| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第11-22页 |
| 1.1 猪苓概述 | 第11页 |
| 1.2 遗传标记 | 第11-12页 |
| 1.2.1 形态标记 | 第11-12页 |
| 1.2.2 细胞学标记 | 第12页 |
| 1.2.3 生化标记 | 第12页 |
| 1.2.4 分子标记 | 第12页 |
| 1.3 分子标记的类型及其特点 | 第12-15页 |
| 1.3.1 RFLP（Restriction fragment length polymorphism） | 第12-13页 |
| 1.3.2 RAPD（Random Amplified Polymorphism of DNA） | 第13页 |
| 1.3.3 AFLP（Amplified Fragment Length Polymorphism） | 第13-14页 |
| 1.3.4 SSR（Simple Sequence Repeats） | 第14页 |
| 1.3.5 ISSR（Inter-Simple Sequence Repeat） | 第14-15页 |
| 1.3.6 SNP（Single nucleotide polymorphism） | 第15页 |
| 1.4 EST-SSR 标记的建立与应用 | 第15-19页 |
| 1.4.1 EST-SSR标记的开发 | 第16-17页 |
| 1.4.2 SSR搜索工具 | 第17页 |
| 1.4.3 EST-SSR标记的应用 | 第17-19页 |
| 1.5 基因本体论（Gene Ontology，GO）注释概述 | 第19-20页 |
| 1.6 研究目标 | 第20页 |
| 1.7 主要研究内容 | 第20-21页 |
| 1.8 研究技术路线 | 第21-22页 |
| 第二章 多孔菌目 EST-SSR 位点信息分析 | 第22-36页 |
| 2.1 引言 | 第22页 |
| 2.2 材料与方法 | 第22-23页 |
| 2.2.1 多孔菌目（Polyporales）EST 序列的获得 | 第22页 |
| 2.2.2 EST 序列的处理 | 第22-23页 |
| 2.2.3 EST-SSR 位点的搜索 | 第23页 |
| 2.2.4 灵芝科 EST 序列的功能挖掘 | 第23页 |
| 2.3 结果与分析 | 第23-33页 |
| 2.3.1 EST 序列的获得 | 第23页 |
| 2.3.2 多孔菌目（Polyporales）EST-SSR 信息分析 | 第23-27页 |
| 2.3.3 伏革菌科（Coriolaceae）EST-SSR 信息分析 | 第27-29页 |
| 2.3.4 皱孔菌科（Meruliaceae）和多孔菌科（Polyporaceae）EST-SSR 信息分析 | 第29页 |
| 2.3.5 原毛平革菌科（Phanerochaetaceae）EST-SSR 信息分析 | 第29页 |
| 2.3.6 灵芝科（Ganodermataceae）EST-SSR 信息分析 | 第29-32页 |
| 2.3.7 灵芝科（Ganodermataceae）EST 序列的功能挖掘 | 第32-33页 |
| 2.4 讨论 | 第33-35页 |
| 2.5 结论 | 第35-36页 |
| 第三章 猪苓遗传多样性研究 | 第36-52页 |
| 3.1 引言 | 第36页 |
| 3.2 材料与方法 | 第36-40页 |
| 3.2.1 供试菌株 | 第36-37页 |
| 3.2.2 主要仪器与试剂 | 第37-38页 |
| 3.2.3 菌株培养 | 第38页 |
| 3.2.4 基因组 DNA 提取 | 第38-39页 |
| 3.2.5 引物设计 | 第39页 |
| 3.2.6 PCR 扩增 | 第39-40页 |
| 3.2.7 电泳检测 | 第40页 |
| 3.3 数据处理 | 第40-41页 |
| 3.3.1 电泳图谱处理 | 第40-41页 |
| 3.3.2 SSR 多态性评价 | 第41页 |
| 3.3.3 多态信息含量 | 第41页 |
| 3.3.4 亲缘聚类分析 | 第41页 |
| 3.3.5 主坐标分析 | 第41页 |
| 3.4 结果与分析 | 第41-48页 |
| 3.4.1 基因组 DNA 质量检测 | 第41-42页 |
| 3.4.2 EST-SSR 引物设计 | 第42-43页 |
| 3.4.3 EST-SSR 引物多态性分析 | 第43-46页 |
| 3.4.4 猪苓遗传多样性分析 | 第46-48页 |
| 3.5 讨论 | 第48-50页 |
| 3.5.1 影响猪苓 DNA 提取的因素 | 第48页 |
| 3.5.2 PCR 扩增产物的判读 | 第48-49页 |
| 3.5.3 EST-SSR 引物的通用性和多态性 | 第49-50页 |
| 3.5.4 猪苓的遗传多样性分析 | 第50页 |
| 3.6 结论 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 作者简介 | 第59页 |
