中文摘要 | 第1-7页 |
Abstract | 第7-10页 |
目录 | 第10-15页 |
第一章 文献综述 | 第15-45页 |
1.端粒研究概况 | 第15-26页 |
·端粒的研究历史 | 第15页 |
·端粒DNA | 第15-17页 |
·端粒序列的测定 | 第15-16页 |
·端粒序列的组成 | 第16页 |
·端粒的功能 | 第16-17页 |
·端粒相关蛋白 | 第17-19页 |
·端粒结合蛋白 | 第17-18页 |
·双链结合蛋白及其功能 | 第17页 |
·单链结合蛋白及其功能 | 第17-18页 |
·招募蛋白 | 第18-19页 |
·端粒酶 | 第19-22页 |
·端粒酶的结构 | 第19-20页 |
·端粒酶的RNA部分 | 第19-20页 |
·端粒酶的催化亚基 | 第20页 |
·端粒酶相关蛋白 | 第20-21页 |
·端粒酶的功能 | 第21-22页 |
·端粒、端粒酶与衰老、肿瘤的关系 | 第22-26页 |
·端粒的缩短 | 第22-23页 |
·端粒的延长 | 第23-24页 |
·衰老与肿瘤 | 第24-26页 |
·细胞衰老及永生化的端粒假说 | 第24页 |
·端粒酶与肿瘤治疗 | 第24-26页 |
·反义核苷酸及肽核酸对端粒酶活性的抑制 | 第24页 |
·核酶对端粒酶活性的抑制 | 第24-25页 |
·逆转录酶抑制剂对端粒酶活性的抑制 | 第25页 |
·通过抑制端粒酶底物来抑制端粒酶活性 | 第25-26页 |
2.端粒DNA结构的研究进展 | 第26-41页 |
·G—quadruplex的研究进展 | 第26-34页 |
·G:G配对 | 第26-27页 |
·G—quartet的发现 | 第27-28页 |
·G—quadruplex的种类 | 第28-29页 |
·G—quadruplex的特点 | 第29-31页 |
·链的极性 | 第29页 |
·碱基的构象 | 第29-30页 |
·G—quartet的loop环 | 第30-31页 |
·G—quadruplex的离子选择性 | 第31-32页 |
·与G-quadruplex作用的药物 | 第32-34页 |
·i—motif结构的研究进展 | 第34-41页 |
·i—motif的研究历史 | 第35页 |
·i—motif的种类 | 第35-36页 |
·i—motif性质 | 第36-39页 |
·loop,groove | 第36-37页 |
·对称性 | 第37页 |
·拓扑性 | 第37-38页 |
·稳定性 | 第38-39页 |
·生物学意义 | 第39-41页 |
3.DNA结构的研究方法 | 第41-43页 |
·X-射线晶体衍射 | 第41页 |
·核磁共振(NMR) | 第41页 |
·圆二色光谱法(CD) | 第41-42页 |
·表面等离子体共振(SPR) | 第42-43页 |
·基本原理 | 第42页 |
·Biacore工作原理 | 第42页 |
·Biacore的优越性 | 第42-43页 |
·SPR技术在生物学中的应用 | 第43页 |
4.研究的目的和意义 | 第43-45页 |
第二章 单链结合蛋白检测四重折叠结构的形成 | 第45-73页 |
·引言 | 第45-46页 |
·材料和方法 | 第46-55页 |
·仪器装置 | 第46页 |
·实验材料 | 第46-47页 |
·DNA序列合成 | 第46页 |
·蛋白质和酶 | 第46页 |
·芯片 | 第46-47页 |
·试剂盒 | 第47页 |
·同位素操作 | 第47页 |
·试剂溶液及配方 | 第47-48页 |
·实验方法 | 第48-55页 |
·四重折叠的电泳检测 | 第48-50页 |
·非变性聚丙烯酰胺凝胶的制备 | 第48-49页 |
·合成DNA的放射性标记与纯化 | 第49页 |
·四重折叠的非变性电泳 | 第49-50页 |
·放射自显影 | 第50页 |
·四重折叠的HPLC检测 | 第50页 |
·交联DNA的制备与检测 | 第50-52页 |
·DNA的紫外交联 | 第50-51页 |
·交联DNA的分离 | 第51页 |
·交联DNA的纯化 | 第51-52页 |
·交联DNA的标记 | 第52页 |
·交联DNA的检测 | 第52页 |
·凝胶迁移 | 第52页 |
·G链和C链的熔解实验 | 第52-53页 |
·C链的pH滴定实验 | 第53页 |
·缓冲液的酸碱滴定 | 第53页 |
·C链的酸碱滴定 | 第53页 |
·CM5芯片修饰成SA芯片 | 第53-54页 |
·DNA在芯片上的固定 | 第54页 |
·单链结合蛋白检测四重折叠结构的形成 | 第54-55页 |
·.SSB检测G—quadruplex的形成 | 第54页 |
·.SSB检测i—motif的形成 | 第54-55页 |
·实验结果 | 第55-66页 |
·E.coli单链结合蛋白(SSB)检测G链四重折叠 | 第55-61页 |
·SSB只和单链结合,而不结合四重折叠结构 | 第55页 |
·DNA在芯片上的固定 | 第55-58页 |
·溶液状态下,(TTAGGG)_4形成结构的证明 | 第58-59页 |
·电泳实验 | 第58页 |
·熔解实验 | 第58-59页 |
·单链结合蛋白(SSB)检测(TTAGGG)_4形成四重折叠结构 | 第59-61页 |
·E.coli单链结合蛋白(SSB)检测C链四重折叠 | 第61-66页 |
·(CCCTAA)_4在溶液中形成结构的证明 | 第61-64页 |
·熔解实验 | 第61页 |
·(CCCTAA)_4的pH滴定实验 | 第61-63页 |
·(CCCTAA)_4的凝胶过滤实验 | 第63-64页 |
·单链结合蛋白(SSB)检测(CCCTAA)_4形成四重折叠结构 | 第64-66页 |
·讨论 | 第66-73页 |
·探针的选择 | 第66-67页 |
·SPR技术对结构的研究 | 第67-70页 |
·固定DNA的性质 | 第70-71页 |
·二级结构引起的DNA芯片的假阴性问题 | 第71-73页 |
·DNA芯片技述的发展与应用 | 第71-72页 |
·二级结构引起的假阴性问题 | 第72-73页 |
第三章 四重折叠结构的动力学性质研究 | 第73-93页 |
·引言 | 第73-74页 |
·材料和方法 | 第74-79页 |
·实验材料 | 第74页 |
·实验方法 | 第74-79页 |
·折叠和解折叠动力学常数测定的理论推导 | 第74-79页 |
·DNA在芯片上的固定 | 第79页 |
·G链和C链的动力学常数测定 | 第79页 |
·实验结果 | 第79-88页 |
·互补链杂交检测四重折叠结构 | 第79-80页 |
·互补链杂交测定折叠和解折叠速率常数 | 第80-84页 |
·不同序列的DNA的选择与形成结构的证明 | 第84-88页 |
·凝胶电泳实验 | 第84-85页 |
·熔解实验 | 第85-86页 |
·四个不同序列DNA的动力学常数的测定 | 第86-88页 |
·讨论 | 第88-93页 |
·芯片上DNA形成四重折叠结构的定性检测 | 第88页 |
·四重折叠结构的动力学研究方法 | 第88-90页 |
·动力学常数的生物学意义 | 第90页 |
·固定DNA的性质改变 | 第90页 |
·loop和碱基组成对稳定性的影响 | 第90-91页 |
·技术的拓展应用 | 第91-93页 |
研究总结 | 第93-95页 |
参考文献 | 第95-109页 |
博士研究生期间发表的论文 | 第109-110页 |
致谢 | 第110页 |