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几种植物病原原核生物实时荧光PCR检测方法的研究

论文缩写词表第1-17页
第一章 导言第17-38页
   ·植原体的分类及分子生物学研究进展第17-24页
     ·植原体生物学特性第17页
     ·菌原体的分类研究与植原体的发现第17-18页
     ·分子进化研究与植原体分类的起步第18-19页
     ·植原体分类的现状第19-24页
   ·柑桔黄龙病病原菌研究概述第24-26页
     ·柑桔黄龙病病原的确定第24页
     ·柑桔黄龙病菌生物学特性第24-25页
     ·柑桔黄龙病病原菌检测鉴定方法第25-26页
   ·水稻白叶枯病与水稻细菌性条斑病病原菌检测鉴定研究概况第26-27页
     ·症状特点区分第26-27页
     ·分离及细菌学性状鉴定第27页
     ·测定致病性第27页
     ·噬菌体检测法第27页
     ·血清学诊断第27页
     ·PCR技术检测第27页
   ·基因突变检测和单核苷酸多态性分析技术及应用新进展第27-37页
     ·传统的检测分析方法第28页
     ·基于PCR技术的检测分析方法第28-29页
     ·新的检测分析技术第29-36页
     ·突变检测及SNPs分析在农业上的应用第36-37页
   ·目标第37-38页
第二章 植原体TaqMan探针实时荧光PCR检测鉴定方法的建立第38-57页
   ·材料与方法第38-45页
     ·试验材料第38页
     ·仪器试剂第38-39页
     ·培养基及溶液的配制第39页
     ·试验方法第39-44页
     ·试验所用植原体及细菌第44-45页
   ·结果与分析第45-55页
     ·实时荧光PCR体系优化第45-46页
     ·PProbe广谱探针对植原体的检测第46-47页
     ·植原体组间PCLYProbe、PEYProbe、PAPProbe探针对植原体扩增的特异性第47-49页
     ·荧光PCR扩增的敏感性第49-50页
     ·DNA测序结果第50-52页
     ·TaqMan探针实时荧光PCR对植物标样的检测第52-54页
     ·泡桐丛枝病菌(Paulownia witches'-broom phytoplasma)16SrDNA PCR扩增产物克隆与测序结果第54-55页
   ·结论与讨论第55-57页
第三章 柑桔黄龙病病原16Sr DNA克隆测序及实时荧光PCR检测方法的建立第57-65页
   ·材料和方法第57-60页
     ·材料第57页
     ·仪器和试剂第57-58页
     ·试验方法第58-60页
   ·结果与分析第60-64页
     ·PCR扩增产物的克隆第60页
     ·PCR扩增产物克隆与测序结果第60-61页
     ·柑桔黄龙病菌探针(HLprobe)的特异性第61-63页
     ·实时荧光PCR的灵敏度第63页
     ·实时荧光PCR对植物样品的检测第63-64页
   ·结论与讨论第64-65页
第四章 水稻白叶枯病菌与水稻细菌性条斑病菌实时荧光PCR快速检测鉴定方法的建立第65-76页
   ·材料和方法第65-67页
     ·试验材料第65-66页
     ·仪器和试剂第66页
     ·试验方法第66-67页
   ·结果与分析第67-74页
     ·白叶枯菌探针(Baiprobe)与条斑菌探针(Tiaoprobe)的特异性第67-68页
     ·PCR扩增产物克隆与测序结果第68-69页
     ·实时荧光PCR扩增的绝对灵敏度第69-72页
     ·实时荧光PCR检测的相对灵敏度第72页
     ·实时荧光PCR对自然感病水稻叶片的检测第72-73页
     ·实时荧光PCR对自然感病水稻种子的检测第73-74页
   ·结论与讨论第74-76页
第五章 禁止进境的检疫性植原体风险分析第76-82页
   ·苹果蔟叶植原体Apple proliferation phytoplasma 16SrⅩ-A第76-77页
     ·地理分布与管理标准第76页
     ·进入可能性第76页
     ·定殖的可能性第76页
     ·扩散的可能性第76-77页
     ·经济影响第77页
     ·小结第77页
   ·杏褪绿卷叶植原体Apricit chlorotic leafroll phtoplasma 16SrⅩ-B第77页
     ·地理分布与管理标准第77页
     ·进入可能性第77页
     ·定殖的可能性第77页
     ·扩散的可能性第77页
     ·经济影响第77页
     ·小结第77页
   ·桃X病植原体Peach X disease phytoplasma 16SrⅢ-A第77-78页
     ·地理分布与管理标准第77页
     ·进入可能性第77-78页
     ·定殖的可能性第78页
     ·扩散的可能性第78页
     ·经济影响第78页
     ·小结第78页
   ·梨衰退植原体Pear decline phytoplasma 16SrⅩ-C第78-79页
     ·地理分布与管理标准第78页
     ·进入可能性第78页
     ·定殖的可能性第78页
     ·扩散的可能性第78页
     ·经济影响第78-79页
     ·小结第79页
   ·葡萄金黄化植原体Grapevine flavescence doree phytoplasma 16SrⅤ-C第79页
     ·地理分布与管理标准第79页
     ·进入可能性第79页
     ·定殖的可能性第79页
     ·扩散的可能性第79页
     ·经济影响第79页
     ·小结第79页
   ·马铃薯丛枝植原体Potato witches'-broom phytoplasma 16SrⅥ-A第79-80页
     ·地理分布与管理标准第79页
     ·进入可能性第79页
     ·定殖的可能性第79-80页
     ·扩散的可能性第80页
     ·经济影响第80页
     ·小结第80页
   ·玉米丛矮植原体Maize bushy stant phytoplasma 16Sr Ⅰ-B第80页
     ·地理分布与管理标准第80页
     ·进入可能性第80页
     ·定殖的可能性第80页
     ·扩散的可能性第80页
     ·经济影响第80页
     ·小结第80页
   ·棉花变叶植原体Cotton Phyllody phytoplasma 16Sr Ⅱ-C第80-81页
     ·地理分布与管理标准第80页
     ·进入可能性第80-81页
     ·定殖的可能性第81页
     ·扩散的可能性第81页
     ·经济影响第81页
     ·小结第81页
   ·草莓簇生植原体Strawberry Multiplier phytoplasma 16SrⅠ-K第81-82页
     ·地理分布与管理标准第81页
     ·进入可能性第81页
     ·定殖的可能性第81页
     ·扩散的可能性第81页
     ·经济影响第81页
     ·小结第81-82页
参考文献第82-91页
附件1 梨衰退植原体16SrDNA测序报告第91-94页
附件2 泡桐丛枝植原体16SrDNA测序报告第94-97页
附件3 在Genebank中登出的AY192577序列第97-98页
附件4 柑桔黄龙病病原菌16SrDNA测序报告第98-100页
附件5 在Genebank中登出的AY192576序列第100-101页
附件6 白叶枯菌靶基因测序报告第101-102页
附件7 条斑菌靶基因测序报告第102-103页
致谢第103-104页
作者简历第104-105页
博士在读期间主要学术成果第105-106页

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