| 摘要 | 第10-12页 |
| Abstract | 第12-13页 |
| 第一章 绪论 | 第14-24页 |
| 第一节 病原微生物的分型现状 | 第15-18页 |
| 1.1 表型分型技术介绍 | 第15页 |
| 1.2 核酸指纹分型技术介绍 | 第15-18页 |
| 第二节 论文研究的目的、内容及意义 | 第18-20页 |
| 参考文献 | 第20-24页 |
| 第二章 沙门氏菌的基于熔解曲线的最小化多位点序列分型 | 第24-58页 |
| 第一节 基于熔解曲线的最小化多位点序列分型 | 第24-27页 |
| 1.1 minim McMLST技术的原理和流程 | 第24-26页 |
| 1.2 minim McMLST设计原则 | 第26-27页 |
| 1.3 Simpson's index of diversity | 第27页 |
| 第二节 沙门氏菌的简介 | 第27-29页 |
| 第三节 材料和方法 | 第29-37页 |
| 3.1 实验菌株 | 第29页 |
| 3.2 菌株培养和基因组DNA的提取 | 第29页 |
| 3.3 SNPs位点的筛选 | 第29-30页 |
| 3.4 探针和引物的设计 | 第30-34页 |
| 3.5 两管三重分型体系的建立 | 第34页 |
| 3.6 体系灵敏度 | 第34页 |
| 3.7 标本检测 | 第34页 |
| 3.8 标本测序验证 | 第34-35页 |
| 3.9 统计学分析 | 第35-37页 |
| 第四节 结果与分析 | 第37-51页 |
| 4.1 探针与靶序列的预杂交实验 | 第37页 |
| 4.2 两管三重分型体系的建立和优化 | 第37-43页 |
| 4.3 等位基因图谱 | 第43-44页 |
| 4.4 体系灵敏度 | 第44-45页 |
| 4.5 标本检测 | 第45-47页 |
| 4.6 标本测序验证 | 第47-49页 |
| 4.7 minim McMLST与MLST分型结果的比较 | 第49-51页 |
| 第五节 讨论 | 第51-54页 |
| 参考文献 | 第54-58页 |
| 第三章 金黄色葡萄球菌的基于熔解曲线的最小化多位点序列分型 | 第58-98页 |
| 第一节 金黄色葡萄球菌的简介 | 第58-60页 |
| 第二节 材料和方法 | 第60-68页 |
| 2.1 实验菌株 | 第60页 |
| 2.2 菌株培养和基因组DNA的提取 | 第60-61页 |
| 2.3 SNPs位点的筛选 | 第61页 |
| 2.4 探针和引物的设计 | 第61-65页 |
| 2.5 三管三重分型体系的建立 | 第65页 |
| 2.6 体系灵敏度 | 第65页 |
| 2.7 标本检测 | 第65页 |
| 2.8 标本测序验证 | 第65-66页 |
| 2.9 统计学分析 | 第66-68页 |
| 第三节 结果与分析 | 第68-91页 |
| 3.1 探针与靶序列的预杂交实验 | 第68-69页 |
| 3.2 三管三重分型体系的建立和优化 | 第69-70页 |
| 3.3 体系灵敏度 | 第70-83页 |
| 3.4 等位基因图谱 | 第83-84页 |
| 3.5 标本检测 | 第84-85页 |
| 3.6 标本测序验证 | 第85-88页 |
| 3.7 minim McMLST与MLST分型结果的比较 | 第88-91页 |
| 第四节 讨论 | 第91-93页 |
| 参考文献 | 第93-98页 |
| 英文缩写索引 | 第98-99页 |
| 致谢 | 第99-100页 |
