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基于大鼠脑出血高通量测序的miRNA表达谱生物信息学分析

摘要第3-5页
abstract第5-6页
中英文缩略词表第10-11页
第1章 引言第11-14页
    1.1 脑出血后继发的炎性损伤第11页
    1.2 miRNA的生物特性第11-12页
    1.3 miRNA与脑出血第12-14页
第2章 材料与仪器第14-16页
    2.1 材料第14-15页
        2.1.1 动物第14页
        2.1.2 主要试剂第14-15页
    2.2 主要仪器第15-16页
第3章 实验方法第16-23页
    3.1 大鼠脑出血模型建立及鉴定第16-17页
    3.2 测序文库的建立第17-18页
        3.2.1 样品组织的获取及RNA的制备第17页
        3.2.2 样品RNA纯度和浓度的检测第17-18页
        3.2.3 测序文库构建及序列测定第18页
    3.3 RT-PCR第18-20页
        3.3.1 样品的制备第18页
        3.3.2 RNA浓度及纯度的检测第18-19页
        3.3.3 荧光定量PCR实验步骤第19-20页
    3.4 生物信息学分析流程第20-21页
    3.5 PPI网络图流程第21页
    3.6 荧光素酶实验报告第21-22页
    3.7 统计学处理第22-23页
第4章 结果第23-32页
    4.1 大鼠脑出血模型的鉴定第23页
    4.2 RNA浓度及纯度的检测第23-24页
    4.3 脑出血灶周组织小RNA测序的数据分析第24-27页
        4.3.1 小RNA测序数据的质量鉴定第24-25页
        4.3.2 小RNA序列中已知miRNA和基因信息的注释和统计第25页
        4.3.3 动物miRNA文库建立第25-26页
        4.3.4 RT-PCR验证测序结果第26-27页
    4.4 新的候选miRNA预测和鉴定第27页
    4.5 GO和KEGG通路分析第27-29页
    4.6 Protein-Protein Interactions第29页
    4.7 荧光素酶检测报告第29-32页
第5章 讨论第32-35页
    5.1 miRNA-21与哺乳动物第32-33页
    5.2 miRNA与DUSP8和FASLG第33-34页
    5.3 mir-21和脑出血第34-35页
第6章 结论与展望第35-36页
    6.1 全文总结第35页
    6.2 不足之处与展望第35-36页
致谢第36-37页
参考文献第37-40页
附录第40-41页
    本研究资助项目第40-41页
攻读学位期间的研究成果第41-42页
综述第42-47页
    参考文献第45-47页

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