| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-33页 |
| ·引言 | 第13页 |
| ·大肠杆菌简介 | 第13-20页 |
| ·大肠杆菌的特性及种类 | 第13-14页 |
| ·大肠杆菌的抗原结构 | 第14页 |
| ·大肠杆菌的肠毒素 | 第14页 |
| ·大肠杆菌菌毛种类 | 第14-16页 |
| ·大肠杆菌的受体 | 第16页 |
| ·大肠杆菌的致病机理 | 第16-17页 |
| ·猪大肠杆菌性疾病 | 第17页 |
| ·仔猪大肠杆菌病的防治 | 第17-18页 |
| ·大肠杆菌腹泻病的分子抗病育种的可行性 | 第18-20页 |
| ·ETEC F4ac分子抗病育种 | 第18-19页 |
| ·ETEC F18分子抗病育种 | 第19-20页 |
| ·ETEC F41研究进展 | 第20-24页 |
| ·ETEC F41流行病学 | 第20页 |
| ·ETEC F41黏附素 | 第20-21页 |
| ·ETEC F41受体特性 | 第21页 |
| ·ETEC F41致病机理 | 第21页 |
| ·ETEC F41受体遗传学研究 | 第21-24页 |
| ·ETEC F41受体的全基因组连锁定位分析 | 第22-23页 |
| ·ETEC F41受体位置候选基因研究进展 | 第23-24页 |
| ·ST3GAL1基因研究进展 | 第23-24页 |
| ·ZFAT基因研究进展 | 第24页 |
| ·畜禽重要经济性状基因座的定位 | 第24-30页 |
| ·畜禽QTL定位的基本方法 | 第24-26页 |
| ·候选基因法 | 第25页 |
| ·标记-QTL连锁分析法 | 第25-26页 |
| ·QTL定位中所使用的模型和统计方法 | 第26页 |
| ·畜禽QTL精细定位 | 第26-28页 |
| ·增加标记密度 | 第26-27页 |
| ·扩大群体规模 | 第27页 |
| ·改变实验群体设计 | 第27-28页 |
| ·提高QTL精细定位的新策略 | 第28-30页 |
| ·传递不平衡检验(TDT)定位 | 第28-29页 |
| ·后裔同源相同IBD定位 | 第29页 |
| ·连锁不平衡-连锁(LDLA)定位 | 第29-30页 |
| ·选择性清除效应分析精细定位QTL | 第30页 |
| ·家畜重要经济性状基因定位的新策略-全基因组关联分析(GWAS) | 第30-32页 |
| ·全基因组关联分析(GWAS)的基本原理 | 第30-31页 |
| ·全基因组关联分析(GWAS)的应用 | 第31-32页 |
| ·GWAS在家畜单基因性状位点定位中的应用 | 第31页 |
| ·GWAS在家畜多基因控制的复杂性状位点定位中的应用 | 第31-32页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第32-33页 |
| ·本研究的目的 | 第32页 |
| ·本研究的意义 | 第32-33页 |
| 第二章 基于微卫星标记的猪4号染色体ETEC F41受体基因的精细定位 | 第33-47页 |
| ·引言 | 第33页 |
| ·材料与方法 | 第33-39页 |
| ·实验动物 | 第33-34页 |
| ·黏附表型判定 | 第34-35页 |
| ·实验菌株 | 第34页 |
| ·刷状缘的提取 | 第34页 |
| ·黏附实验 | 第34-35页 |
| ·基于微卫星标记的ETEC F41受体基因精细定位 | 第35页 |
| ·新增微卫星标记的选择 | 第35页 |
| ·微卫星标记的基因型检测 | 第35页 |
| ·总RNA的提取 | 第35-36页 |
| ·位置候选基因的空肠组织表达谱分析 | 第36-38页 |
| ·统计方法 | 第38-39页 |
| ·结果 | 第39-44页 |
| ·ETEC F41黏附表型分布 | 第39页 |
| ·微卫星标记基因型检测结果 | 第39-40页 |
| ·SSC4上微卫星标记遗传图谱 | 第40-41页 |
| ·ETEC F41受体基因精细定位结果 | 第41-43页 |
| ·总RNA提取结果 | 第43-44页 |
| ·六个位置候选基因的组织表达谱分析 | 第44页 |
| ·分析与讨论 | 第44-46页 |
| ·小结 | 第46-47页 |
| 第三章 利用全基因组高通量SNP标记精细定位ETEC F41受体基因 | 第47-59页 |
| ·引言 | 第47页 |
| ·材料与方法 | 第47-50页 |
| ·实验动物 | 第47页 |
| ·全基因组芯片扫描 | 第47-48页 |
| ·突变位点的基因分型 | 第48-50页 |
| ·统计分析 | 第50页 |
| ·全基因组关联分析 | 第50页 |
| ·远缘群体中3个多态位点与ETEC F41黏附表型的关联性分析 | 第50页 |
| ·结果 | 第50-56页 |
| ·ETEC F41黏附表型分布 | 第50-51页 |
| ·ETEC F41受体基因全基因组关联分析结果 | 第51-53页 |
| ·资源群体强关联位点在远缘群体中基因型检测结果 | 第53页 |
| ·目的标记位点在远缘群体中与ETEC F41黏附表型的关联性 | 第53-54页 |
| ·目的标记位点的连锁不平衡(LD)分析 | 第54-56页 |
| ·分析与讨论 | 第56-58页 |
| ·关于ETEC F41黏附表型在远缘群体中的分布 | 第56页 |
| ·关于ETEC F41受体基因全基因组关联分析 | 第56-57页 |
| ·关于远缘群体中3个目的标记与ETEC F41黏附表型的关联分析 | 第57-58页 |
| ·小结 | 第58-59页 |
| 第四章 位置候选基因ST3GAL1的分离及其与ETEC F41易感性的关联性研究 | 第59-74页 |
| ·引言 | 第59页 |
| ·材料与方法 | 第59-63页 |
| ·实验动物 | 第59页 |
| ·ST3GAL1基因全长cDNA的分离 | 第59-61页 |
| ·ST3GAL1基因多态位点的鉴别及基因分型 | 第61-62页 |
| ·ST3GAL1基因多态位点的鉴别 | 第61页 |
| ·ST3GAL1基因多态位点的基因分型 | 第61-62页 |
| ·统计分析 | 第62-63页 |
| ·结果 | 第63-71页 |
| ·ETECF41黏附表型分布 | 第63页 |
| ·ST3GAL1基因全长cDNA | 第63-65页 |
| ·ST3GAL1基因多态位点的鉴别 | 第65-67页 |
| ·ST3GAL1基因多态位点的检测 | 第67-68页 |
| ·c.284T>A和c.477C>T多态位点的检测结果 | 第67页 |
| ·c.661A>G多态位点的检测结果 | 第67-68页 |
| ·统计分析结果 | 第68-71页 |
| ·多态位点的连锁不平衡检测 | 第68-69页 |
| ·多态位点与ETEC F41黏附表型的关联性分析 | 第69-71页 |
| ·多态位点与资源群体ETEC F41黏附表型的关联性分析 | 第69-70页 |
| ·ST3GAL1基因2个多态位点与远缘群体ETEC F41黏附表型的关联性分析 | 第70-71页 |
| ·分析与讨论 | 第71-73页 |
| ·小结 | 第73-74页 |
| 第五章 位置候选基因ZFAT的分离及其与ETEC F41易感性的关联性研究 | 第74-92页 |
| ·引言 | 第74页 |
| ·材料与方法 | 第74-77页 |
| ·实验动物 | 第74页 |
| ·总RNA的提取 | 第74-75页 |
| ·ZFAT基因全长cDNA的分离 | 第75页 |
| ·ZFAT基因多态位点的鉴别及基因分型 | 第75-76页 |
| ·ZFAT基因多态位点的鉴别 | 第75页 |
| ·ZFAT基因多态位点的基因分型 | 第75-76页 |
| ·统计分析 | 第76-77页 |
| ·结果 | 第77-89页 |
| ·总RNA提取结果 | 第77-78页 |
| ·ZFAT基因全长cDNA | 第78-82页 |
| ·ZFAT基因多态位点的鉴别及多态性检测 | 第82-84页 |
| ·ZFAT基因多态位点的鉴别 | 第82-84页 |
| ·ZFAT基因多态位点的基因分型结果 | 第84页 |
| ·统计分析结果 | 第84-89页 |
| ·多态位点与ETEC F41黏附表型的关联性分析 | 第84-87页 |
| ·多态位点的连锁不平衡检测 | 第87-89页 |
| ·分析与讨论 | 第89-91页 |
| ·猪ZFAT基因的生物信息学分析 | 第89-90页 |
| ·ZFAT基因的多态位点与ETEC F41黏附表型的关联性分析 | 第90页 |
| ·种群间的连锁不平衡分析 | 第90-91页 |
| ·小结 | 第91-92页 |
| 全文总结与展望 | 第92-93页 |
| 参考文献 | 第93-106页 |
| 附录1 ST3GAL1基因组部分序列 | 第106-116页 |
| 附录2 ST3GAL1基因CDNA序列 | 第116-120页 |
| 附录3 ZFAT基因CDNA序列 | 第120-124页 |
| 附录4 博士研究生学习期间发表的论文情况 | 第124-125页 |
| 致谢 | 第125-126页 |
