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耻垢分枝杆菌对SWU1噬菌体耐受机制的初探及其MSMEG3705基因功能研究

縮略词表第6-7页
摘要第7-9页
Abstract第9-11页
第1章 文献综述第12-23页
    1.1 细菌对噬菌体的耐受机制第12-18页
        1.1.1 吸附抑制第12-13页
        1.1.2 DNA注入抑制第13-14页
        1.1.3 限制修饰系统第14页
        1.1.4 CRISPR耐受机制第14-16页
        1.1.5 流产感染机制第16-18页
    1.2 分枝杆菌主要协助转运蛋白超(MFS)家族研究进展第18-23页
        1.2.1 MFS的类型和结构特征第18-19页
        1.2.2 MFS家族蛋白在分枝杆菌中的功能和分布第19-21页
        1.2.3 MFS编码基因的表达调节第21-22页
        1.2.4 研究分枝杆菌MFS的意义第22-23页
第2章 前言第23-24页
第3章 实验材料和方法第24-33页
    3.1 实验材料第24-26页
        3.1.1 实验菌株、质粒和引物第24-25页
        3.1.2 培养基和主要试剂第25-26页
        3.1.3 主要仪器第26页
    3.2 实验方法第26-33页
        3.2.1 TM4噬菌体筛选耻垢分枝杆菌转座子突变库第26-27页
        3.2.2 M12突变株对SWU1、L5、D29敏感性表型检测第27页
        3.2.3 M12突变株对SWU1、L5、D29成斑率(EOP)检测第27页
        3.2.4 SWU1基因组电转如M12和野生型耻垢分枝杆菌第27-28页
        3.2.5 透射电镜分析噬菌体吸附第28页
        3.2.6 野生耻垢分枝杆菌和M12单菌落形态比较第28页
        3.2.7 野生耻垢分枝杆菌和M12细胞壁脂肪酸成份分析第28-29页
        3.2.8 热不对称交错PCR(TAIL-PCR)鉴定转座子插入位点第29页
        3.2.9 验证转座子插入位点第29页
        3.2.10 构建敲除菌株第29-30页
        3.2.11 敲除菌株对TM4、SWU1的敏感性检测第30页
        3.2.12 回补MSMEG_3705基因突变第30页
        3.2.13 生长曲线测定第30页
        3.2.14 抗生素及其金属离子MIC测定第30页
        3.2.15 EB外排实验分析第30-31页
        3.2.16 总RNA提取和RT-PCR第31页
        3.2.17 耻垢分枝杆菌、M12突变株基因组的提取第31-32页
        3.2.18 噬菌体TM4/SWU1基因组提取第32页
        3.2.19 生物信息学分析第32-33页
第4章 结果与分析第33-45页
    4.1 M12转座子突变株对TM4、SWU1噬菌体耐受第33-34页
    4.2 成斑率(EOP)检测结果表明M12转座子突变株对TM4、SWU1耐受对D29、L5敏感第34页
    4.3 M12突变株对SWU1的耐受发生在噬菌体吸附或者DNA注入阶段第34-35页
    4.4 M12转座子插入突变菌株影响分枝杆菌噬菌体SWU1的吸附第35-36页
    4.5 M12转座子突变株与野生型耻垢分枝杆菌单菌落表型差异较大第36页
    4.6 M12细胞壁脂肪酸成份与野生耻垢分枝杆菌相比差异明显第36-37页
    4.7 TN5转座子插入耻垢分枝杆菌基因组MSMEG 3705基因中第37-38页
    4.8 MSMEG_3705敲除菌株对SWU1噬菌体敏感第38-40页
    4.9 MSMEG_3705生物信息学分析结果第40-41页
    4.10 耻垢分枝杆菌MSMEG_3705基因参与宿主对抗生素的外排第41-42页
    4.11 耻垢分枝杆菌MSMEG_3705基因在外排EB的中发挥着重要作用第42-43页
    4.12 MSMEG_3705基因缺失影响耻垢分枝杆菌生长速率第43-45页
第5章 结论与展望第45-48页
    5.1 实验结论第45-46页
    5.2 实验讨论第46-47页
    5.3 实验展望第47-48页
参考文献第48-53页
致谢第53-55页
在学期间完成的文章第55页

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