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双芳基酮还原酶立体选择性的半理性改造及蛋白结晶研究

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
第一章 绪论第9-21页
    1.1 手性化合物第9-11页
        1.1.1 手性的概念第9页
        1.1.2 手性药物第9页
        1.1.3 手性仲醇的作用及合成方法第9-10页
        1.1.4 (R/S)-(4-氯苯基)-(吡啶-2-基)-甲醇[(R/S)-CPMA]的研究进展第10-11页
    1.2 醇脱氢酶的简介第11-14页
        1.2.1 醇脱氢酶第11-12页
        1.2.2 短链醇脱氢酶的一般结构性质第12页
        1.2.3 短链醇脱氢酶的催化机制第12-13页
        1.2.4 醇脱氢酶不对称还原反应的立体选择性第13-14页
    1.3 醇脱氢酶的分子改造第14-16页
        1.3.1 定向进化第14-15页
        1.3.2 理性设计第15页
        1.3.3 半理性设计第15-16页
    1.4 蛋白质的结晶及结构解析第16-18页
        1.4.1 X射线衍射的原理第16-17页
        1.4.2 蛋白质的结晶过程及方法第17-18页
        1.4.3 相位的确定第18页
    1.5 本论文的研究意义和主要研究内容第18-21页
        1.5.1 课题来源第18页
        1.5.2 本课题的研究意义与研究背景第18-19页
        1.5.3 本论文的主要研究内容第19-21页
第二章 材料与方法第21-35页
    2.1 实验材料第21-23页
        2.1.1 实验试剂及来源第21-22页
        2.1.2 实验器材及来源第22页
        2.1.3 实验所用引物第22-23页
        2.1.4 主要培养基第23页
    2.2 分析方法第23-25页
        2.2.1 酶活力的测定方法第23页
        2.2.2 蛋白含量测定第23-24页
        2.2.3 SDS-PAGE电泳分析第24页
        2.2.4 液相色谱(HPLC)检测法第24页
        2.2.5 气相色谱(GC)检测法第24-25页
    2.3 实验方法第25-35页
        2.3.1 HCSM饱和突变库的构建第25-26页
        2.3.2 定点突变菌株的构建第26页
        2.3.3 组合突变文库的构建第26-27页
        2.3.4 通量筛选方法第27页
        2.3.5 目的蛋白的过表达第27-28页
        2.3.6 KpADH蛋白纯化第28页
        2.3.7 KpADH突变体动力学参数测定第28-29页
        2.3.8 底物谱分析第29-30页
        2.3.9 冻干酶粉制备(R)-CPMA第30-31页
        2.3.10 KpADHC端His-Tag切除第31页
        2.3.11 KpADH结晶蛋白的制备与纯化第31-32页
        2.3.12 KpADH晶体筛选与优化第32-33页
        2.3.13 KpADH晶体数据收集第33页
        2.3.14 KpADH晶体数据处理及解析第33页
        2.3.15 蛋白结构与底物分子对接第33-35页
第三章 结果与讨论第35-63页
    3.1 HCSM策略提高醇脱氢酶KpADH的对映选择性第35-42页
        3.1.1 HCSM文库的建立第35-36页
        3.1.2 HCSM文库的筛选第36-37页
        3.1.3 KpADH突变体纯化第37-38页
        3.1.4 动力学分析第38-39页
        3.1.5 底物谱分析第39-40页
        3.1.6 突变体50C10冻干酶粉制备(R)-CPMA第40-42页
    3.2 Glu214和Ser237位点研究第42-51页
        3.2.1 KpADH单点突变体的构建第42页
        3.2.2 KpADH单点突变体催化性质和立体选择性分析第42-45页
        3.2.3 KpADH单点突变体动力学参数第45-47页
        3.2.4 KpADH214和237位点组合突变文库的建立第47页
        3.2.5 KpADH214和237位点组合突变文库的筛选第47-48页
        3.2.6 KpADH最优双突变体的表征第48-49页
        3.2.7 KpADH最优双突变体的底物特异性第49-50页
        3.2.8 KpADH最优突变体对不同底物选择性比较第50-51页
    3.3 KpADH蛋白结晶及结构解析第51-57页
        3.3.1 KpADHC端His-Tag切除第51-52页
        3.3.2 KpADH结晶蛋白制备第52-53页
        3.3.3 KpADH蛋白结晶初筛第53-55页
        3.3.4 KpADH蛋白结晶优化第55页
        3.3.5 KpADH晶体衍射数据收集第55-56页
        3.3.6 KpADH晶体结构解析第56-57页
    3.4 KpADH的晶体结构分析第57-63页
        3.4.1 KpADH的整体结构第57页
        3.4.2 KpADH的结构比较第57-59页
        3.4.3 KpADH的辅酶结合中心第59-60页
        3.4.4 KpADH的催化中心第60-61页
        3.4.5 分子模型解释手性识别机制第61-63页
主要结论与展望第63-65页
    主要结论第63-64页
    工作展望第64-65页
致谢第65-66页
参考文献第66-71页
附录1:HCSM建库引用的引物第71-72页
附录2:定点突变引用的引物第72-73页
附录3:最优突变体组合突变引物和混合质粒第73-74页
附录4:KpADH突变体蛋白纯化SDS-PAGE分析图第74-75页
附录5:作者在攻读硕士学位期间发表的论文第75页

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