| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 目录 | 第8-10页 |
| 图目录 | 第10页 |
| 表目录 | 第10-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-17页 |
| ·复杂网络简介 | 第11-14页 |
| ·本文研究的主要对象 | 第14页 |
| ·本文研究的主要内容 | 第14-15页 |
| ·本文的组织结构 | 第15-17页 |
| 第二章 相关背景知识以及生物网络的子模块 | 第17-23页 |
| ·复杂疾病与生物网络 | 第17-20页 |
| ·基因调控网络 | 第18-19页 |
| ·蛋白质交互作用网络 | 第19页 |
| ·代谢网络 | 第19-20页 |
| ·生物网络的子结构和模块化性质 | 第20-21页 |
| ·小结 | 第21-23页 |
| 第三章 贪婪算法和蛋白质子网络搜索 | 第23-31页 |
| ·贪婪算法 | 第23-24页 |
| ·贪婪算法的基本原理 | 第23-24页 |
| ·结合基因芯片表达值的蛋白质子网络搜索 | 第24-28页 |
| ·数据来源 | 第25页 |
| ·算法实现 | 第25-27页 |
| ·实验结果 | 第27-28页 |
| ·实例分析 | 第28-29页 |
| ·小结 | 第29-31页 |
| 第四章 PageRank排序和特征值问题 | 第31-39页 |
| ·Google的PageRank技术概述 | 第31-34页 |
| ·网络搜索引擎和排序算法 | 第31-32页 |
| ·PageRank基本原理 | 第32-34页 |
| ·幂法及其实现方法 | 第34-36页 |
| ·幂法的计算方法 | 第34-35页 |
| ·幂法的实际计算公式 | 第35-36页 |
| ·幂法的计算步骤 | 第36页 |
| ·PageRank与Biomarker排序 | 第36-39页 |
| 第五章 基于IsoRank的交互组与表型组之间的网络比较 | 第39-51页 |
| ·IsoRank及其算法流程 | 第39-40页 |
| ·基于特征向量R的Bi-module搜索 | 第40-42页 |
| ·数据来源 | 第41页 |
| ·Bi-module搜索步骤 | 第41-42页 |
| ·结果分析 | 第42-50页 |
| ·人工模拟网络的结果验证 | 第42-44页 |
| ·蛋白质交互网和疾病表型网的网络比较结果分析 | 第44-50页 |
| ·总结 | 第50-51页 |
| 第六章 总结和讨论 | 第51-55页 |
| ·本文主要贡献 | 第51页 |
| ·不足和讨论 | 第51-52页 |
| ·研究展望 | 第52-55页 |
| 参考文献 | 第55-59页 |
| 附录 | 第59-61页 |
| 在读期间所发表论文 | 第61-63页 |
| 致谢 | 第63页 |