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上海地区副猪嗜血杆菌分子流行病学调查研究及基因组文库的构建

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
第一篇 文献综述第12-35页
 副猪嗜血杆菌研究进展第12-28页
  1 病原学第12页
  2 临床与病理学特征第12-13页
  3 流行病学第13-14页
  4 致病因素研究进展第14-19页
   ·荚膜多糖(CPS)第15页
   ·脂多糖(LPS)第15页
   ·脂寡糖(LOS)第15-16页
   ·外膜蛋白(OMP)第16页
   ·转铁结合蛋白(TBP)第16-17页
   ·神经氨酸酶(NA)第17页
   ·生物被膜(BF)第17-18页
   ·cAMP依赖性自然转化系统第18页
   ·其它第18-19页
  5. 分型学研究第19-23页
   ·血清学分型第19-20页
   ·分子生物学分型第20-23页
     ·外膜蛋白(OMP)指纹图谱法第20页
     ·多位点酶切电泳图谱法(MEE)第20-21页
     ·限制性内切酶酶切指纹图谱法(REF)第21页
     ·肠科杆菌基因间重复一致序列PCR(ERIC-PCR)第21页
     ·多位点序列分型法(MLST)第21-22页
     ·限制性片段长度多态性PCR分型法(RFLP-PCR)第22页
     ·随机扩增多态性DNA分型法(RAPD)第22页
     ·Hsp60分型法第22-23页
  6. 诊断方法研究进展第23-25页
   ·免疫组化法诊断第23页
   ·血清学诊断第23-24页
   ·分子生物学诊断第24-25页
     ·特异寡核苷酸捕获平板杂交(OSCPH)第24页
     ·原位杂交(ISH)第24页
     ·PCR第24-25页
  7. 预防与治疗研究进展第25-27页
   ·非免疫接种保护第25页
   ·免疫接种保护第25-26页
   ·药物预防与治疗第26-27页
  8. 总结与展望第27-28页
 参考文献第28-35页
第二篇 试验研究第35-86页
 第一章 副猪嗜血杆菌PCR诊断方法的建立与临床运用第35-43页
  1. 材料与方法第35-37页
   ·试验材料第35-36页
     ·菌株第35-36页
     ·主要试剂第36页
   ·方法第36-37页
     ·引物设计与合成第36页
     ·细菌基因组DNA的提取第36页
     ·PCR反应条件的摸索第36页
     ·特异性试验第36页
     ·敏感性试验第36页
     ·PCR的临床运用和序列测定与比对第36-37页
  2. 结果第37-39页
   ·PCR反应条件的优化第37页
   ·PCR特异性测定第37-38页
   ·PCR敏感性测定第38页
   ·PCR的临床运用和序列测定与比对第38-39页
  3. 讨论第39-40页
  参考文献第40-43页
 第二章 上海地区副猪嗜血杆菌的分离鉴定及血清学调查第43-60页
  1. 材料与方法第44-47页
   ·试验材料第44页
     ·菌株第44页
     ·主要试剂第44页
     ·主要仪器设备第44页
   ·方法第44-47页
     ·样品的采集及细菌的分离第44-45页
     ·形态学鉴定第45页
     ·培养特性鉴定第45-46页
     ·PCR检测第46页
     ·生化试验第46页
     ·药敏试验第46页
     ·兔抗标准血清的制备第46页
     ·琼脂扩散分型抗原的制备第46-47页
     ·琼脂扩散试验血清学分型第47页
  2 结果第47-50页
   ·分离菌的形态学特性第47-48页
   ·分离菌的培养特性第48页
   ·PCR检测结果第48-50页
   ·分离菌株的生化特性鉴定第50页
   ·药敏试验结果第50页
   ·分离菌株的血清型鉴别第50页
  3 讨论第50-52页
  参考文献第52-60页
 第三章 IRS-PCR在副猪嗜血杆菌基因分型研究中的应用第60-68页
  1. 材料与方法第61-62页
   ·试验材料第61页
     ·菌株第61页
     ·主要试剂第61页
   ·方法第61-62页
     ·引物的设计与合成第61页
     ·基因组DNA的制备第61页
     ·连接体的制备第61页
     ·双酶切及DNA连接第61-62页
     ·IRS-PCR第62页
     ·HPS分离株IRS-PCR及遗传相关性分析第62页
  2 结论第62-64页
   ·HPS IRS-PCR扩增结果第62-63页
   ·HPS分离株IRS-PCR遗传相关性分析第63-64页
  3. 讨论第64-66页
  参考文献第66-68页
 第四章 副猪嗜血杆菌基因组文库的构建及抗原肽的筛选第68-86页
  1. 材料与方法第69-73页
   ·试验材料第69页
     ·质粒和菌株第69页
     ·主要试剂第69页
     ·实验动物第69页
     ·仪器设备第69页
   ·方法第69-73页
     ·细菌基因组文库的建立第69-71页
     ·基因组文库的免疫学筛选第71-73页
  2. 结果第73-77页
   ·SH08-54P基因组的提取第73页
   ·最佳酶切条件的确定第73-74页
   ·载体质粒pUC18的准备第74页
   ·DNA酶切片段与载体重组及PCR鉴定第74-75页
   ·库容量确定第75页
   ·基因组文库的免疫学筛选第75-77页
     ·阳性克隆子的获得第75-76页
     ·阳性克隆子插入片段大小的鉴定第76-77页
     ·重组子插入片段核苷酸序列测定及同源性分析第77页
  3. 讨论第77-78页
  参考文献第78-86页
全文总结第86-88页
致谢第88-90页
攻读硕士学位期间发表的主要论文第90页

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