摘要 | 第5-6页 |
abstract | 第6页 |
第一章 引言 | 第10-16页 |
1.1 激发子研究现状 | 第10-12页 |
1.1.1 激发子定义、分类和功能 | 第10-11页 |
1.1.2 激发子受体研究现状 | 第11-12页 |
1.2 蛋白互作研究方法 | 第12-14页 |
1.2.1 体内互作研究方法 | 第12-13页 |
1.2.2 体外互作研究方法 | 第13-14页 |
1.3 蛋白真核表达途径 | 第14页 |
1.4 转录组测序技术概述 | 第14页 |
1.5 苯丙氨酸途径和异黄酮对植物抗病功能的研究概述 | 第14-15页 |
1.6 本研究的目的和意义 | 第15-16页 |
第二章 MoHrip2的真核表达及纯化 | 第16-22页 |
2.1 材料与方法 | 第16-19页 |
2.1.1 材料 | 第16页 |
2.1.2 方法 | 第16-19页 |
2.2 结果 | 第19-21页 |
2.2.1 MoHrip2基因克隆和真核表达载体构建 | 第19页 |
2.2.2 电转酵母及培养及蛋白诱导、收集纯化 | 第19-20页 |
2.2.3 蛋白SDS-PAGE和western-blot鉴定 | 第20页 |
2.2.4 MoHrip2真核表达蛋白的活性测定 | 第20-21页 |
2.3 讨论 | 第21-22页 |
第三章 转录组测序 | 第22-42页 |
3.1 实验材料 | 第22页 |
3.2 实验方法 | 第22-27页 |
3.2.1 水稻样品的准备 | 第22页 |
3.2.2 RNA提取和质量检测 | 第22-23页 |
3.2.3 文库构建及测序 | 第23-24页 |
3.2.4 测序数据的过滤和质量控制(QC) | 第24-25页 |
3.2.5 基因表达定量分析 | 第25页 |
3.2.6 差异基因的筛选:NOISeq法 | 第25页 |
3.2.7 差异基因GO分析 | 第25-26页 |
3.2.8 差异基因Pathway分析 | 第26页 |
3.2.9 差异基因的转录因子分析(适用于植物) | 第26-27页 |
3.3 实验结果与分析 | 第27-38页 |
3.3.1 水稻样品的RNA质量检测 | 第27-28页 |
3.3.2 RNA-SEQ测序数据过滤和质控 | 第28-30页 |
3.3.3 测序饱和度和reads随机性 | 第30-32页 |
3.3.4 基因表达水平分析 | 第32-33页 |
3.3.5 基因维恩图 | 第33-34页 |
3.3.6 差异基因分析 | 第34-35页 |
3.3.7 差异基因聚类分析 | 第35-38页 |
3.4 差异基因功能显著性富集分析 | 第38-41页 |
3.4.1 GO富集分析 | 第38-40页 |
3.4.2 KEGG Pathway显著性富集分析 | 第40-41页 |
3.5 讨论 | 第41-42页 |
第四章 转录因子与抗病基因定量检测 | 第42-52页 |
4.1 试验材料、试剂、仪器 | 第42页 |
4.2 试验方法 | 第42-44页 |
4.2.1 水稻RNA提取 | 第42页 |
4.2.2 cDNA的合成 | 第42-43页 |
4.2.3 荧光定量PCR | 第43页 |
4.2.5 MoHrip2处理后水稻中水杨酸含量的检测方法 | 第43-44页 |
4.3 实验结果与分析 | 第44-51页 |
4.3.1 荧光定量验证黄酮途径相关基因的表达 | 第44-46页 |
4.3.2 荧光定量检测关键转录因子和特异性基因的表达 | 第46-50页 |
4.3.3 MoHrip2处理后水稻中水杨酸浓度的测定 | 第50-51页 |
4.4 讨论 | 第51-52页 |
第五章 MoHrip2在水稻中互作蛋白的鉴定和验证 | 第52-57页 |
5.1 实验材料 | 第52-53页 |
5.1.1 菌株和质粒 | 第52页 |
5.1.2 实验试剂和耗材 | 第52页 |
5.1.3 培养基与试剂配方 | 第52-53页 |
5.2 实验方法 | 第53-54页 |
5.2.1 OsOlp的生物信息学分析 | 第53页 |
5.2.2 酵母双杂交 | 第53-54页 |
5.3 实验结果 | 第54-55页 |
5.3.1 生物信息分析结果 | 第54-55页 |
5.3.2 酵母双杂交结果 | 第55页 |
5.4 讨论 | 第55-57页 |
第六章 全文总结 | 第57-58页 |
参考文献 | 第58-64页 |
致谢 | 第64-65页 |
作者简历 | 第65页 |