| 摘要 | 第3-4页 |
| ABSTRACT | 第4页 |
| 第一章 背景介绍 | 第7-21页 |
| 1.1 丙型肝炎的生物学介绍 | 第7-9页 |
| 1.1.1 丙型肝炎病毒的认识过程及发展 | 第7-8页 |
| 1.1.2 抗丙型肝炎药物的研究进展 | 第8-9页 |
| 1.2 HCV NS3/4A 丝氨酸蛋白酶结构特点及功能 | 第9-10页 |
| 1.3 HCV NS3/4A 丝氨酸蛋白酶抑制剂和耐药位点及机制研究 | 第10-14页 |
| 1.3.1 HCV NS3/4A 丝氨酸蛋白酶抑制剂 | 第10-11页 |
| 1.3.2 HCV NS3/4A 酶抑制剂的耐药位点及耐药机制研究 | 第11-14页 |
| 1.4 分子动力模拟 | 第14-21页 |
| 1.4.1 分子力学 | 第16-17页 |
| 1.4.2 分子力场 | 第17-18页 |
| 1.4.3 分子动力学模拟 | 第18-19页 |
| 1.4.4 Amber 软件介绍 | 第19-21页 |
| 第二章 实验方法 | 第21-27页 |
| 2.1 体系模型的构建 | 第22-23页 |
| 2.2 计算方法 | 第23-27页 |
| 2.2.1 分子动力学过程 | 第23-24页 |
| 2.2.2 自由能计算 | 第24-26页 |
| 2.2.3 能量分解 | 第26页 |
| 2.2.4 氢键及距离分析 | 第26-27页 |
| 第三章 耐药机制研究 | 第27-61页 |
| 3.1 野生型耐药机制研究 | 第28-33页 |
| 3.1.1 体系平衡状态的确定 | 第28-29页 |
| 3.1.2 体系总结合能分析 | 第29-30页 |
| 3.1.3 体系能量分解分析 | 第30-31页 |
| 3.1.4 体系氢键及盐键分析 | 第31-32页 |
| 3.1.5 讨论 | 第32-33页 |
| 3.2 R155Q/K 耐药机制研究 | 第33-44页 |
| 3.2.1 体系平衡状态的确定 | 第33-34页 |
| 3.2.2 体系总结合能分析 | 第34-36页 |
| 3.2.3 体系能量分解分析 | 第36-40页 |
| 3.2.4 体系氢键及盐键分析 | 第40-41页 |
| 3.2.5 讨论 | 第41-44页 |
| 3.3 A156V/T 耐药机制研究 | 第44-52页 |
| 3.3.1 体系平衡状态的确定 | 第44-45页 |
| 3.3.2 体系总结合能分析 | 第45-47页 |
| 3.3.3 体系能量分解分析 | 第47-50页 |
| 3.3.4 体系氢键及距离分析 | 第50-51页 |
| 3.3.5 讨论 | 第51-52页 |
| 3.4 D168A/G/V 耐药机制研究 | 第52-61页 |
| 3.4.1 体系平衡状态的确定 | 第52-53页 |
| 3.4.2 体系总结合能分析 | 第53-55页 |
| 3.4.3 体系能量分解分析 | 第55-56页 |
| 3.4.4 体系氢键及盐键分析 | 第56-59页 |
| 3.4.5 讨论 | 第59-61页 |
| 第四章 结论与展望 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-70页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第70-71页 |
| 附录 | 第71-76页 |
| 致谢 | 第76页 |
