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细胞和动物水平稳定整合的RNA干扰技术的建立及在小鼠珠蛋白表达调控研究中的运用

目录第1-7页
中文摘要第7-10页
英文摘要第10-12页
前言第12-29页
 一、RNA干扰过程概述第12-17页
  1.内源性的mRNA是dsRNA作用的靶位点第13页
  2.DICER:RNA干扰的启动器第13页
  3.RdRP:RNA干扰的催化剂第13-14页
  4.RISC(RNA-induced silencing complex):干扰效应器复合物第14-15页
  5.Argonaute:接头蛋白(Adaptor)第15页
  6.SiRNA(Small interference RNA)第15-17页
 二、RNA干扰在哺乳动物功能基因研究中的应用第17-21页
 三、RNA干扰实现的方式第21-24页
 四、鼠α-和β-珠蛋白基因簇结构与表达调控特点第24-28页
  1.鼠α-和β-珠蛋白基因簇结构第24-25页
  2.β-珠蛋白基因簇发育开关机制的研究第25-27页
   ·LCR与各个珠蛋白基因之间的相对位置第26页
   ·各个高敏位点的不同作用第26页
   ·近端调控元件第26-27页
   ·反式作用因子第27页
  3.鼠α-和β-珠蛋白基因表达平衡的研究第27-28页
 五、本研究的主要内容第28-29页
材料与方法第29-55页
 一、材料第29-31页
  1.菌株和质粒第29页
  2.细胞系第29页
  3.限制性内切酶及其它修饰酶类第29页
  4.各种转染试剂第29-30页
  5.抗体第30页
  6.其它主要试剂及试剂盒第30页
  7.主要仪器第30-31页
  8.放射性核素第31页
 二、实验方法第31-55页
  1.质粒的构建第34-37页
   ·酶切反应第34页
   ·DNA片段回收第34页
   ·DNA片段3’凹端的补平第34页
   ·DNA片段3’凸端的削平第34-35页
   ·载体的脱磷酸化第35页
   ·连接反应第35页
   ·感受态大肠杆菌细胞制备第35-36页
   ·转化第36页
   ·质粒DNA的小量制备第36页
   ·质粒DNA的大量制备第36-37页
  2.细胞培养第37-38页
   ·G418溶液配制第37页
   ·细胞生长条件第37-38页
   ·细胞传代第38页
   ·复苏及冻存第38页
  3.细胞电穿孔转染质粒DNA第38-39页
  4.病毒包装与转导第39-40页
   ·病毒包装、病毒上清收集及冻存第39-40页
   ·病毒转导靶细胞的程序第40页
   ·DMSO诱导MEL细胞分化第40页
  5.转导细胞的DNA结构分析第40-42页
   ·从转染细胞中提取基因组DNA第40-41页
   ·基因组DNA的PCR分析第41页
   ·Southern blot分析第41-42页
     ·酶解第41页
     ·电泳第41页
     ·Southern转膜第41-42页
     ·预杂交第42页
     ·DNA探针标记第42页
     ·杂交第42页
     ·洗膜及放射自显影第42页
  6.FACS(fluorescence activating cell sorting)定量分析发光细胞比例第42-43页
  7.流式细胞仪测定细胞DNA含量第43页
   ·收集并固定细胞第43页
   ·PI染色测定细胞周期:第43页
  8.半定量RT-PCR检测基因的mRNA表达水平第43-45页
   ·从细胞中提取细胞总RNA第43-44页
   ·反转录成cDNA第一链(参照产品说明)第44页
   ·半定量RT-PCR第44-45页
  9.利用PCR和Southern杂交鉴定转基因鼠第45页
   ·PCR法鉴定转基因鼠第45页
   ·Southern杂交鉴定转基因鼠第45页
  10.转基因鼠传代第45页
  11.胚胎小鼠器官组织的采集和保存第45-46页
  12.阳性胎鼠的PCR快速鉴定第46页
  13.组织RNA提取第46-47页
  14.RNase保护实验检测细胞及转基因小鼠中人β-珠蛋白的表达第47-49页
   ·RNA探针标记第47-48页
   ·RNA探针纯化第48页
   ·RNA:RNA杂交及RNase反应第48-49页
   ·变性胶电泳及放射自显影第49页
  15.Western blotting检测蛋白的表达水平第49-52页
   ·裂解细胞第49-50页
   ·SDS-PAGE电泳第50-51页
   ·电转移第51页
   ·杂交第51-52页
  16.利用酸性解链电泳检测转基因鼠血液中β-珠蛋白的表达第52-55页
   ·鼠溶血液的制备第52页
   ·用酸性解链电泳检测转基因鼠血液中的珠蛋白第52-53页
   ·蛋白质的质谱分析第53-55页
实验结果第55-95页
 一、逆转录病毒载体介导的RNA干扰技术的建立第56-67页
  1.p53蛋白的逆转录病毒hU6-RNA干扰载体的构建及其干扰作用研究第56-63页
   ·pAVU6+27-sip53-1载体的构建第56-58页
   ·pXSN-AVU6+27-sip53-1载体的构建第58-60页
   ·重组病毒的产生与收集第60页
   ·抗性细胞克隆库的形成第60页
   ·基因组DNA的PCR分析第60-61页
   ·Western blotting检测细胞库中p53蛋白的表达第61-62页
   ·细胞流式检测p53蛋白被抑制的细胞库中细胞周期的变化第62-63页
  2.p53蛋白的逆转录病毒hH1-RNA干扰载体的构建及其干扰作用研究第63-67页
   ·pSuper-sip53-2载体的构建第64-65页
   ·pXSN-H1-sip53-2和pXRN-H1-sip53-2载体的构建第65-66页
   ·病毒的包装、上清的收集与靶细胞的转导第66页
   ·Western blotting检测细胞库中p53蛋白的表达第66-67页
 二、利用逆转录病毒载体介导的RNA干扰技术研究鼠α、β珠蛋白基因的表达平衡第67-73页
  1.pXSNmU6Beta病毒载体的构建第67-70页
   ·pBS/U6mBeta载体的构建第67-68页
   ·pXSNmU6Beta载体的构建第68-70页
  2.重组病毒的收集与病毒转导靶细胞第70页
  3.Southern杂交检测pXSNmU6Beta在MEL细胞中的整合第70页
  4.RPA检测细胞中α、β-珠蛋白基因的表达第70-73页
 三、利用RNA干扰技术抑制小鼠中β-珠蛋白基因的表达第73-95页
  1.显微注射用DNA的制备与纯化第73页
  2.转基因鼠系的建立第73-75页
  3.转基因小鼠中β-珠蛋白的检测第75-77页
   ·RPA检测转基因鼠中mRNA水平的表达第75-76页
   ·酸性解炼电泳检测鼠血液中β-珠蛋白的表达第76-77页
  4.RT-PCR检测转基因鼠系中胚胎、胎儿期β-类珠蛋白的表达第77-78页
  5.转基因小鼠血液中表达蛋白的质谱分析第78-95页
   ·转基因鼠系siβl中siβlm主带与B1、B2、B3鉴定与分析第79-85页
     ·对应于正常鼠的siβl中β-globin主带(siβlm)的鉴定与分析第79-80页
     ·B1蛋白鉴定与分析第80-82页
     ·B2蛋白鉴定与分析第82-84页
     ·B3蛋白鉴定与分析第84-85页
   ·14.5天胎血条带的鉴定与分析第85-92页
     ·14.5m蛋白鉴定与分析第85-87页
     ·14.5-1蛋白鉴定与分析第87-88页
     ·14.5-2蛋白鉴定与分析第88-90页
     ·14.5-3蛋白鉴定与分析第90-92页
   ·正常成年鼠的β-珠蛋白血液成分分析:第92-95页
讨论第95-112页
 一.本研究中RNA干扰技术的创新点第95-100页
  1.逆转录病毒载体介导的稳定整合的RNA干扰技术的优越性第95-99页
   ·逆转录病毒载体介导体系易于导入细胞和筛选稳定克隆第95-97页
   ·逆转录病毒载体介导的RNA干扰体系具有特异性和高效性第97-98页
   ·逆转录病毒载体介导的RNA干扰在细胞水平没有引起抗病毒防御机制第98-99页
  2.RNA干扰技术与转基因动物技术的结合:能够在动物体中实现内源基因表达的抑制第99-100页
 二、运用建立的RNA干扰技术分别在细胞和整体动物中研究珠蛋白的平衡和发育开关机制第100-103页
  1.β-珠蛋白基因被不同程度地抑制后,MEL细胞中α-和β-珠蛋白基因表达的分析第100-101页
  2.转基因鼠系表达模式可能类似于14.5天胚胎期珠蛋白基因的表达模式第101-103页
   ·β-minor蛋白可能是鼠的发育过程中的一种胎儿期血红蛋白第101-102页
   ·转基因鼠系和14.5天的胎血中各条带与α-珠蛋白比值的比较第102-103页
 三、动物水平RNA干扰机制的分析第103-105页
 四、珠蛋白的量与转录因子依赖的β-珠蛋白开关模式第105-106页
 五、序列特异的siRNA干扰序列的设计分析第106-108页
 六、RNA干扰的应用前景第108-110页
  1.RNA干扰与发育调控第108-109页
  2.基因功能研究第109-110页
  3.基因治疗第110页
 七、本研究的不足与改进之处第110-112页
小结第112-113页
参考文献第113-117页
文献综述第117-132页
英文名词及缩写第132-133页
致谢第133-134页
个人简历第134页

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