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疏棉状嗜热丝孢菌热稳定脂肪酶的基因克隆与表达

中文摘要第1-12页
ABSTRACT第12-15页
第一章 文献综述第15-34页
 引言第15页
 1 脂肪酶的分类第15-21页
 2 脂肪酶产生菌及其筛选第21-23页
   ·脂肪酶产生菌第21-22页
   ·脂肪酶产生菌的筛选第22-23页
 3 脂肪酶的催化机理及其底物特异性第23-26页
   ·脂肪酶的催化机理第23-24页
   ·脂肪酶的底物特异性第24-26页
     ·脂肪酸特异性第24-25页
     ·位置特异性第25页
     ·立体特异性第25-26页
 4 脂肪酶的活力测定第26-27页
 5 脂肪酶的应用第27-31页
   ·脂肪酶在洗涤剂行业的应用第28页
   ·脂肪酶在食品加工行业的应用第28-29页
   ·脂肪酶在医药行业的应用第29页
   ·脂肪酶在纺织行业的应用第29-30页
   ·脂肪酶在饲料行业中的应用第30页
   ·脂肪酶在制备生物柴油方面的应用第30-31页
 本研究的立题依据、研究内容及技术路线第31-34页
  1 立题依据第31-32页
  2 研究内容第32-33页
  3 技术路线第33-34页
第二章 疏棉状嗜热丝孢菌脂肪酶的基因克隆及其序列分析第34-80页
 第一节 疏棉状嗜热丝孢菌热稳定脂肪酶LGY 的基因克隆及序列分析第35-62页
  1 材料和方法第35-49页
   ·材料第35-37页
     ·供试菌株第35页
     ·菌株与质粒第35页
     ·酶和生化试剂第35页
     ·仪器第35-36页
     ·溶液及培养基配制第36-37页
       ·培养基第36页
       ·溶液配制第36-37页
   ·疏棉状嗜热丝孢菌脂肪酶基因lgy 的cDNA 克隆第37-45页
     ·引物设计第37-38页
     ·总RNA 的提取(Trizol 法)第38页
     ·紫外检测RNA 产率和纯度第38-39页
     ·反转录cDNA 第一链的合成第39页
     ·目的基因cDNA 中间片段的扩增第39-44页
       ·目的基因cDNA 中间片段的扩增第39-40页
       ·PCR 产物回收第40-41页
       ·目的片段与载体连接第41页
       ·大肠杆菌感受态细胞的制备和转化第41-43页
         ·大肠杆菌感受态的制备第41-42页
         ·大肠杆菌感受态的转化第42-43页
       ·重组质粒的筛选与鉴定第43-44页
         ·IPTG-X-gal 筛选第43页
         ·菌落PCR 检测第43页
         ·碱法小量提取质粒DNA第43-44页
         ·质粒DNA 的酶切鉴定第44页
         ·序列测定第44页
     ·目的基因3’末端的分离(3’RACE)第44-45页
   ·目的基因DNA 序列和全长cDNA 的克隆第45-49页
     ·引物设计第45页
     ·菌丝体DNA 的抽提第45-46页
     ·脂肪酶基因DNA 序列中间片段的PCR 扩增第46-47页
     ·脂肪酶基因DNA 序列5’端片段的TAIL-PCR 扩增第47-48页
     ·脂肪酶基因DNA 与全长cDNA 序列的克隆第48页
     ·脂肪酶基因全长序列的生物信息学分析第48-49页
  2 结果与分析第49-62页
   ·疏棉状嗜热丝孢菌脂肪酶基因lgy 扩增模板的提取第49-50页
     ·疏棉状嗜热丝孢菌总RNA 的提取第49页
     ·疏棉状嗜热丝孢菌 Genomic DNA 的提取第49-50页
   ·疏棉状嗜热丝孢菌脂肪酶基因lgy 全长cDNA 与DNA 序列的扩增第50-56页
     ·脂肪酶基因lgy 中间片段的分离第50-52页
     ·脂肪酶基因lgy cDNA 3’-末端的分离第52-53页
     ·脂肪酶基因lgy DNA 序列5’-末端的分离第53-55页
     ·脂肪酶基因lgy 全长序列的扩增第55-56页
   ·脂肪酶基因lgy 的核苷酸序列和氨基酸序列分析第56-62页
     ·脂肪酶基因lgy 的核苷酸序列分析第57-58页
     ·脂肪酶基因lgy 的氨基酸序列分析第58-61页
     ·脂肪酶LGY 的立体结构预测第61-62页
 第二节 疏棉状嗜热丝孢菌热稳定脂肪酶LN 的基因克隆及序列分析..第62-80页
  1 材料和方法第62-65页
   ·材料第62页
   ·实验方法第62-65页
     ·引物设计第62-63页
     ·总RNA 的提取(Trizol 法)第63页
     ·紫外检测RNA 产率和纯度第63页
     ·反转录cDNA 第一链的合成第63页
     ·目的基因cDNA 中间片段的分离第63-64页
     ·目的基因3’末端的分离(3’-RACE)第64页
     ·目的基因ln 全长cDNA 的克隆第64-65页
     ·目的基因ln 的Genomic DNA 序列的扩增第65页
     ·目的基因全长序列的生物信息学分析第65页
  2 结果与分析第65-76页
   ·目的基因ln 的分离第65-76页
     ·目的基因ln 中间片段的分离第65-66页
     ·目的基因ln cDNA 3’-末端的分离第66-70页
     ·目的基因ln 全长cDNA 的克隆第70-71页
     ·目的基因ln 序列的核苷酸分析第71-72页
     ·目的基因ln 的氨基酸序列分析第72-74页
     ·目的基因ln 的氨基酸序列同源性比较第74-76页
  3 讨论第76-80页
   ·关于研究结果第76-77页
   ·关于研究方法第77-80页
第三章 疏棉状嗜热丝孢菌热稳定脂肪酶基因在毕赤酵母中的表达第80-122页
 第一节 疏棉状嗜热丝孢菌脂肪酶LGY 在毕赤酵母中的表达第81-107页
  1 材料和方法第81-94页
   ·材料第81-83页
     ·菌株和质粒第81页
     ·酶和生化试剂第81页
     ·培养基及有关溶液的配制第81-82页
     ·主要仪器设备第82-83页
   ·实验方法第83-94页
     ·脂肪酶LGY 成熟肽基因序列的分离第83-84页
       ·脂肪酶 LGY 成熟肽基因序列的限制性酶切位点分析第83页
       ·引物设计以及LGY 成熟肽基因序列的分离第83-84页
     ·脂肪酶基因lgy 在毕赤酵母中的表达第84-94页
       ·酵母表达载体的构建第84-85页
       ·线性化质粒DNA 的制备第85页
       ·酵母转化第85-87页
         ·Pichia pastoris G5115 感受态细胞的制备(电击法)第85-86页
         ·重组表达质粒pPIC9K/lgy 电击转化酵母感受态细胞第86-87页
       ·酵母转化子的筛选与鉴定第87-88页
         ·酵母转化子甲醇利用表型的平板筛选第87页
         ·酵母基因组DNA 的分离第87-88页
       ·酵母转化子的PCR 鉴定第88-90页
         ·pPIC9K AOX1 通用引物鉴定第88-89页
         ·脂肪酶lgy 基因的特异性引物鉴定第89-90页
       ·外源基因多拷贝整合转化子筛选第90-91页
       ·酵母工程菌的培养和脂肪酶LGY 的诱导分泌表达第91页
       ·表达产物的生物学活性检测第91-92页
       ·表达产物的SDS-PAGE 分析第92页
       ·脂肪酶工程菌产酶曲线及产酶期间生长曲线的测定第92页
       ·脂肪酶工程菌的遗传稳定性分析第92页
       ·脂肪酶工程菌表达产物的酶学性质第92-94页
         ·反应最适温度第92-93页
         ·反应最适pH 值第93页
         ·热稳定性第93页
         ·pH 稳定性第93页
         ·各种金属离子对脂肪酶活性的影响第93-94页
  2 结果与分析第94-107页
   ·脂肪酶LGY 成熟肽基因序列的酶切位点分析和扩增第94-95页
   ·脂肪酶基因lgy 在毕赤酵母中的表达第95-107页
     ·酵母表达载体的构建和鉴定第95-97页
     ·重组酵母表达质粒pPIC9K/lgy 转化 Pichia pastoris GS115及酵母转化子的筛选第97-100页
       ·酵母转化子的甲醇利用表型的筛选第97-98页
       ·酵母转化子的PCR 鉴定第98-99页
       ·lgy 基因多拷贝整合子的筛选第99-100页
     ·疏棉状嗜热丝孢菌热稳定脂肪酶基因lgy 在Pichia pastoris 中的高效表达及表达产物的检测第100-102页
       ·脂肪酶基因lgy 在Pichia pastoris 中的诱导表达和高表达酵母菌株的筛选第100页
       ·脂肪酶酵母工程菌产酶曲线及产酶期间生长曲线的测定第100-101页
       ·脂肪酶基因lgy 表达产物的SDS-PAGE 检测第101-102页
     ·脂肪酶酵母工程菌的遗传稳定性分析第102页
     ·表达脂肪酶LGY 的酶学性质研究第102-107页
       ·表达脂肪酶LGY 的纯化第102-103页
       ·表达脂肪酶LGY 的最适反应温度第103-104页
       ·表达脂肪酶LGY 的最适反应pH 值第104页
       ·表达脂肪酶LGY 的热稳定性第104-105页
       ·表达脂肪酶LGY 的pH 稳定性第105页
       ·金属离子对表达脂肪酶LGY 活性的影响第105-107页
 第二节 疏棉状嗜热丝孢菌脂肪酶LN 在毕赤酵母中的表达第107-122页
  1 材料和方法第107-108页
   ·材料第107页
   ·实验方法第107-108页
     ·脂肪酶LN 成熟肽基因序列的分离第107-108页
       ·脂肪酶LN 成熟肽基因序列的限制性酶切位点分析第107页
       ·引物设计以及LN 成熟肽基因序列的分离第107-108页
     ·脂肪酶基因ln 在毕赤酵母中的表达第108页
  2 结果与分析第108-118页
   ·脂肪酶LN 成熟肽基因序列的酶切位点分析和扩增第108-109页
   ·脂肪酶基因ln 在毕赤酵母中的表达第109-118页
     ·酵母表达载体的构建和鉴定第109-111页
     ·重组酵母表达质粒pPIC9K/ln 转化 Pichia pastoris GS115 及酵母转化子的筛选第111页
     ·疏棉状嗜热丝孢菌热稳定脂肪酶基因ln 在Pichia pastoris 中的高效表达及表达产物的检测第111-114页
       ·脂肪酶基因ln 在Pichia pastoris 中的诱导表达和高表达酵母菌株的筛选第111-112页
       ·脂肪酶酵母工程菌产酶曲线的测定第112页
       ·甲醇的体积分数对脂肪酶产量的影响第112页
       ·脂肪酶基因ln 表达产物的SDS-PAGE 检测第112-114页
     ·脂肪酶酵母工程菌的遗传稳定性分析第114页
     ·表达脂肪酶LN 的酶学性质研究第114-118页
       ·表达脂肪酶LN 的纯化第114-115页
       ·表达脂肪酶LN 的最适反应温度第115页
       ·表达脂肪酶LN 的最适反应pH 值第115-116页
       ·表达脂肪酶LN 的热稳定性第116页
       ·表达脂肪酶LN 的pH 稳定性第116-117页
       ·金属离子对表达脂肪酶LN 活性的影响第117-118页
  3 讨论第118-122页
   ·关于研究结果第118-119页
   ·关于表达系统第119-122页
第四章 结论和建议第122-124页
 1 结论第122-123页
 2 建议第123-124页
参考文献第124-135页
致谢第135-136页
攻读硕士期间发表论文和申请专利情况第136页

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