 |
| ·孤子在氢键系统中的碰撞 | 第30-31页 |
| ·外场及温度效应 | 第31-32页 |
| ·有杂质存在时的质子传递 | 第32页 |
| ·小结 | 第32-33页 |
| 第三节 模拟结果与讨论 | 第33-46页 |
| ·自由状态下孤立子的运动 | 第33-34页 |
| ·自由状态下孤立子的运动 | 第33-34页 |
| ·孤立子的碰撞 | 第34页 |
| ·有杂质存在时氢键系统中的质子传递 | 第34-36页 |
| ·外场和温度等对孤子传递的影响 | 第36-43页 |
| ·外场的影响 | 第36-37页 |
| ·温度效应 | 第37-43页 |
| ·E=200KV/cm 时的孤子传递随温度的变化 | 第37-39页 |
| ·E=100KV/cm 时的孤子传递随温度的变化 | 第39-41页 |
| ·衰减系数对孤子传递的影响 | 第41-43页 |
| ·蛋白质中质子传递情况 | 第43-45页 |
| ·E=100KV/cm | 第43-44页 |
| ·E=200KV/cm | 第44-45页 |
| ·小结 | 第45-46页 |
| 第三章 蛋白质中能量传递的研究 | 第46-87页 |
| 第一节 蛋白质中能量传递的理论 | 第46-53页 |
| ·蛋白质中能量传递的Davydov 模型和理论 | 第46-47页 |
| ·改进的Davydov 理论 | 第47-52页 |
| ·Davydov 理论的缺陷 | 第47-48页 |
| ·改进的Davydov 理论 | 第48-50页 |
| ·改进的Davydov 理论的孤子运动方程 | 第50-52页 |
| ·小结 | 第52-53页 |
| 第二节 模拟方法 | 第53-59页 |
| ·量子力学方法 | 第53页 |
| ·模拟中遵循的原则 | 第53页 |
| ·数值计算方法和模拟方案 | 第53-56页 |
| ·数值计算方法 | 第53-54页 |
| ·模拟方案 | 第54-56页 |
| ·初始条件 | 第54页 |
| ·方程变换及数值化 | 第54-56页 |
| ·编程与计算 | 第56页 |
| ·蛋白质分子能量传递的影响因素及在模拟中的实现 | 第56-58页 |
| ·温度效应 | 第56-57页 |
| ·蛋白质分子结构的无序性研究 | 第57-58页 |
| ·侧链和杂质的影响 | 第58页 |
| ·改变波函数进行模拟 | 第58页 |
| ·小结 | 第58-59页 |
| 第三节 模拟结果与讨论 | 第59-87页 |
| ·自由状态下孤立子的运动 | 第59-62页 |
| ·自由状态下的孤子运动 | 第59-60页 |
| ·孤立子的碰撞 | 第60-61页 |
| ·在标准参数下孤子长时间运动 | 第61-62页 |
| ·单链蛋白质分子在波函数为3.8 式时的孤子运动 | 第62-74页 |
| ·新模型中孤子在生理温度下的运动 | 第62-68页 |
| ·标准参数情况 | 第62-65页 |
| ·温度变化和蛋白质分子结构无序及杂质等影响下孤立子的运动情况 | 第65-68页 |
| ·χ_2 = 0 时的情况 | 第68-74页 |
| ·标准参数不同温度下的孤子传递 | 第68-71页 |
| ·温度变化和蛋白质分子结构无序及杂质等影响下孤立子的运动情况 | 第71-74页 |
| ·波函数为3.37 式时的孤子传递 | 第74-86页 |
| ·χ_2 ≠0 时的情况 | 第74-80页 |
| ·标准参数不同温度下的孤子传递 | 第74-77页 |
| ·温度变化和蛋白质分子结构无序及杂质等影响下孤子的运动 | 第77-80页 |
| ·χ_2 = 0 时的情况 | 第80-86页 |
| ·标准参数不同温度下的孤子传递 | 第80-83页 |
| ·温度变化和蛋白质分子结构无序及杂质等影响下孤子的运动 | 第83-86页 |
| ·小结 | 第86-87页 |
| 第四章 总结 | 第87-89页 |
| 参考文献 | 第89-92页 |
| 致谢 | 第92-93页 |
