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海岛棉染色体组特异重复序列的筛选及亚克隆分析

摘要第1-9页
Abstract第9-11页
缩略语表第11-12页
第一章:文献综述第12-28页
   ·重复序列的种类第12-17页
     ·串联重复序列第12-14页
       ·端粒重复序列(Telomeric Repeats)第12页
       ·核糖体RNA基因第12-13页
       ·着丝粒串联重复序列家族第13-14页
       ·亚端粒或臂间卫星DNA家族第14页
     ·散布重复序列第14-17页
       ·转座因子(transposable elements)第15页
       ·反转录因子(retroelements)第15-16页
       ·短散布核因子(SINEs)第16页
       ·其它散布重复序列第16-17页
   ·重复序列的功能与应用第17-19页
   ·重复序列的分离和克隆方法第19-21页
     ·超高速离心法第19页
     ·重复序列中单酶切位点的酶酶切基因组法第19-20页
     ·重复序列特异结合免疫蛋白法第20页
     ·BAC或其它文库筛选法第20-21页
   ·棉属中重复序列的研究概况第21-23页
     ·棉属植物基因组简介第21页
     ·棉花重复序列的同步进化第21-23页
       ·18S-26S rDNA的同步进化第22页
       ·5S rDNA的同步进化第22页
       ·基因组的同步进化第22-23页
   ·植物荧光原位杂交的原理及其发展第23-26页
     ·荧光原位杂交技术的原理第23页
     ·荧光原位杂交技术的发展第23-24页
     ·荧光原位杂交技术的分类第24-25页
     ·荧光原位杂交在植物研究中的应用第25-26页
   ·菌落原位杂交第26-27页
   ·本研究目的与意义第27-28页
第二章 材料与方法第28-39页
   ·实验材料第28-29页
     ·BAC文库第28页
     ·实验所用靶DNA第28-29页
     ·试剂第29页
   ·试验方法第29-39页
     ·DNA提取第29-31页
       ·Pima-90基因组DNA提取第29-30页
       ·BAC DNA提取第30-31页
     ·菌落原位杂交第31-33页
       ·高密度杂交膜的制备第31-32页
       ·探针的标记第32页
       ·Southern杂交第32-33页
     ·荧光原位杂交第33-35页
       ·体细胞染色体制片第33页
       ·探针的标记第33-34页
       ·原位杂交流程第34-35页
     ·亚克隆第35-37页
       ·BAC DNA部分酶切第35页
       ·目的DNA片段的试剂盒回收第35-36页
       ·回收产物的链接第36页
       ·连接产物的转化第36-37页
       ·重组克隆的分析第37页
       ·克隆的挑取和保存第37页
     ·阳性克隆的序列测定第37-39页
第三章 实验结果与分析第39-55页
   ·棉花重复序列的筛选及染色体定位第39-43页
     ·BAC文库的筛选及得到的阳性克隆第39-40页
     ·阳性单克隆的原位杂交第40-42页
     ·将428K20、412A11分别在A、D组棉上进行FISH验证第42-43页
   ·428K20、412A11亚克隆文库的构建与筛选第43-53页
     ·SAU3A Ⅰ最佳酶用量的确定和酶切片段的回收第44页
     ·连接与转化第44-45页
     ·亚克隆文库的检测第45页
     ·亚克隆文库的筛选第45-46页
     ·亚克隆的序列分析第46-53页
   ·以重复序列探针为基础海岛棉FISH核型分析第53-55页
第四章 讨论第55-59页
   ·四个阳性单克隆原位杂交结果的初步探讨第55页
   ·428K20与"基因组殖民化"的现象第55-57页
   ·412A11的亚克隆分析第57页
   ·关于实验方法的讨论第57-59页
第五章 结论第59-61页
参考文献第61-70页
致谢第70页

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